Газета определяя себя как коммунистическая, не принадлежит какой-либо политической партии. Была основана в качестве ежемесячной в 1969 году коллективом исключённых из ИКП леворадикальных публицистов (Лючио Магри, Россана Россанда и других), сложившимся на волне подъёма критического мышления и радикальных выступлений 1968—1969 годов. В 1970 году стала ежедневной.
Хотя «Манифесто» была ближе к Партии пролетарского единства (часть редакции напрямую являлась членами этой партии) и Пролетарской демократии, выступая с критикой официальной линии Итальянской коммунистической партии (ИКП), но среди её подписчиков были многочисленные сторонники компартии, видевшие в ней живую и независимую альтернативу официальному партийному органу «L'Unità». После самороспуска ИКП в 1991 году газета осталась на коммунистических позициях, сходных с Партией коммунистического возрождения.
«Манифесто» получила известность за свои едкие саркастические заголовки, иронические подписи к фотографиям и политические карикатуры.
Репортёр газеты Джулиана Сгрена, работавшая в Ираке, была похищена местными повстанцами в феврале 2005 года и освобождена 4 марта. Вокруг дальнейших событий разгорелся крупный политический скандал — машина, на которой итальянские разведчики вывозили освобождённую журналистку, была обстреляна американскими войсками. Сотрудник военной разведки SISMI Никола Калипари[англ.] погиб, заслонив собой Джулиану Сгрена[2].