Семён Афана́сьевич Пусто́шкин (1759, Боровичский уезд, Новгородская губерния — 19 апреля [1 мая] 1846, Санкт-Петербург) — русский флотоводец, адмирал, сенатор, директор Николаевского штурманского училища.
Происходил из рода служилых дворян. Родился в селе Чернецово Новгородской губернии[1] 21 июля (1 августа) 1759 года[2], в семье корабельного мастера Афанасия Пустошкина.
Поступил 14 мая 1773 года в Морской кадетский шляхетский корпус в Кронштадте. В 1776 году был произведён в гардемарины и в том же году совершил первую кампанию на корабле «Ростислав», корабельную практику проходил на Балтике. С 1782 года — лейтенант. Плавал по Чёрному и Средиземному морям.
В 1786 году командовал фрегатом «Пчела». На корабле, замаскированном под купеческое судно, провёл разведку средиземноморских турецких портов. За успешное выполнение задания был произведён в капитан-лейтенанты.
Во время русско-турецкой войны 1878-1891 годов участвовал в отражении адмиралом Н. С. Мордвиновым нападения турок у Очакова.
В 1788 году командирован в местечко Кричев, Могилёвской губернии, где на канатной фабрике изучал производство; без отзыва из этой командировки был произведён в капитаны 2-го ранга (1791); пробыв в Кричеве более шести лет, был направлен в Херсон для обустройства в этом городе канатной фабрики по типу кричевской.