Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Амира
Скриншот Amira с визуализацией Honeybee Brain visualization.png
Разработчики)Институт Цузе Берлин
Thermo Fisher Scientific
Первый выпускОктябрь 1999 г . ; 21 год назад ( 1999-10 )
Стабильный выпуск
2020.3 / февраль 2021 г . ; 2 месяца назад (2021-02)
Операционная системаWindows XP SP3 , Windows Vista , Windows 7
OS X 10.5 , OS X 10.6 , OS X 10.7
RHEL 5.5
ПлатформаIA-32 , x64
Доступно ванглийский
Тип3D визуализация и обработка данных
ЛицензияПробная версия
Веб-сайтthermofisher.com/amira-avizo

Amira (произносится: Ah-meer-ah) - программная платформа для трехмерной и четырехмерной визуализации, обработки и анализа данных. Он активно разрабатывается Thermo Fisher Scientific в сотрудничестве с Берлинским институтом Цузе (ZIB) и коммерчески распространяется компанией Thermo Fisher Scientific .

Обзор [ править ]

Amira [1] - это расширяемая программная система для научной визуализации , анализа данных и представления трехмерных и четырехмерных данных. Он используется тысячами исследователей и инженеров в научных кругах и в промышленности по всему миру. Его гибкий пользовательский интерфейс и модульная архитектура делают его универсальным инструментом для обработки и анализа данных из различных модальностей; например, микро-КТ , [2] ПЭТ , [3] Ультразвук . [4] Его постоянно расширяющиеся функциональные возможности сделали его универсальным решением для анализа и визуализации данных, применимым и используемым во многих областях, таких как микроскопия в биологии [5]и материаловедение , [6] молекулярная биология , [7] квантовая физика , [8] астрофизика , [9] вычислительная гидродинамика (CFD) , [10] моделирование методом конечных элементов (FEM) , [11] неразрушающий контроль (NDT). ) , [12] и многие другие. Одной из ключевых функций, помимо визуализации данных, является набор инструментов Amira для сегментации изображений [13] и восстановления геометрии . [14]Это позволяет пользователю отмечать (или сегментировать) структуры и интересующие области в объемах трехмерных изображений с помощью автоматических, полуавтоматических и ручных инструментов. Затем сегментация может использоваться для множества последующих задач, таких как объемный анализ, [4] анализ плотности, [15] анализ формы , [16] или создание трехмерных компьютерных моделей для визуализации , [17] численное моделирование , [ 18] или быстрое прототипирование [19] или 3D-печать , и это лишь некоторые из них. Другие ключевые особенности Amira - многоплоскостная и объемная визуализация, регистрация изображений., [20] нити копировальная, [21] разделение и анализ клеток, [16] тетраэдрической сетки поколения , [22] волоконно-слежения от тензора диффузии (DTI) данных, [23] скелетирование , [24] пространственный анализ графика, и стереоскопическая визуализация [25] 3D-данных на нескольких дисплеях и в иммерсивных средах виртуальной реальности, включая CAVE . [26] В качестве коммерческого продукта Amira требует покупки лицензии или академической подписки. Ограниченная по времени, но полнофункциональная ознакомительная версия доступна для бесплатной загрузки.

История [ править ]

1993–1998: Исследовательское программное обеспечение [ править ]

Корни Амиры уходят корнями в 1993 год и в отдел научной визуализации, возглавляемый Хансом-Кристианом Хеге, в Берлинском институте Цузе (ZIB) . ZIB - это научно-исследовательский институт математики и информатики . Миссия отдела научной визуализации - помогать решать сложные вычислительные и научные задачи в медицине , биологии , инженерии и материаловедении . С этой целью он разрабатывает алгоритмы и программное обеспечение для визуализации данных 2D, 3D и 4D, а также исследования и анализа с визуальной поддержкой. В то время у молодой группы визуализации в ZIB был опыт работы с расширяемыми, ориентированными на потоки даннымисреды визуализации apE, [27] IRIS Explorer, [28] и Advanced Visualization Studio (AVS) , но не был удовлетворен интерактивностью , гибкостью и простотой использования этих продуктов для не компьютерных ученых.

