Из Википедии, свободной энциклопедии
  (Перенаправлено из CaCC )
Перейти к навигации Перейти к поиску

TMEM16
Tmem16a EMD-3860.png
Карикатурное изображение хлоридного канала mTMEM16A на основе реконструкции с помощью криоэлектронной микроскопии . [1]
Идентификаторы
Условное обозначениеАпоктамин
PfamPF04547
ИнтерПроIPR032394
TCDB1.A.17
OPM суперсемейство369
Мембранома219
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры

Кальций-зависимый Хлорид канал (Са-ClC) белки (или кальций-активируемые каналы хлорида (CaCCs), [2] являются гетерогенными группами лиганда-ионных каналов для хлорида , которые были идентифицированы во многих эпителиальных и эндотелиальных клетках типов , а также как в гладкомышечных клетках . Они включают белки из нескольких структурно различных семейств: вспомогательные хлоридные каналы (CLCA), [3] бестрофин (BEST), [4] [5] и аноктаминовые каналы, зависимые от кальция хлоридного канала (ANO или TMEM16)] ] [4] [5] [6] [7] ANO1высоко экспрессируется в интерстициальных клетках Кахала человека желудочно-кишечного тракта , которые являются белками, которые служат в качестве стимуляторов перистальтики кишечника . [6] В дополнение к их роли в качестве хлоридных каналов, некоторые белки CLCA действуют как молекулы адгезии и могут также играть роль супрессоров опухолей . [8] Эти эукариотические белки «необходимы для нормальной секреции электролитов и жидкости, обонятельного восприятия, а также возбудимости нейронов и гладких мышц» у животных. [9] [10] Члены семейства Ca-CIC обычно имеют длину от 600 до 1000 аминоацильных остатков (аас) и имеют от 7 до 10 трансмембранных сегментов (ТМС).

Функция [ править ]

Tmc1 и Tmc2 ( TC # s 1.A.17.4.6 и 1.A.17.4.1 , соответственно) могут играть роль в слухе и необходимы для нормальной функции волосковых клеток улитки, возможно, как каналы Ca 2+ или Ca 2+ канальных субблока (см. Также семейство TC # 1.A.82 ). [11] У мышей, лишенных обоих каналов, отсутствуют механосенсорные потенциалы волосковых клеток. [12] Есть 8 членов этого семейства у людей, 1 у Drosophila и 2 у C. elegans . Один из последних двух экспрессируется в механорецепторах. [13] Tmc1 представляет собой натрий-чувствительный катионный канал, необходимый для хемосенсибилизации соли (Na + ) у C. elegans.«там, где это требуется для нейрональной активности, вызванной солью, и поведенческого избегания высоких концентраций NaCl». [14]

TMEM16A сверхэкспрессируется в нескольких типах опухолей. Роль TMEM16A в глиомах и возможные лежащие в основе механизмы были проанализированы Liu et al. 2014. Нокдаун TMEM16A подавлял пролиферацию, миграцию и инвазию клеток. [15]

Считается, что каналы семейства Ca-ClC катализируют следующие реакции: [16]

Cl - (выход) ⇌ Cl - ( вход )

и

Катионы (например, Ca 2+ ) (выход) ⇌ Катионы (например, Ca 2+ ) ( вход )

У людей [ править ]

CaCC, которые, как известно, встречаются у людей, включают:

  • Аксессуары: CLCA1 , CLCA2 , CLCA3 и CLCA4
  • Аноктамины: [примечание 1] ANO1 и ANO2 (потенциально другие) [17]
  • Бестрофины: BEST1 , BEST2 , BEST3 и BEST4 [17]

См. Также [ править ]

  • Ионный канал с регулируемым напряжением
  • Ионный канал

Заметки [ править ]

