Младший сын графа Эйтеля Фридриха II Гогенцоллерна (1452—1512) от брак с Магдаленой (1460—1496), единственной дочерью маркграфа Фридриха Бранденбургского.
Граф Эйтель Фридрих III был крупным советником и великим камергером императора Священной Римской империи Максимилиана I. Он, как и его отец, поддерживал хорошие отношения с Габсбургами. Он также являлся имперским обер-камергером и капитаном сеньории Хохенберг.
Граф Эйтель Фридрих Гогенцоллерн скончался в 1525 году в Павии. Возможно, он был отравлен. В Павии он служил капитаном полка ландскнехтов. Он был похоронен в Кафедральном соборе Павии.
В 1515 году Эйтель Фридрих Гогенцоллерн женился на Иоганне фон Виттем (ум. 1544), дочери Филиппа, господина Берсела и Баутерсема. Их дети: