Витамина D рецепторы ( РДР ) является членом ядерных рецепторов семейства факторов транскрипции . [5] Кальцитриол (активная форма витамина D ) связывается с VDR, который затем образует гетеродимер с рецептором ретиноида-X . Затем гетеродимер VDR проникает в ядро и связывается с чувствительными к VDR элементами в геномной ДНК . Связывание VDR приводит к экспрессии или трансрепрессии определенных генных продуктов.
VDR также участвует в управляемых микроРНК посттранскрипционных механизмах. [6] В организме человека, рецептор витамина D кодируется VDR гена . [7]
Известно, что глюкокортикоиды снижают экспрессию VDR, которая экспрессируется в большинстве тканей тела и регулирует транспорт кальция , железа и других минералов в кишечнике . [8]
Содержание
1 Функция
2 взаимодействия
3 Интерактивная карта проезда
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
6 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Ген VDR кодирует рецептор ядерного гормона витамина D 3 . Этот рецептор также функционирует как рецептор литохолевой кислоты вторичной желчной кислоты . Рецептор принадлежит к семейству транс-действующих факторов регуляции транскрипции и демонстрирует сходство последовательности с рецепторами стероидных гормонов и гормонов щитовидной железы. [9]
Нижестоящие мишени этого ядерного рецептора гормона участвуют в основном в минеральном метаболизме, хотя рецептор регулирует множество других метаболических путей, таких как те, которые участвуют в иммунном ответе и раке. [10]
Мутации в этом гене связаны с устойчивым к витамину D рахитом II типа . Однонуклеотидный полиморфизм в кодоне инициации приводит к альтернативному сайту старта трансляции на три кодона ниже. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих один и тот же белок. [11] Варианты гена VDR, по-видимому, влияют на многие биологические конечные точки, в том числе связанные с остеопорозом [12]
Рецептор витамина D играет важную роль в регулировании цикла волос. Потеря VDR связана с выпадением волос у экспериментальных животных. [13]
Экспериментальные исследования показали, что нелигандированный VDR взаимодействует с регуляторными областями в cWnt ( сигнальный путь wnt ) и генах-мишенях sonic hedgehog и необходим для индукции этих путей во время постнатального цикла волос. [14]Эти исследования выявили новые действия VDR без ограничения по регуляции пост-морфогенного цикла волос. Исследователи сосредоточили свои усилия на выяснении роли полиморфизма VDR в различных заболеваниях и нормальных фенотипах, таких как восприимчивость и прогрессирование инфекции ВИЧ-1 или естественный процесс старения. Наиболее примечательные результаты включают отчет о вариантах VDR, которые усиливают действие витамина D и которые напрямую коррелируют с темпами прогрессирования СПИДа, о том, что связь VDR с прогрессированием до СПИДа соответствует аддитивной модели [15], а также о роли полиморфизма FokI как фактора риска. для оболочечной вирусной инфекции, выявленной в ходе метаанализа. [16]Важность этого гена также была отмечена в процессе естественного старения: гаплотипы 3'UTR гена показали связь с долголетием. [17]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что рецептор витамина D взаимодействует с
BAG1 , [18]
BAZ1B , [19]
CAV3 , [20]
MED1 , [19] [21]
MED12 , [19] [21]
MED24 , [19] [21]
NCOR1 , [22]
NCOR2 , [22] [23]
NCOA2 , [19] [24] [25] [26]
RXRA , [25] [27]
RUNX1 , [23]
RUNX1T1 , [23]
SNW1 , [25] [27]
STAT1 , [28] и
ZBTB16 . [23] [29]
Интерактивная карта проезда [ править ]
Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]
^ Интерактивную карту путей можно отредактировать на WikiPathways: "VitaminDSynthesis_WP1531" .
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000111424 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022479 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Мур Д.Д., Като С., Се В., Мангельсдорф Д. Д., Шмидт Д. Р., Сяо Р., Кливер С.А. (декабрь 2006 г.). "Международный союз фармакологии. LXII. Рецепторы NR1H и NR1I: конститутивный рецептор андростана, рецептор прегнена X, рецептор фарнезоида X альфа, рецептор фарнезоида X бета, рецептор X печени альфа, рецептор X печени бета и рецептор витамина D". Pharmacol. Ред . 58 (4): 742–59. DOI : 10,1124 / pr.58.4.6 . PMID 17132852 . S2CID 85996383 .