  1. ^ Аноктамины экспрессируются только у эукариот , 10 членов - у позвоночных . [7] Хотя все аноктамины активируются кальцием, не все члены этого семейства являются ионными каналами, такими как ANO1; некоторые представляют собой фосфолипидные скрамблазы . [7] ANO1 был первым аноктамином, обнаруженным тремя исследовательскими группами, независимо идентифицировавшими его в 2008 году. [7] Один белок-гомолог аноктаминов позвоночных был обнаружен в грибах и дрожжах, соответственно, Aspergillus fumigatus и Saccharomyces cerevisiae . [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ PDB : 5ойб ; Паулино С., Калиенкова В., Лам А., Нельднер Ю., Дутцлер Р. (декабрь 2017 г.). «Механизм активации кальциевого хлоридного канала TMEM16A, выявленный крио-ЭМ» (PDF) . Природа . 552 (7685): 421–425. Bibcode : 2017Natur.552..421P . DOI : 10.1038 / nature24652 . PMID  29236691 . S2CID  4457894 .
  2. ^ Hartzell C, Putzier I, J Арреола (март 2005). «Хлоридные каналы, активируемые кальцием». Ежегодный обзор физиологии . 67 : 719–58. DOI : 10.1146 / annurev.physiol.67.032003.154341 . PMID 15709976 . 
  3. ^ "Дополнительный канал хлорида CLCA1 1 [Homo sapiens (человек)]" . Джин . Национальный центр биотехнологической информации . 13 января 2015.
  4. ^ a b Kunzelmann K, Kongsuphol P, Chootip K, Toledo C, Martins JR, Almaca J, Tian Y, Witzgall R, Ousingsawat J, Schreiber R (январь 2011 г.). «Роль бестрофина и аноктамина Ca2 + -активированных каналов Cl- в эпителиальных клетках». Биологическая химия . 392 (1–2): 125–34. DOI : 10.1515 / BC.2011.010 . PMID 21194364 . S2CID 24285022 .  
  5. ^ a b Kunzelmann K, Kongsuphol P, Aldehni F, Tian Y, Ousingsawat J, Warth R, Schreiber R (октябрь 2009 г.). «Бестрофин и TMEM16-Ca (2+) активировали Cl (-) каналы с разными функциями». Клеточный кальций . 46 (4): 233–41. DOI : 10.1016 / j.ceca.2009.09.003 . PMID 19783045 . 
  6. ^ a b Сандерс К.М., Чжу М.Х., Бриттон Ф., Ко SD, Уорд С.М. (февраль 2012 г.). «Аноктамины и возбудимость гладкой мускулатуры желудочно-кишечного тракта» . Экспериментальная физиология . 97 (2): 200–6. DOI : 10.1113 / expphysiol.2011.058248 . PMC 3272164 . PMID 22002868 .  
  7. ^ а б в г д Бруннер Дж. Д., Лим Н. К., Шенк С., Дюрст А., Дутцлер Р. (декабрь 2014 г.). «Рентгеновская структура кальций-активированной липидной скрамблазы TMEM16». Природа . 516 (7530): 207–12. Bibcode : 2014Natur.516..207B . DOI : 10,1038 / природа13984 . PMID 25383531 . S2CID 1396768 .  
  8. ↑ Evans SR, Thoreson WB, Beck CL (октябрь 2004 г.). «Молекулярный и функциональный анализ двух новых членов семейства кальций-активируемых хлоридных каналов из глаза и кишечника мыши» . Журнал биологической химии . 279 (40): 41792–800. DOI : 10.1074 / jbc.M408354200 . PMC 1383427 . PMID 15284223 .  
  9. ↑ Caputo A, Caci E, Ferrera L, Pedemonte N, Barsanti C, Sondo E, Pfeffer U, Ravazzolo R, Zegarra-Moran O, Galietta LJ (октябрь 2008 г.). «TMEM16A, мембранный белок, связанный с кальций-зависимой активностью хлоридных каналов». Наука . 322 (5901): 590–4. Bibcode : 2008Sci ... 322..590C . DOI : 10.1126 / science.1163518 . PMID 18772398 . S2CID 52870095 .  
  10. Перейти ↑ Pang C, Yuan H, Ren S, Chen Y, An H, Zhan Y (1 января 2014 г.). «TMEM16A / B ассоциированный CaCC: структурные и функциональные идеи». Буквы о белках и пептидах . 21 (1): 94–9. DOI : 10.2174 / 09298665113206660098 . PMID 24151904 . 
  11. ^ Ким KX, Fettiplace R (январь 2013). «Изменения развития в канале механотрансдуктора волосковых клеток улитки и их регуляция с помощью белков, подобных трансмембранным каналам» . Журнал общей физиологии . 141 (1): 141–8. DOI : 10,1085 / jgp.201210913 . PMC 3536526 . PMID 23277480 .  
  12. ^ Кавасима Y, Géléoc GS, Kurima K, Labay V, Lelli A, Asai Y, Makishima T, Wu DK, Della Santina CC, Holt JR, Griffith AJ (декабрь 2011 г.). «Для механотрансдукции в волосковых клетках внутреннего уха мышей необходимы гены, подобные трансмембранным каналам» . Журнал клинических исследований . 121 (12): 4796–809. DOI : 10.1172 / JCI60405 . PMC 3223072 . PMID 22105175 .  