Поэтому разработка новой системы программного обеспечения была начата в исследовательском проекте [29] в рамках междисциплинарного центра совместных исследований, ориентированного на медицину. [30] Основываясь на опыте, полученном Тобиасом Хёллерером в конце 1993 года с новой графической библиотекой IRIS Inventor , [31] было решено использовать эту библиотеку. Разработкой системы медицинского планирования занимался Детлев Столлинг, который впоследствии стал главным архитектором программного обеспечения Amira. Новое программное обеспечение было названо «HyperPlan», что подчеркивало его первоначальное целевое приложение - систему планирования лечения гипертермического рака . Система разрабатывалась на Silicon Graphics (SGI).компьютеры, которые в то время были стандартными рабочими станциями, используемыми для высокопроизводительных графических вычислений. Программное обеспечение было основано на таких библиотеках, как OpenGL (первоначально IRIS GL ), Open Inventor (первоначально IRIS Inventor ) и библиотеках графического пользовательского интерфейса X11 , Motif (программное обеспечение) и ViewKit . В 1998 году X11 / Motif / Viewkit были заменены инструментарием Qt .

Фреймворк HyperPlan служил основой для все большего количества проектов в ZIB и использовался все большим числом исследователей в сотрудничающих учреждениях. Проекты включали приложения в области обработки медицинских изображений, медицинской визуализации , нейробиологии , конфокальной микроскопии , визуализации потоков , молекулярной аналитики и вычислительной астрофизики .

1998 – настоящее время: коммерчески поддерживаемый продукт [ править ]

Растущее число пользователей системы начало превышать возможности, которые ZIB мог выделить для распространения и поддержки программного обеспечения, поскольку основной задачей ZIB было алгоритмическое исследование. Таким образом, дочерняя компания Indeed - Visual Concepts GmbH была основана Хансом-Кристианом Хеге, Детлевом Сталлингом и Мальте Вестерхофф с целью сделать широкие возможности программного обеспечения доступными для исследователей в промышленности и научных кругах по всему миру и предоставить продукт поддержка и надежность, необходимые в сегодняшнем быстро меняющемся и конкурентном мире.

В феврале 1998 года программному обеспечению HyperPlan было присвоено новое, не зависящее от приложений, имя « Amira ». Это имя не является аббревиатурой, но было выбрано из-за того, что его можно произносить на разных языках и давать подходящую коннотацию, а именно «смотреть» или «удивляться» от латинского глагола «admirare» (восхищаться), который отражает базовая ситуация в визуализации данных.

Детлев Столлинг и Мальте Вестерхофф провели серьезную переработку программного обеспечения, чтобы сделать его коммерчески поддерживаемым продуктом, а также сделать его доступным на компьютерах сторонних производителей. В марте 1999 года первая версия коммерческого Amira была выставлена ​​на выставке CeBIT в Ганновере , Германия, на стендах SGI IRIX и Hewlett-Packard UniX (HP-UX) . Версии для Linux и Microsoft Windows последовали в течение следующих двенадцати месяцев. Позже была добавлена ​​поддержка Mac OS X. Действительно - Visual Concepts GmbH выбрала Бордо , Франция и Сан-Диего., Американская компания TGS, Inc. в качестве всемирного дистрибьютора Amira и завершила пять основных выпусков (до версии 3.1) в последующие четыре года.

В 2003 году Indeed - Visual Concepts GmbH, а также TGS, Inc. были приобретены компанией Mercury Computer Systems, Inc. из Массачусетса (NASDAQ: MRCY) и вошли в состав недавно созданного подразделения Mercury в области медико- биологических наук , позже получившего название Visage Imaging. В 2009 году компания Mercury Computer Systems, Inc. снова выделила Visage Imaging и продала ее компании Promedicus Ltd (ASX: PME), которая находится в Мельбурне , Австралия, ведущему поставщику информационных систем для радиологии и медицинских ИТ-решений. В это время Amira продолжала развиваться в Берлине., Германия и в тесном сотрудничестве с ZIB, который по-прежнему возглавляют первоначальные создатели Amira. Компания TGS, расположенная в Бордо, Франция, была продана компанией Mercury Computer systems французскому инвестору и переименована в Visualization Sciences Group (VSG). VSG продолжила работу над дополнительным продуктом под названием Avizo , основанным на том же исходном коде, но адаптированным для материаловедения.