^ Лисс TS, Chun РФ, Rieger S, Adams JS, Хьюисон M (июнь 2013). «Активация витамином D функционально различных регуляторных miRNA в первичных остеобластах человека» . J Bone Miner Res . 28 (6): 1478–14788. DOI : 10.1002 / jbmr.1882 . PMC 3663893 . PMID 23362149 .
^ Szpirer Дж, Szpirer С, Riviere М, G Леван, MARYNEN Р, Cassiman JJ, Визе R, Делука ВЧ (сентябрь 1991). «Ген фактора транскрипции Sp1 (SP1) и ген рецептора 1,25-дигидроксивитамина D3 (VDR) совместно локализованы на плече хромосомы человека 12q и хромосоме 7 крысы». Геномика . 11 (1): 168–73. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (91) 90114-T . PMID 1662663 .
^ Fleet JC, Шох RD (август 2010). «Молекулярные механизмы регуляции поглощения кальция в кишечнике витамином D и другими факторами» . Критик Rev Clin Lab Sci . 47 (4): 181–195. DOI : 10.3109 / 10408363.2010.536429 . PMC 3235806 . PMID 21182397 .
^ Germain P, Staels B, Dacquet C, Spedding M, Laudet V (декабрь 2006 г.). «Обзор номенклатуры ядерных рецепторов». Pharmacol. Ред . 58 (4): 685–704. DOI : 10,1124 / pr.58.4.2 . PMID 17132848 . S2CID 1190488 .
^ Adorini L, Daniel KC, Пенна G (2006). «Агонисты рецепторов витамина D, рак и иммунная система: сложные отношения». Curr Top Med Chem . 6 (12): 1297–301. DOI : 10.2174 / 156802606777864890 . PMID 16848743 .
^ "Entrez Gene: рецептор витамина D VDR (1,25-дигидроксивитамин D3)" .
^ Abouzid М, Karazniewicz-Лада М, Гловка F (2018-10-19). «Генетические детерминанты заболеваний, связанных с витамином D; внимание к рецепторам витамина D». Текущий метаболизм лекарств . 19 (12): 1042–1052. DOI : 10.2174 / 1389200219666180723143552 . PMID 30039758 .
^ Laplana M, Санчеса-де-ла-Торре M, Aguilo A, Касадо I, Flores M, Санчес-Пеллисер R, Fibla J (апрель 2010). «Маркировка долгоживущих людей с помощью гаплотипов рецептора витамина D (VDR)». Биогеронтология . 11 : 437–46. DOI : 10.1007 / s10522-010-9273-8 . ЛВП : 10459,1 / 67920 . PMID 20407924 .
^ Гузей M, S Такаяма, Reed JC (декабрь 2000). «BAG1L усиливает функцию трансактивации рецептора витамина D» . J. Biol. Chem . 275 (52): 40749–56. DOI : 10.1074 / jbc.M004977200 . PMID 10967105 .
^ a b c d e Китагава Х, Фудзики Р., Йошимура К., Мезаки Y, Уэмацу Y, Мацуи Д., Огава С., Унно К., Окубо М., Токита А., Накагава Т., Ито Т, Ишими Ю., Нагасава Х, Мацумото Т. , Янагисава Дж., Като С. (июнь 2003 г.). «Ремоделирующий хроматин комплекс WINAC нацелен на ядерный рецептор промоторов и нарушается при синдроме Вильямса» . Cell . 113 (7): 905–17. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7 . PMID 12837248 .
↑ Zhao G, Simpson RU (2010). «Мембранная локализация, ассоциация Caveolin-3 и быстрые действия рецептора витамина D в сердечных миоцитах» . Стероиды . 75 (8–9): 555–9. DOI : 10.1016 / j.steroids.2009.12.001 . PMC 2885558 . PMID 20015453 .
^ a b c Ито М., Юань С.Х., Малик С., Гу В., Фонделл Д.Д., Ямамура С., Фу З.Й., Чжан Х, Цинь Дж., Редер Р.Г. (март 1999 г.). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Мол. Cell . 3 (3): 361–70. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3 . PMID 10198638 .
^ а б Тагами Т., Лутц WH, Кумар Р., Джеймсон Дж. Л. (декабрь 1998 г.). «Взаимодействие рецептора витамина D с корепрессорами и коактиваторами ядерного рецептора». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 253 (2): 358–63. DOI : 10.1006 / bbrc.1998.9799 . PMID 9878542 .
