Сезон закончился, когда « Баффало Биллз» победили « Сан-Диего Чарджерс » в игре чемпионата AFL. В следующем сезоне AFL присоединится к NFL , чтобы сформировать игру чемпионата мира AFL-NFL, известную сегодня как Суперкубок .
В AFL было 8 команд, сгруппированных в два дивизиона. Каждая команда будет играть дома и в гостях против других 7 команд лиги, всего 14 игр, а лучшая команда Восточного дивизиона будет играть против лучшей команды Западного дивизиона в игре чемпионата. Если в турнирной таблице на вершине любого дивизиона была ничья, для определения победителя дивизиона проводился плей-офф с одной игрой.
В 1965 году ни в одной из гонок дивизиона AFL не было драмы. «Биллы» лидировали в Восточном дивизионе от начала до конца, закончив пять игр впереди «Джетс» со счетом 5–8–1. В Западном дивизионе у Сан-Диего три потенциальных победы были отменены, когда они сыграли вничью с Канзас-Сити (10–10), Бостоном (13–13) и Баффало (20–20), но их финиш 9–2–3 (. 818) значительно опередил рекорд Окленда 8–5–1 (0,615).