В августе 2012 года FEI , на тот момент крупнейший OEM-реселлер Amira, приобрела VSG и бизнес Amira у Promedicus. Это вернуло двух программных сестер Амиру и Авизо в одни руки. В августе 2013 года Visualization Sciences Group (VSG) стала бизнес-единицей FEI. В 2016 году компания FEI была куплена компанией Thermo Fisher Scientific и в начале 2017 года стала частью ее подразделения анализа материалов и структур.

Amira и Avizo по-прежнему продаются как два разных продукта; Amira для наук о жизни и Avizo для материаловедения, но теперь усилия по разработке снова объединены. Между тем, количество научных статей, использующих программное обеспечение Amira / Avizo, составляет порядка 10 тысяч. Как и вначале, дорожная карта Amira по-прежнему основана на сложных научных вопросах, на которые пользователи Amira во всем мире пытаются ответить, часто на переднем крае в своих областях.

Параметры Amira [ править ]

Вариант микроскопии [ править ]

  • Специальные считыватели для данных микроскопии
  • Деконволюция изображения
  • Исследование трехмерных изображений, полученных практически с любого микроскопа
  • Извлечение и редактирование сетей волокон из микроскопических изображений

Считыватель DICOM [ править ]

  • Импорт клинических и доклинических данных в формате DICOM

Вариант сетки [ править ]

  • Создание трехмерных сеток конечных элементов (КЭ) из данных сегментированного изображения
  • Поддержка многих современных форматов решателей FE
  • Высококачественная визуализация результатов моделирования на основе сетки с использованием модулей отображения скалярных, векторных и тензорных полей.

Вариант скелетонизации [ править ]

  • Реконструкция и анализ нейронных и сосудистых сетей.
  • Визуализация каркасных сетей
  • Количественная оценка длины и диаметра сегментов сети
  • Упорядочивание сегментов в древовидном графе
  • Скелетонизация очень больших стопок изображений

Молекулярный вариант [ править ]

  • Расширенные инструменты для визуализации моделей молекул
  • Объемный рендеринг с аппаратным ускорением
  • Мощный редактор молекул
  • Специальные инструменты для сложной молекулярной визуализации

Вариант разработчика [ править ]

  • Создание новых пользовательских компонентов для визуализации или обработки данных
  • Внедрение новых файловых ридеров или писателей
  • Язык программирования C ++
  • Мастер разработки для быстрого начала работы

Neuro option [ править ]

  • Анализ медицинских изображений для DTI и перфузии головного мозга
  • Отслеживание волокна с поддержкой нескольких алгоритмов на основе потоковых линий
  • Разделение волокна на пучки волокон на основе определенных пользователем регионов источника и назначения
  • Вычисление тензорных полей, диффузионно-взвешенных карт
  • Разложение тензорных полей по собственным значениям
  • Расчет среднего времени прохождения, церебрального кровотока и объема церебральной крови

Вариант VR [ править ]

  • Визуализация данных на больших плиточных дисплеях или в иммерсивных средах виртуальной реальности (VR)
  • Поддержка устройств 3D-навигации
  • Быстрый многопоточный и распределенный рендеринг

Вариант с очень большими данными [ править ]

  • Поддержка визуализации данных изображения, превышающих доступную основную память, с использованием эффективного внешнего управления данными
  • Расширения многих стандартных модулей, таких как ортогональная и наклонная срезка, объемный рендеринг и рендеринг изоповерхностей, для работы с данными вне ядра

Области применения [ править ]

