Кладу Chaoyangopteridae впервые определили в 2008 году Дэвид Анвин и Люй Цзюньчан как «Chaoyangopterus, Shenzhoupterus, их ближайший общий предок и все таксоны, более тесно связанные с этой кладой, чем с Tapejara, Tupuxuara или Quetzalcoatlus»[2]. На основании строения шеи и пропорций конечностей было высказано предположение, что они занимали экологическую нишу, аналогичную представителям надсемейства Azhdarchoidea[3], хотя, возможно, они были более специализированными, поскольку происходят от нескольких родов, в то время как Azhdarchoidea произошли от одного рода и из одного места. Чаояноптериды в основном известны из Азии, хотя один представитель семейства, Lacusovagus, обитал в Южной Америке[4], а также имеются вероятные остатки из Африки. Microtuban может продлить существование семейства до позднего мела[5].
Приведённая кладограмма отражает результат филогенетического анализа, проведённого палеонтологами Б. Андресом и Т. Майерсом в 2013 году[6].