Сигма-фактор (σ-фактор) - это белок, необходимый для инициации транскрипции у бактерий.[1]Это бактериальный фактор инициации транскрипции, который обеспечивает специфическое связывание РНК-полимеразы (RNAP) с промоторами генов. Он гомологичен фактору транскрипции B у архей и эукариотическому фактору TFIIB.[2] Конкретный сигма-фактор, используемый для инициации транскрипции данного гена, будет варьироваться в зависимости от гена и от сигналов окружающей среды, необходимых для инициации транскрипции этого гена. Выбор промоторов с помощью РНК-полимеразы зависит от сигма-фактора, который ассоциируется с ним[3].
Сигма-фактор вместе с РНК-полимеразой известен как РНК-полимераза-холофермент. Каждая молекула холофермента РНК-полимеразы содержит ровно одну субъединицу сигма-фактора. Количество сигма-факторов различается у разных видов бактерий.[1][4] У кишечной палочки есть семь сигма-факторов. Сигма-факторы отличаются своим характерным молекулярным весом. Например, σ70 - это сигма-фактор с молекулярной массой 70 кДа.
Сигма-фактор в комплексе холофермента РНК-полимеразы необходим для инициации транскрипции, хотя, как только эта стадия заканчивается, он диссоциируется от комплекса, и РНК-полимераза продолжает элонгацию самостоятельно.
Различные сигма-факторы используются в разных условиях окружающей среды. Эти специализированные сигма-факторы связывают промоторы генов, соответствующие условиям окружающей среды, увеличивая транскрипцию этих генов.
Существуют также анти-сигма-факторы[англ.], которые ингибируют функцию сигма-факторов, и анти-анти-сигма-факторы, которые восстанавливают функцию сигма-фактора.
Единственным исключением из этой правила является сигма-фактор типа σ54. Белки, гомологичные σ54 (RpoN), являются функциональными сигма-факторами, но имеют существенно отличающиеся аминокислотные последовательности.