  • Анатомия [32] [33]
  • Биохимия [34]
  • Биофизика [34]
  • Клеточная микробиология [35] [36]
  • Вычислительная гидродинамика [37]
  • Криоэлектронная томография [35]
  • Диффузионная МРТ / трактография [38]
  • Эмбриология [32]
  • Эндокринология [39]
  • Конечно-элементное моделирование [40]
  • Гистология [32] [34] [41]
  • Материаловедение [42]
  • Медицинская визуализация [43]
  • Микроскопия в науках о жизни и материалах
  • Молекулярная биология [44]
  • Неврология [41] [45]
  • Ортопедия [40] [46] [47]
  • Отоларингология [48]
  • Доклиническая визуализация [44]
  • Урология [49]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Сваливание, D .; Westerhoff, M .; Hege, H.-C. (2005). CD Хансен и CR Джонсон (ред.). «Амира: высокоинтерактивная система для визуального анализа данных». Справочник по визуализации : 749–767. CiteSeerX  10.1.1.129.6785 . DOI : 10.1016 / B978-012387582-2 / 50040-X . ISBN 9780123875822.
  2. ^ Адам, R .; Смит, АР; Sieren, JC; Eggleston, T .; МакЛеннан, Г. (2010). «Характеристика дыхательных путей и легких для мыши с нокаутом FABP / CFTR с использованием микрокомпьютерной томографии и массива микроскопов с большим изображением» (PDF) . Американский журнал респираторной медицины и реанимации . 181 : A6264. DOI : 10,1164 / ajrccm-conference.2010.181.1_meetingabstracts.a6264 .
  3. ^ Awasthi, V .; Holter, J .; Thorp, K .; Андерсон, С .; Эпштейн, Р. (2010). «Оценка F-18-fluorothymidine-PET трансплантата костного мозга на модели крысы». Сообщения в области ядерной медицины . 31 (2): 152–158. DOI : 10.1097 / mnm.0b013e3283339f92 . PMID 19966596 . S2CID 44923538 .  
  4. ^ a b Ayers, GD; McKinley, ET; Zhao, P .; Fritz, JM; Метры, RE; Сделка, Британская Колумбия; Адлерз, КМ; Коффи, Р.Дж.; Мэннинг, ХК (2010). «Объем доклинических опухолей ксенотрансплантата более точно оценивается с помощью ультразвуковой визуализации, чем ручные измерения штангенциркулем» . Журнал ультразвука в медицине . 29 (6): 891–901. DOI : 10,7863 / jum.2010.29.6.891 . PMC 2925269 . PMID 20498463 .  
  5. ^ Dlasková, A .; Spacek, T .; Santorová, J .; Plecitá-Hlavatá, L .; Berková, Z .; Saudek, F .; Lessard, M .; Bewersdorf, J .; Jezek, P. (2010). «4Pi микроскопия выявляет нарушенную трехмерную митохондриальную сеть бета-клеток островков поджелудочной железы, экспериментальную модель диабета 2 типа». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика . 1797 (6–7): 1327–1341. DOI : 10.1016 / j.bbabio.2010.02.003 . PMID 20144584 . 
  6. ^ Кларк, НДЛ; Дэли., С. (2010). «Использование конфокальной лазерной сканирующей микроскопии для изображения включений трихома в янтаре» (PDF) . Журнал палеонтологических методов . 8 .
  7. ^ Амстальден ван Хов, ER; Блэквелл, TR; Klinkert, I .; Эйкель, Великобритания; Heeren, R .; Глунде, К. (2010). «Мультимодальная масс-спектрометрическая визуализация малых молекул выявляет различные пространственно-молекулярные сигнатуры в моделях дифференциально метастатической опухоли молочной железы» . Исследования рака . 70 (22): 9012–9021. DOI : 10,1158 / 0008-5472.can-10-0360 . PMC 5555163 . PMID 21045154 .  
  8. Перейти ↑ Sherman, DM (2010). «Металлообразование и ассоциация ионов в гидротермальных флюидах: выводы из квантовой химии и молекулярной динамики». Границы в Geofluids . Геофлюиды . 10 . С. 41–57. DOI : 10.1002 / 9781444394900.ch4 . ISBN 9781444394900. Архивировано из оригинала на 2013-01-06.
