Аллохерпесвириды | |
---|---|
ПЭМ- микрофотография аллохерпесвируса 'Pilchard herpesvirus' | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Дуплоднавирия |
Королевство: | Heunggongvirae |
Тип: | Пепловирикота |
Учебный класс: | Herviviricetes |
Заказ: | Герпесвиралес |
Семья: | Аллохерпесвириды |
Роды | |
См. Текст |
Alloherpesviridae - это семейство вирусов отряда Herpesvirales . В это семейство входят виды, поражающие рыб и земноводных. Филогенетические исследования подтвердили достоверность этого семейства и предполагают, что его можно разделить на две клады: одна состоит из вирусов от хозяев карповых и ангиллид, а другая - из вирусов от хозяев икталурид, лососевых, аципенсерид и ранид. [1] В настоящее время в этом семействе 13 видов, разделенных на четыре рода. Заболевание, связанное с этим семейством, включает болезнь канального сома. [2] [3]
Таксономия [ править ]
Семья Alloherpesviridae была основана в 2005 году.
Genera [ править ]
Семейство включает следующие четыре рода: [3]
Структура [ править ]
Вирусы у Alloherpesviridae имеют оболочку с икосаэдрической и сферической или плеоморфной геометрией и симметрией T = 16. Диаметр около 150-200 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 134–248 килобайт. [2]
Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
---|---|---|---|---|---|
Икталуривирус | Сферический плеоморфный | Т = 16 | Окутанный | Круговой | Одночастный |
Cyprinivirus | Сферический плеоморфный | Т = 16 | Окутанный | Линейный | Одночастный |
Батраховирус | Сферический плеоморфный | Т = 16 | Окутанный | Линейный | Одночастный |
Сальмонивирус | Сферический плеоморфный | Т = 16 | Окутанный | Линейный | Одночастный |
Жизненный цикл [ править ]
Репликация вируса является ядерной и лизогенной. Проникновение в хозяйскую клетку достигается прикреплением вирусных гликопротеинов к рецепторам хозяина, что опосредует эндоцитоз. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Рыба служит естественным хозяином. Пути передачи - пассивное распространение. [2]
Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Икталуривирус | Рыбы | Никто | Гликопротеины | Почкование | Ядро | Ядро | Пассивная диффузия |
Cyprinivirus | Пресноводный угорь | Никто | Гликопротеины | Почкование | Цитоплазма | Цитоплазма | Пассивная диффузия |
Батраховирус | Лягушки | Никто | Гликопротеины | Почкование | Цитоплазма | Цитоплазма | Пассивная диффузия |
Сальмонивирус | Лососевые | Никто | Гликопротеины | Почкование | Ядро | Ядро | Пассивная диффузия |
Геномика [ править ]
Секвенировано несколько геномов. [4] Герпесвирусы карповых 1, 2 и 3 (CyHV1, CyHV2 и CyHV3) вызывают заболевание у карпа, золотой рыбки и кои. Их геномы имеют размер 291144, 290304 и 295146 пар оснований. Общая организация, общая для всех трех, состоит из уникальной центральной области, окруженной прямым повторением на каждом конце. 137, 150 и 155 уникальных функциональных генов, кодирующих белок, присутствуют в уникальных областях: из них шесть, четыре и восемь дублируются в концевом повторе. Геномы имеют 120 ортологичных генов, расположенных в значительной степени коллинеарно. До 55 из этих последних генов также законсервированы у другого представителя Cyprinivirus ; Вирус ангуиллидного герпеса 1 . CyHV1, CyHV2 и CyHV3 имеют пять, шесть и пять семейств паралоговых генов.
Ссылки [ править ]
- ^ Waltzek TB, Kelley GO, Альфаро ME, Kurobe T, Дэвисон AJ, Хенрик RP (2009). «Филогенетические отношения в семействе Alloherpesviridae» . Дис. Акват. Орг . 84 (3): 179–94. DOI : 10,3354 / dao02023 . PMID 19565695 .
- ^ a b c «Вирусная зона» . ExPASy . Дата обращения 12 июня 2015 .
- ^ a b «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.» . talk.ictvonline.org . Международный комитет по таксономии вирусов . Дата обращения 9 мая 2020 .
- ^ Дэвисон AJ, Куробе T, Gatherer D, Cunningham C, Korf I, Fukuda H, Hedrick RP, Waltzek TB (2013). «Сравнительная геномика герпесвирусов карпа» . J. Virol . 87 (5): 2908–22. DOI : 10,1128 / JVI.03206-12 . PMC 3571366 . PMID 23269803 .
Дальнейшее чтение [ править ]
- Иноуэ, Сага, Айкава, Кумагаи, Шимада, Кавагути, Нарусэ, Моришита, Кога, Такеда (2017). «Полное слияние транспозона и вируса герпеса создало мобильный элемент Teratorn в рыбе медака» . Nature Communications . 8 (1): 551. DOI : 10.1038 / s41467-017-00527-2 . PMC 5601938 . PMID 28916771 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
Внешние ссылки [ править ]
Викискладе есть медиафайлы по теме Alloherpesviridae . |
В Wikispecies есть информация, связанная с Alloherpesviridae . |
- Вирусная зона : Alloherpesviridae
- ICTV