^ a b c d Пуччетти Э., Обрадович Д., Байссерт Т., Бьянкини А., Уошберн Б., Кьярадонна Ф., Берер С., Хельцер Д., Оттманн О. Г., Пеличчи П. Г., Нерви С., Рутхардт М. (декабрь 2002 г.). «Продукты транслокации, связанные с AML, блокируют дифференцировку, вызванную витамином D (3), за счет секвестрации рецептора витамина D (3)». Cancer Res . 62 (23): 7050–8. PMID 12460926 .
^ Herdick M, Steinmeyer A, Carlberg C (июнь 2000). «Антагонистическое действие аналога сложного эфира 25-карбоновой кислоты 1альфа, 25-дигидроксивитамина D3 опосредовано отсутствием лиганд-индуцированного взаимодействия рецептора витамина D с коактиваторами» . J. Biol. Chem . 275 (22): 16506–12. DOI : 10.1074 / jbc.M910000199 . PMID 10748178 .
^ a b c Чжан С., Баудино Т.А., Дауд Д.Р., Токумару Х., Ван В., Макдональд П.Н. (ноябрь 2001 г.). «Тернарные комплексы и кооперативное взаимодействие между NCoA-62 / Ski-взаимодействующим белком и коактиваторами стероидных рецепторов в транскрипции, опосредованной рецептором витамина D» . J. Biol. Chem . 276 (44): 40614–20. DOI : 10.1074 / jbc.M106263200 . PMID 11514567 .
↑ He B, Wilson EM (март 2003 г.). «Электростатическая модуляция в рекрутировании стероидных рецепторов мотивов LXXLL и FXXLF» . Мол. Клетка. Биол . 23 (6): 2135–50. DOI : 10.1128 / MCB.23.6.2135-2150.2003 . PMC 149467 . PMID 12612084 .
^ a b Baudino TA, Kraichely DM, Jefcoat SC, Winchester SK, Partridge NC, MacDonald PN (июнь 1998 г.). «Выделение и характеристика нового белка-коактиватора NCoA-62, участвующего в транскрипции, опосредованной витамином D» . J. Biol. Chem . 273 (26): 16434–41. DOI : 10.1074 / jbc.273.26.16434 . PMID 9632709 .
^ Видал M, Рамана CV, Dusso AS (апрель 2002). «Взаимодействия рецептора Stat1-витамина D противодействуют транскрипционной активности 1,25-дигидроксивитамина D и усиливают транскрипцию, опосредованную Stat1» . Мол. Клетка. Биол . 22 (8): 2777–87. DOI : 10.1128 / MCB.22.8.2777-2787.2002 . PMC 133712 . PMID 11909970 .
↑ Ward JO, McConnell MJ, Carlile GW, Pandolfi PP, Licht JD, Freedman LP (декабрь 2001 г.). «Связанный с острым промиелоцитарным лейкозом белок, цинковый палец промиелоцитарного лейкоза, регулирует индуцированную 1,25-дигидроксивитамином D (3) моноцитарную дифференцировку клеток U937 посредством физического взаимодействия с рецептором витамина D (3)». Кровь . 98 (12): 3290–300. DOI : 10.1182 / blood.V98.12.3290 . PMID 11719366 .
Uitterlinden AG, Fang Y, Van Meurs JB, Pols HA, Van Leeuwen JP (2004). «Генетика и биология полиморфизмов рецепторов витамина D» . Джин . 338 (2): 143–56. DOI : 10.1016 / j.gene.2004.05.014 . hdl : 1765/73442 . PMID 15315818 .
Норман А.В. (2007). «Мини-обзор: рецептор витамина D: новые назначения для уже занятого рецептора» . Эндокринология . 147 (12): 5542–8. DOI : 10.1210 / en.2006-0946 . PMID 16946007 .
Боллаг ВБ (2007). «Дифференциация кератиноцитов человека требует рецептора витамина d и его коактиваторов». J. Invest. Дерматол . 127 (4): 748–50. DOI : 10.1038 / sj.jid.5700692 . PMID 17363957 .