  9. ^ О'Нил, SM; Джонс, TW (2010). «Трехмерное моделирование двунаправленных магнитогидродинамических струй, взаимодействующих с кластерной средой». Астрофизический журнал . 710 (1): 180–196. arXiv : 1001,1747 . Bibcode : 2010ApJ ... 710..180O . DOI : 10.1088 / 0004-637x / 710/1/180 . S2CID 118617883 . 
  10. ^ Бахароглу, Мичиган; Ширмер, СМ; Hoit, DA; Gao, BL; Малек, AM (2010). "Угол притока аневризмы как дискриминант разрыва боковых церебральных аневризм" . Морфометрический и вычислительный гидродинамический анализ . Архивировано из оригинала на 2010-06-22 . Проверено 17 мая 2012 .
  11. ^ Бардын, Т .; Gédet, P .; Hallermann, W .; Бюхлер, П. (2010). «Прогнозирование крутящего момента дентального имплантата с помощью быстрого и автоматического анализа методом конечных элементов: пилотное исследование». Хирургия полости рта, Медицина полости рта, Патология полости рта, Радиология полости рта и Эндодонтология . 109 (4): 594–603. DOI : 10.1016 / j.tripleo.2009.11.010 . PMID 20163974 . 
  12. ^ Стрижка, PR; Gelb, J .; Yi, J .; Ли, WK; Дракополус, М .; Брэндон, НП (2010). «Анализ трехфазного контакта в микроструктурах Ni-YSZ с использованием неразрушающей рентгеновской томографии с синхротронным излучением» . Электрохимические коммуникации . 12 (8): 1021–1024. DOI : 10.1016 / j.elecom.2010.05.014 .
  13. ^ Jährling, N .; Беккер, К .; Schönbauer, C .; Шноррер, Ф .; Додт, HU (2010). «Трехмерная реконструкция и сегментация интактной дрозофилы с помощью ультрамикроскопии» . Границы системной нейробиологии . 4 : 1. DOI : 10,3389 / neuro.06.001.2010 . PMC 2831709 . PMID 20204156 .  
  14. ^ Чжэн, Г. (2010). «Реконструкция на основе статистической модели формы масштабированной модели поверхности таза для конкретного пациента с помощью единственной стандартной рентгеновской рентгенограммы в прямом и поперечном направлении» . Медицинская физика . 37 (4): 1424–1439. Bibcode : 2010MedPh..37.1424Z . DOI : 10.1118 / 1.3327453 . PMID 20443464 . Архивировано из оригинала на 2012-07-11 . Проверено 15 мая 2019 . 
  15. ^ Родригес-Сото, AE; Fritscher, KD; Schuler, B .; Issever, AS; Roth, T .; Kamelger, F .; Kammerlander, C .; Blauth, M .; Schubert, R .; Линк, TM (2010). «Анализ текстуры, минеральной плотности кости и толщины коры проксимального отдела бедренной кости: прогнозирование риска перелома». Журнал компьютерной томографии . 34 (6): 949–957. DOI : 10.1097 / rct.0b013e3181ec05e4 . PMID 21084915 . S2CID 21196403 .  
  16. ^ a b Leischner, U .; Schierloh, A .; Zieglgänsberger, W .; Додт, HU (2010). «Индуцированная формалином флуоресценция выявляет форму и морфологию клеток в образцах биологических тканей» . PLOS ONE . 5 (4): e10391. Bibcode : 2010PLoSO ... 510391L . DOI : 10.1371 / journal.pone.0010391 . PMC 2861007 . PMID 20436930 .  
  17. ^ Войлок, RL; Нараян, К .; Estes, JD; Ши, Д .; Trubey, CM; Fu, J .; Хартнелл, Л. М.; Рутель, GT; Шнайдер, ДК; Нагашима, К. (2010). «3D-визуализация передачи ВИЧ в вирусологическом синапсе между дендритными клетками и Т-клетками» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (30): 13336–13341. Bibcode : 2010PNAS..10713336F . DOI : 10.1073 / pnas.1003040107 . PMC 2922156 . PMID 20624966 .  