  13. ^ Смит CJ, Ватсон JD, Спенсер WC, О'Брайен T, Cha B, Albeg A, Treinin M, Miller DM (сентябрь 2010). «Покадровая визуализация и профили клеточно-специфической экспрессии выявляют динамическое ветвление и молекулярные детерминанты мульти-дендритного ноцицептора у C. elegans» . Биология развития . 345 (1): 18–33. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2010.05.502 . PMC 2919608 . PMID 20537990 .  
  14. ^ Chatzigeorgiou M, Bang S, Hwang SW, Schafer WR (февраль 2013 г. ). «tmc-1 кодирует чувствительный к натрию канал, необходимый для солевой химиочувствительности у C. elegans» . Природа . 494 (7435): 95–99. Bibcode : 2013Natur.494 ... 95C . DOI : 10.1038 / nature11845 . PMC 4021456 . PMID 23364694 .  
  15. Перейти ↑ Liu J, Liu Y, Ren Y, Kang L, Zhang L (март 2014 г.). «Трансмембранный белок с неизвестной функцией, сверхэкспрессия 16A способствует образованию глиомы через сигнальный путь ядерного фактора-κB» . Отчеты по молекулярной медицине . 9 (3): 1068–74. DOI : 10.3892 / mmr.2014.1888 . PMID 24401903 . 
  16. ^ "1.A.17 Семейство кальций-зависимых хлоридных каналов (Ca-ClC)" . TCDB . Проверено 16 апреля 2016 года .
  17. ^ a b «Хлоридный канал, активированный кальцием» . Руководство по фармакологии IUPHAR / BPS . Проверено 7 октября 2015 года .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • «TCDB» ПОИСК » . www.tcdb.org . Проверено 16 апреля 2016.
  • Миленкович В.М., Брокманн М., Штер Х, Вебер Б.Х., Штраус О. (октябрь 2010 г.). «Эволюция и функциональная дивергенция семейства аноктаминов мембранных белков» . BMC Evolutionary Biology . 10 : 319. DOI : 10.1186 / 1471-2148-10-319 . PMC  2974728 . PMID  20964844 .
  • Kunzelmann K, Cabrita I, Wanitchakool P, Ousingsawat J, Sirianant L, Benedetto R, Schreiber R (март 2016 г.). «Модуляция сигналов Ca²⁺: общая тема для TMEM16, Ist2 и TMC». Pflügers Archiv . 468 (3): 475–90. DOI : 10.1007 / s00424-015-1767-4 . PMID  26700940 . S2CID  14374080 .
  • Капуто А., Качи Е., Феррера Л., Педемонте Н., Барсанти С., Сондо Е., Пфеффер Ю., Раваццоло Р., Зегарра-Моран О., Галиетта Л. Дж. (Октябрь 2008 г.). «TMEM16A, мембранный белок, связанный с кальций-зависимой активностью хлоридных каналов». Наука . 322 (5901): 590–4. Bibcode : 2008Sci ... 322..590C . DOI : 10.1126 / science.1163518 . PMID  18772398 . S2CID  52870095 .
  • Ян Ю.Д., Чо Х, Ку Джи, Так МХ, Чо И, Шим У.С., Пак С.П., Ли Дж, Ли Би, Ким Б.М., Рауф Р., Шин Ю.К., О У (октябрь 2008 г.) «TMEM16A придает активируемую рецептором кальций-зависимую хлоридную проводимость». Природа . 455 (7217): 1210–5. Bibcode : 2008Natur.455.1210Y . DOI : 10,1038 / природа07313 . PMID  18724360 . S2CID  205214858 .
  • Феррера Л., Капуто А., Убби I, Буссани Е., Зегарра-Моран О., Раваццоло Р., Пагани Ф., Галиетта Л. Дж. (Ноябрь 2009 г.). «Регулирование свойств хлоридных каналов TMEM16A альтернативным сращиванием» . Журнал биологической химии . 284 (48): 33360–8. DOI : 10.1074 / jbc.M109.046607 . PMC  2785179 . PMID  19819874 .
  • Galietta LJ (декабрь 2009 г.). «Семейство белков TMEM16: новый класс хлоридных каналов?» . Биофизический журнал . 97 (12): 3047–53. Bibcode : 2009BpJ .... 97.3047G . DOI : 10.1016 / j.bpj.2009.09.024 . PMC  2793353 . PMID  20006941 .
  • Hwang SJ, Blair PJ, Britton FC, O'Driscoll KE, Hennig G, Bayguinov YR, Rock JR, Harfe BD, Sanders KM, Ward SM (октябрь 2009 г.). «Экспрессия аноктамина 1 / TMEM16A интерстициальными клетками Кахаля является фундаментальной для медленноволновой активности в мышцах желудочно-кишечного тракта» . Журнал физиологии . 587 (Pt 20): 4887–904. DOI : 10.1113 / jphysiol.2009.176198 . PMC  2770154 . PMID  19687122 .
  • Шрайбер Р., Ульякина И., Конгсупхол П., Варт Р., Мирза М., Мартинс Дж. Р., Кунцельманн К. (март 2010 г.). «Экспрессия и функция эпителиальных аноктаминов» . Журнал биологической химии . 285 (10): 7838–45. DOI : 10.1074 / jbc.M109.065367 . PMC  2844227 . PMID  20056604 .

На момент редактирования в этой статье используется контент из "1.A.13 The Epithelial Chloride Channel (E-ClC) Family" , который лицензирован таким образом, чтобы разрешить повторное использование по непортированной лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 , но не под GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.