Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Система Barcode of Life Data (широко известная как BOLD или BOLDSystems ) - это веб-платформа, специально предназначенная для штрих-кодирования ДНК . [1] [2] Это облачная платформа для хранения и анализа данных, разработанная Центром геномики биоразнообразия в Канаде. Он состоит из четырех основных модулей, портала данных, образовательного портала, реестра BIN (предполагаемых видов) и инструментария для сбора и анализа данных, который обеспечивает онлайн-платформу для анализа последовательностей ДНК . [2]С момента запуска в 2005 году BOLD был расширен и теперь предоставляет ряд функций, включая организацию данных, проверку, визуализацию и публикацию. Самая последняя версия системы, версия 4, запущенная в 2017 году, содержит ряд улучшений, поддерживающих сбор и анализ данных, но также включает новые функции, улучшающие распространение, цитирование и аннотации данных. [3] До 16 ноября 2020 года BOLD уже содержал последовательности штрих-кодов для 318 105 официально описанных видов животных, растений, грибов, простейших (~ 8,9 миллиона экземпляров). [4]

BOLD доступен для любого исследователя, интересующегося штрих-кодированием ДНК . Предоставляя специализированные услуги, он помогает в публикации записей, соответствующих стандартам, необходимым для присвоения статуса BARCODE в международных базах данных нуклеотидных последовательностей. Благодаря веб-доставке и гибкой модели безопасности данных, он также имеет хорошие возможности для поддержки проектов, в которых участвуют широкие исследовательские альянсы. [3]

Публикация данных BOLD в основном возникла в результате проекта BARCODE 500K, реализуемого Международным консорциумом штрих-кода жизни (iBOL) с 2010 по 2015 год. Он был направлен на сбор данных записей штрих-кода ДНК для 5 миллионов образцов, представляющих 500 тысяч видов. Весь сбор образцов, определение последовательностей, сортировка информации вносятся большим количеством ученых, сотрудников и организаций из разных стран мира. Накопление данных увеличивает точность идентификации штрих-кода ДНК и облегчает получение штрих-кода жизни.

Ссылки [ править ]

  1. ^ Ратнасингхэм, Судживан; Хеберт, Пол DN (2013). «Реестр на основе ДНК для всех видов животных: система индекса штрих-кода (BIN)» . PLoS ONE . 8 (7): e66213. DOI : 10.1371 / journal.pone.0066213 . ISSN  1932-6203 .
  2. ^ a b РАТНАСИНГЕМ, СУДЖЕЕВАН; HEBERT, PAUL DN (24 января 2007 г.). «СТАРТОВЫЕ КОДЫ: жирный шрифт: Система данных о штрих-кодах жизни (http://www.barcodinglife.org)» . Заметки о молекулярной экологии . 7 (3): 355–364. DOI : 10.1111 / j.1471-8286.2007.01678.x . ISSN 1471-8278 . 
  3. ^ a b «Руководство по печати BOLD для BOLD v4» . www.boldsystems.org . Проверено 16 ноября 2020 .
  4. ^ «Царства Жизни с штрих-кодом | БОЛДСИСТЕМЫ» . www.boldsystems.org . Проверено 16 ноября 2020 .

Внешние ссылки [ править ]