  18. ^ Тейлор, диджей; Дурли, диджей; Шротер, RC (2010). "Рецепт профиля границы притока для численного моделирования носового воздушного потока" . Журнал Интерфейса Королевского общества . 7 (44): 515–527. DOI : 10,1098 / rsif.2009.0306 . PMC 2842801 . PMID 19740920 .  
  19. ^ Лукас, Британская Колумбия; Bogovic, JA; Карасс, А .; Базин, ПЛ; Prince, JL; Pham, DL; Ландман, Б.А. (2010). «Набор инструментов Java Image Science Toolkit (JIST) для быстрого прототипирования и публикации программного обеспечения для нейровизуализации» . Нейроинформатика . 8 (1): 5–17. DOI : 10.1007 / s12021-009-9061-2 . PMC 2860951 . PMID 20077162 .  
  20. ^ Dasgupta, S .; Feleppa, E .; Ramachandran, S .; Ketterling, J .; Калиш, А .; Haker, S .; Tempany, C .; Портер, С .; Lacrampe, M .; Исаксон, К. (2007). «8A-4 Пространственная совместная регистрация магнитно-резонансных и ультразвуковых изображений простаты как основа для многомодальной визуализации тканевого типа». 2007 Труды симпозиума по ультразвуковому оборудованию IEEE . С. 641–643. DOI : 10.1109 / ULTSYM.2007.166 . ISBN 978-1-4244-1383-6. S2CID  23656040 .
  21. ^ Оберлендер, М .; Бруно, РМ; Sakmann, B .; Broser, PJ (2007). "Светлопольная мозаичная микроскопия в проходящем свете для трехмерного отслеживания морфологии отдельных нейронов" . Журнал биомедицинской оптики . 12 (6): 064029. Bibcode : 2007JBO .... 12f4029O . DOI : 10.1117 / 1.2815693 . PMID 18163845 . Архивировано из оригинала на 2012-07-18 . Проверено 15 мая 2019 . 
  22. ^ Lamecker, H .; Манси, т .; Relan, J .; Billet, F .; Sermesant, M .; Ayache, N .; Делингетт., Х. (2009). «Адаптивная тетраэдрическая сетка для персонализированного моделирования сердца». CiteSeerX 10.1.1.698.4292 .  Cite journal requires |journal= (help)
  23. ^ Boretius, S .; Михаэлис, Т .; Tammer, R .; Ashery-Padan, R .; Frahm, J .; Стойкова, А. (2009). «In vivo МРТ измененной анатомии мозга и волоконной связи у взрослых мышей с дефицитом pax6» . Кора головного мозга . 19 (12): 2838–2847. DOI : 10.1093 / cercor / bhp057 . PMID 19329571 . 
  24. ^ Kohjiya, S .; Katoh, A .; Суда, Т .; Shimanuki, J .; Икеда, Ю. (2006). «Визуализация сетей технического углерода в резиновой матрице путем скелетонизации изображения 3D-TEM». Полимер . 47 (10): 3298–3301. DOI : 10.1016 / j.polymer.2006.03.008 .
  25. ^ Клементс, RJ; Минц, EM; Бланк, JL (2009). «Стереоскопическая объемная визуализация с высоким разрешением аргинин-вазопрессиновой системы мышей». Журнал методов неврологии . 187 (1): 41–45. DOI : 10.1016 / j.jneumeth.2009.12.011 . PMID 20036282 . S2CID 25746441 .  
  26. ^ Оно, N .; Кагеяма., А. (2009). «Визуализация области интереса системой CAVE VR с автоматическим контролем детализации». Компьютерная физика . 181 (4): 720–725. Bibcode : 2010CoPhC.181..720O . DOI : 10.1016 / j.cpc.2009.12.002 .
  27. ^ Дайер, DS (1990). «Набор инструментов для визуализации потока данных». Компьютерная графика и приложения . 10 (4): 60–69. DOI : 10.1109 / 38.56300 . S2CID 14426676 . 
  28. ^ Foulser, D. (1995). «IRIS Explorer: основа для расследования». Компьютерная графика . 29 (2): 13–16. DOI : 10.1145 / 204362.204365 . S2CID 16324076 . 
