Сезон Первой лиги Армении 2006 года начался 1 мая 2006 года. Последние матчи были сыграны 24 октября 2006 года. «Пюник-2» стал чемпионом лиги, но, поскольку является резервной командой, не смог перейти в Премьер-лигу Армении . В результате команда Лернаин Арцах , занявшая второе место, получила повышение. Из-за того, что «Бананц-2» и « Арарат-2 » заняли третье и четвертое места, команда «Динамо Ереван» , занявшая пятое место, сыграла в плей-офф повышения / понижения, который в итоге проиграл.