Черниковка — историческая деревня Богородской волости Уфимского уезда[1][2][3], в 1931 году вошла в состав рабочего посёлка Черниковка города Уфы[4].
По одной версии, названа по имени владельца, которому принадлежала деревня — капитана Ивана Черникова, удостоившемуся земельных наделов за верную царскую службу. По другой версии название восходит к селению Черниково (конец XVI века), названному так в честь помощника воеводы Михаила Нагого, боярского сына Ивана Черникова-Онучина, уроженца Нижнего Новгорода, получившего здесь поместье[4].
Иван Черников прибыл из Москвы в Уфу в чине низших служилых чинов. Первый раз ему отвели землю при воеводе Годунове, примерно в 1607 году. Но книга об отводе земли потерялась. Иван Черников служил дозорным, то есть осуществлял отвод земельных участков горожанам, проверял размеры налогового оклада и платежеспособность населения.
В 1609 году по государственному Указу и по приказу воеводы М. В. Годунова за сибирскую службу дали поля близ реки Шугуровки С. Аничкову в собственность. Так началось освоение «дикого поля» на окраине строящегося города-крепости Уфы. Поселенные русские крестьяне занимались земледелием. Селениям присваиваются имена их владельцев: Черниковка, Каловка, Аничково, Бонье и так далее.
В 1615 году Иван Черников подал челобитную царю с просьбой подтвердить ему старый отвод и заново оформить это документально в новой книге. Такое оформление состоялось. В 1615 году Иван Черников выхлопотал себе ещё дополнительно 500 четей[5].
По состоянию на 1877 год деревня имела 12 дворов, и население в 56 человек (28 мужчин и 28 женщин). Деревня находилась в 11 вёрстах от Уфы[7].