  29. ^ «Проект DFG: алгоритмы планирования и контроля над Hyperthermiebehandlungen» . DFG Deutsche Forschungsgemeinschaft . Проверено 28 января 2015 года . CS1 maint: discouraged parameter (link)
  30. ^ "Проект DFG SFB 273: Гипертермия: методика и клиника" . DFG Deutsche Forschungsgemeinschaft . Проверено 28 января 2015 года . CS1 maint: discouraged parameter (link)
  31. Перейти ↑ Strauss, PS (1993). «IRIS Inventor, набор инструментов для трехмерной графики». Уведомления ACM SIGPLAN . 28 (10): 192–200. DOI : 10.1145 / 167962.165889 .
  32. ^ а б в де Бур, BA; Soufan, AT; Hagoort, J .; Mohun, TJ; ван ден Хофф, MJB; Hasman, A .; Вурбраак, FPJM; Мурман, AFM; Руйтер, JM (2011). «Интерактивное представление трехмерной информации, полученной из реконструированных наборов данных, и трехмерное размещение отдельных гистологических срезов в формате переносимого трехмерного документа» . Развитие . 138 (1): 159–167. DOI : 10.1242 / dev.051086 . PMC 2998169 . PMID 21138978 .  
  33. ^ Specht, M .; Lebrun, R .; Золликофер, CPE (2007). «Визуализация преобразования формы между мозговой оболочкой шимпанзе и человека» (PDF) . Визуальный компьютер: Международный журнал архива компьютерной графики . 23 (9): 743–751. CiteSeerX 10.1.1.108.7163 . DOI : 10.1007 / s00371-007-0156-1 . S2CID 17472003 .   
  34. ^ a b c Gaemers, IC; Stallen, JM; Kunne, C .; Wallner, C .; van Werven, J .; Nederveen, A .; Ламерс, WH (2011). «Липотоксичность и стеатогепатит в модели перекормленных мышей для неалкогольной жировой болезни печени» (PDF) . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни . 1812 (4): 447–458. DOI : 10.1016 / j.bbadis.2011.01.003 . PMID 21216282 .  
  35. ^ а б Кудряшев, М; Cyrklaff, M .; Алекс, Б .; Lemgruber, L .; Baumeister, W .; Wallich, R .; Фришкнехт, Ф. (2011). «Доказательства прямого слияния клеток в Borrelia с помощью криогенной электронной томографии» . Клеточная микробиология . 13 (5): 731–741. DOI : 10.1111 / j.1462-5822.2011.01571.x . PMID 21276171 . S2CID 34114766 .  
  36. ^ Meisslitzer-Ruppitsch, C .; Röhrl, C .; Ranftler, C .; Neumüller, J .; Vetterlein, M .; Ellinger, A .; Павелка, М. (2011). «Обогащенные церамидом компартменты транс-Гольджи реорганизуются вместе с другими частями аппарата Гольджи в ответ на истощение АТФ». Гистохимия и клеточная биология . 135 (2): 159–171. DOI : 10.1007 / s00418-010-0773-z . PMID 21225431 . S2CID 30748663 .  
  37. ^ Беван, RLT; Сазонов, И .; Саксоно, PH; Nithiarasu, P .; van Loon, R .; Luckraz, H .; Ашрал, С. (2011). «Индивидуальное моделирование кровотока через аневризму грудной аорты со свернутой проксимальной шейкой». Численные методы в биомедицинской инженерии . 27 (8): 1167–1184. DOI : 10.1002 / cnm.1425 .
  38. ^ Jiang, Y .; Джонсон, Джорджия (2010). "Микроскопическая диффузионная тензорная визуализация мозга мыши" . NeuroImage . 50 (2): 465–471. DOI : 10.1016 / j.neuroimage.2009.12.057 . PMC 2826147 . PMID 20034583 .  
  39. ^ Bujotzek, A .; Shan, M .; Haag, R .; Вебер, М. (2011). «На пути к рациональной конструкции спейсера для бивалентного ингибирования рецептора эстрогена». Журнал компьютерного молекулярного дизайна . 25 (3): 253–262. Bibcode : 2011JCAMD..25..253B . DOI : 10.1007 / s10822-011-9417-1 . PMID 21331802 . S2CID 29015240 .  
