Манга-журналы компании Square Enix обычно выпускаются под издательским лейблом Gangan (яп. ガンガン ганган, «звон»). Наиболее успешными франшизами Square Enix являются «Стальной алхимик» (всего продано 64 000 000 копий), Kuroshitsuji (20 000 000), Soul Eater (17 000 000), Mahojin Guru Guru (12 000 000), Hamerun no Baiorin Hiki (6 800 000)[1].
«Ежемесячный Shonen Gangan» (яп. 月刊少年ガンガン гэккан сёнэн ганган, «Ежемесячный сёнэн-Ганган») — ежемесячный журнал сёнэн-манги, который в 1991 году начала публиковать компания Enix (позднее объединившаяся в Square Enix). Он должен был стать конкурентам таким изданиям, как Shonen Magazine, Shonen Jump и Shonen Sunday, и направлен на ту же аудиторию — юношескую. Здесь появляется приключенческая, научно-фантастическая манга, манга в жанре фэнтези или основанная на видеоиграх.
«Ежемесячный GFantasy» (яп. 月刊Gファンタジー Гэккан дзи: фантадзи:, «Ежемесячный GФэнтези») или Gangan Fantasy («Ганган Фэнтези»), сокращенно GFan (Gファン) — ежемесячный журнал сёнэн-манги, принадлежащий компании Square Enix. Несколько ведущих авторов ушли после появления журнала для девушек Comic Zero-Sum[3]. В GFantasy печатались такие работы, как Devil Survivor 2: The Animation (автор Макото Уэдзу), E's (Сатору Юига), Gestalt (Юн Кога), I, Otaku: Struggle in Akihabara (Дзиро Судзуки), Nabari no Ou (Юки Каматани), «Сердца Пандоры» (Дзюн Мотидзуки), Pani Poni (Хэкиру Хикава), Gensomaden Saiyuki (Кадзуя Минэкура), Switch (naked ape), Yumekui Kenbun (Син Масиба), Zombie-Loan (Peach-Pit).
«Young Gangan» (яп. ヤングガンガン Янгу Ганган, «Молодой Ганган») — журнал сэйнэн-манги, публикующийся дважды в месяц компанией Square Enix[4]. Впервые был выпущен 3 декабря 2004 года. В Young Gangan публиковались такие работы, как Bamboo Blade (авторы — Агури Игараси, Масахиро Тоцука), Bitter Virgin (Кэй Кусуноки), Kurokami (Далл Ён Лим), Hanamaru Kindergarten (Юто), Hohzuki Island (Самбэ Кэй), Jackals (Синъя Мурата), Manhole (Цуцуи Тэцуя), Mononoke (Нинагава Яэко), Sumomomo Momomo (Синобу Отака).
Gangan Online (яп. ガンガンオンライン Gangan Onrain) — бесплатный онлайн-журнал манги и лайт-новел, существующий с 2 октября 2008 года.
«Ежемесячный Gangan Joker» (яп. 月刊ガンガンJOKER гэккан ганган дзё:ка:, Gekkan Gangan Joker) — ежемесячный журнал сёнэн-манги. Первый выпуск был опубликован 22 апреля 2009 года. Журнал проводит свой собственный конкурс манги «Гранпри J1» (яп. J1グランプリ J1 гурампури).