bioRxiv (произносится как «био(а)рхи́в») — бесплатный электронный архив научных статей и препринтов по биологии, созданный в 2013 году сотрудниками Лаборатории в Колд-Спринг-Харбор Ричардом Севером и Джоном Инглисом по аналогу с уже набравшим популярность arXiv.org.
Авторы публикуют на bioRxiv ранее не рецензированные работы, чтобы получить фидбэк от других участников портала или утвердить первенство открытия. Перед публикацией рукописи не рецензируются, однако проходят первичную проверку модераторов на плагиат. Около 30 % авторов впоследствии размещают на портале отредактированные с учётом полученных комментариев версии. Большинство представленных на bioRxiv рукописей в результате публикуются в рецензируемых журналах.
BioRxiv был запущен на волне популярности онлайн-репозиториев препринтов, первым из которых стал созданный физиком из Лос-Аламосской национальной лаборатории Полом Гинспаргом в 1991 году портал ArXiv.org (произносится как [архи́в]). К моменту создания arXiv практика обмена препринтами в области физики была достаточно распространена — исследователи успешно рассылали друг другу свои неопубликованные отчёты об экспериментах или черновые версии статей до публикации в журнале. Такой обмен позволял не только получить комментарии и критику коллег перед рецензированием, но и предотвратить дублирование данных или закрепить первенство открытия[2][3]. Вскоре arXiv получил широкую популярность и к июлю 2021 года на сайте было размещено около 1,9 млн работ[4].
Изначально arXiv.org принимал работы исключительно в области физики, однако с повышением спроса и на другие отрасли наук, в 2003 году Гинспарг инициировал создание отдельной секции для загрузки препринтов по количественной биологии, включая биологическую статистику, биоинформатику, популяционную биологию. Одновременно с этим отдельный раздел для препринтов по биологии открыл и журнал открытого доступа PeerJ. Однако несмотря на растущую популярность этих секций в репозиториях (размещённые в arXiv работы по биологии впоследствии были опубликованы в Nature и PLOS Biology), порталы не стремились к дальнейшему расширению возможностей для публикаций работ в этой сфере[5][6].
В 2013 году молекулярный биолог Ричард Север из Лаборатории в Колд-Спринг-Харбор (CSHL) вместе с коллегой Джоном Инглисом запустили аналогичный arXiv портал под названием bioRxiv на основе хостинга HighWire[7][5]. BioRxiv был официально аффилирован с CSHL[8], а главными целями были заявлены ускорение процесса распространения знания и предоставления возможностей для получения критических комментариев и отзывов на ещё не опубликованные работы в области биологии[9]. Только за первый год работы на портал было загружено 800 препринтов[10], а всего за период с 2013 по 2016 год — около 3000 работ[11]. К 2019-му их количество увеличилось до 40 000[12]. На ноябрь 2021 года портал содержит данные о более чем 140 000 препринтов[13].