  40. ^ a b Cai, W .; Ли, EY; Vij, A .; Махмуд, С.А.; Йошида, Х. (2011). «MDCT для компьютерного волюметрии пневмотораксов у педиатрических пациентов» . Академическая радиология . 18 (3): 315–23. DOI : 10.1016 / j.acra.2010.11.008 . PMC 3072076 . PMID 21216160 .  
  41. ^ a b Irving, S .; Мур, Д.Р .; Либерман, MC; Самнер, CJ (2011). «Olivocochlear эфферентный контроль в звуковой локализации и обучении, зависящем от опыта» . Журнал неврологии . 31 (7): 2493–2501. DOI : 10.1523 / jneurosci.2679-10.2011 . PMC 3292219 . PMID 21325517 .  
  42. ^ Kübel, C .; Voigt, A .; Schoenmakers, R .; Оттен, М .; Вс, Д .; Ли, ТС; Carlsson, A .; Брэдли, Дж. (2005). "Последние достижения в электронной томографии: ТЕМ и HAADF-STEM томография для материаловедения и полупроводниковых приложений". Microsc. Микроанал . 11 (5): 378–400. DOI : 10.1017 / S1431927605050361 . PMID 17481320 . 
  43. ^ Чан, S .; Li, P .; Locketz, G .; Salisbury, K .; Блевинс, NH (2016). «Высококачественная тактильная и визуальная визуализация для моделирования хирургии височной кости с учетом специфики пациента» . Компьютерная хирургия . 11 (1): 85–101. DOI : 10.1080 / 24699322.2016.1189966 . PMID 2797394 . S2CID 4028626 .  
  44. ^ a b Obenaus, A .; Хейс, П. (2011). Дефекты сверления отверстий: индукция, визуализация и анализ на грызунах . Методы молекулярной биологии. 690 . С. 301–314. DOI : 10.1007 / 978-1-60761-962-8_20 . ISBN 978-1-60761-961-1. PMID  21043001 .
  45. ^ Ertürk, A .; Mauch, CP; Hellal, F .; Förstner, F .; Keck, T .; Беккер, К .; Jährling, N .; Steffens, H .; Richter, M .; Hübener, M .; Kramer, E .; Кирхгоф, Ф .; Додт; Брадке, Ф. (2011). «Трехмерное изображение неразрезанного спинного мозга взрослого человека для оценки регенерации аксонов и глиальных реакций после травмы» . Природная медицина . 18 (1): 166–171. DOI : 10.1038 / nm.2600 . PMID 22198277 . S2CID 16100638 .  
  46. ^ Карлсон, KJ; Wrangham, RW; Мюллер, Миннесота; Самнер, Д.Р .; Морбек, Мэн; Nishida, T .; Яманака, А .; Бош, К. (2011). Сравнения структурных свойств конечностей у шимпанзе, живущих на свободе, из сообществ Кибале, Гомбе, Махале и Тай . Передвижение примаса . С. 155–182. DOI : 10.1007 / 978-1-4419-1420-0_9 . ISBN 978-1-4419-1419-4.
  47. ^ Hartwig, T .; Streitparth, F .; Gro, C .; Мюллер, М .; Perka, C .; Putzier, M .; Штрубе, П. (2011). «Цифровой трехмерный анализ паравертебральных мышц поясницы после кольцевого одноуровневого слияния». Журнал заболеваний позвоночника и методов . 30 (6): E702 – E706. DOI : 10.1097 / BSD.0000000000000249 . PMID 28632556 . S2CID 4401218 .  
  48. ^ Ли, Дж .; Эддингтон, Дания; Надоль, JB (2011). «Гистопатология ревизионной кохлеарной имплантации» . Аудиология и невротология . 16 (5): 336–346. DOI : 10.1159 / 000322307 . PMC 7265424 . PMID 21196725 .  
  49. ^ Хан, М .; Kim, C .; Мозер, П .; Schafer, F .; Badaan, S .; Вигару, Б .; Ценг, К .; Petrisor, D .; Trock, B .; Стоянович, Д. (2011). «Тандем-роботизированная лапароскопическая радикальная простатэктомия для улучшения визуализации сосудисто-нервного пучка: технико-экономическое обоснование» (PDF) . Урология . 77 (2): 502–6. DOI : 10.1016 / j.urology.2010.06.064 . PMC 3051397 . PMID 21067797 .   

Внешние ссылки [ править ]

  • Официальный веб-сайт
  • Галерея вариантов использования
  • Примечания к выпуску