«Титан» основан в 1991 году. В 1991—1998 и 2000—2002 годах представлял Реутов, в 1999 — Железнодорожный, в 2003—2005 — Москву.
Лучшие результаты — 6-е место в зоне 3 второй лиги в 1992 году и 6-е место в зоне «Центр» во втором дивизионе в 2003 году. Самое крупное поражение — 0:7, в 1999 году в матче «Динамо» Брянск — «Титан» Железнодорожный.
В 2006 году название «Титан» получил бывший ФК «Клин».
25 августа 2018 года на 90-й минуте матча 20-го тура первенства III дивизиона в зоне «Московская область» против «Металлиста» из Королёва (1:7)[1][2] игрок «Титана» Аршен Цаголов[3] специально забил гол в собственные ворота (а ранее «заработал» пенальти в свои ворота)[4][5]. Такое поведение связывалось[кем?] со ставками в букмекерской конторе. В результате футболист получил красную карточку, перед этим толкнув игроков и главного тренера[6][7]. По итогам матча руководство клуба отчислило из команды Цаголова и ещё троих футболистов клуба[8][9].