Образует муниципальное образование Чапаевское сельское поселение как единственный населённый пункт в его составе.
Село расположено на правом берегу Кубани, при впадении в неё правых притоков — Абазинки, Овечки и Жмурки. В южной части село непосредственно граничит с городом Черкесском. По южной и западной окраине проходит линия железной дороги от Черкесска, уходя затем на левый берег Кубани (остановочный пункт Псыж и далее к Невинномысской). На противоположном берегу реки, северо-западнее и западнее Чапаевского, находится село Садовое.
Основная часть села стоит в низменной пойме реки, ограниченной с востока возвышенным берегом. К югу участок поймы существенно расширяется (здесь на широкой равнине расположился Черкесск), к северу — сужается, за устьем Жмурки возвышенный берег почти вплотную подходит к реке. В этом месте на правобережье Кубани находится небольшой удалённый микрорайон Чапаевского размером в 3 улицы — ровно напротив села Садового, расположенного на левом берегу. Левый берег здесь и южнее порос лесом, в остальном крупная растительность в окрестностях села Чапаевского отсутствует[5].