Университет Павла Йозефа Шафарика в Кошице (словац. Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach) — высшее учебное заведение университетского типа. Назван в честь выдающегося слависта Павла Йозефа Шафарика.
Создан в 1959 году путём соединения Медицинского факультета Университета Коменского в Братиславе и Философского факультета (возникший как Философский факультет Высшей педагогической школы в Прешове). Считается преемником иезуитского Кошицкого университета.
В 1964 году Педагогический факультет, размещённый в Прешове, был включен в Университет Павла Йозефа Шафарика в Кошице.
В 1990 году в состав Университета были включены Православный богословский и Греко-католический богословский факультеты.
На основании Закона № 361/1996 Свода законов от 10 декабря 1996 года из Университета Павла Йозефа Шафарика в Кошицах был выделен Прешовский университет (в Прешове).