Гото Х, Чен К.С., Прахл Дж. М., ДеЛука Х. Ф. (1992). «Единственный рецептор, идентичный рецептору из кишечника / клеток T47D, опосредует действие 1,25-дигидроксивитамина D-3 в клетках HL-60». Биохим. Биофиз. Acta . 1132 (1): 103–8. DOI : 10.1016 / 0167-4781 (92) 90063-6 . PMID 1324736 .
Сайджо Т., Ито М., Такеда Е., Хук А.Х., Наито Е., Йокота И., Сон Т., Пайк Д.В., Курода Ю. (1991). «Уникальная мутация в гене рецептора витамина D у трех японских пациентов с витамин D-зависимым рахитом типа II: полезность анализа однонитевого конформационного полиморфизма для обнаружения гетерозиготного носителя» . Являюсь. J. Hum. Genet . 49 (3): 668–73. PMC 1683124 . PMID 1652893 .
Шпирер Дж., Шпирер С., Ривьер М., Леван Дж., Маринен П., Кассиман Дж. Дж., Визе Р., ДеЛука Х. Ф. (1992). «Ген фактора транскрипции Sp1 (SP1) и ген рецептора 1,25-дигидроксивитамина D3 (VDR) совместно локализованы на плече хромосомы человека 12q и хромосоме 7 крысы». Геномика . 11 (1): 168–73. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (91) 90114-T . PMID 1662663 .
Yu XP, Mocharla H, Hustmyer FG, Manolagas SC (1991). «Экспрессия рецептора витамина D в лимфоцитах человека. Сигнальные требования и характеристика вестерн-блоттингом и секвенированием ДНК». J. Biol. Chem . 266 (12): 7588–95. PMID 1850412 .
Маллой П.Дж., Хохберг З., Тиосано Д., Пайк Дж.В., Хьюз М.Р., Фельдман Д. (1991). «Молекулярная основа наследственного 1,25-дигидроксивитамина D3 рахита в семи родственных семьях» . J. Clin. Инвестируйте . 86 (6): 2071–9. DOI : 10.1172 / JCI114944 . PMC 329846 . PMID 2174914 .
Соне Т., Маркс С.Дж., Либерман У.А., Пайк Дж. У. (1991). «Уникальная точечная мутация в хромосомном гене человеческого рецептора витамина D придает наследственную устойчивость к 1,25-дигидроксивитамину D3» . Мол. Эндокринол . 4 (4): 623–31. DOI : 10.1210 / Менд-4-4-623 . PMID 2177843 .
Бейкер А. Р., Макдоннелл Д. П., Хьюз М., Крисп TM, Мангельсдорф Д. Д., Хаусслер М. Р., Пайк Дж. В., Шайн Дж., О'Мэлли Б.В. (1988). «Клонирование и экспрессия полноразмерной кДНК, кодирующей рецептор витамина D человека» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 85 (10): 3294–8. Bibcode : 1988PNAS ... 85.3294B . DOI : 10.1073 / pnas.85.10.3294 . PMC 280195 . PMID 2835767 .
Хьюз М.Р., Маллой П.Дж., Кибак Д.Г., Кестерсон Р.А., Пайк Д.В., Фельдман Д., О'Мэлли Б.В. (1989). «Точечные мутации в гене рецептора витамина D человека, связанные с гипокальциемическим рахитом». Наука . 242 (4886): 1702–5. DOI : 10.1126 / science.2849209 . PMID 2849209 .
Rut AR, Хьюисон М., Кристьянссон К., Луизи Б., Хьюз М.Р., О'Риордан Дж. Л. (1995). «Две мутации, вызывающие резистентный к витамину D рахит: моделирование на основе кристаллических структур ДНК-связывающих доменов рецепторов стероидных гормонов». Clin. Эндокринол . 41 (5): 581–90. DOI : 10.1111 / j.1365-2265.1994.tb01822.x . PMID 7828346 . S2CID 40851942 .
Маллой П.Дж., Вейсман Ю., Фельдман Д. (1994). «Наследственный рахит, устойчивый к 1 альфа, 25-дигидроксивитамину D, возникший в результате мутации в домене, связывающем дезоксирибонуклеиновую кислоту рецептора витамина D». J. Clin. Эндокринол. Метаб . 78 (2): 313–6. DOI : 10,1210 / jc.78.2.313 . PMID 8106618 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Яги Х., Озоно К., Мияке Х., Нагашима К., Куруме Т., Пайк Дж. В. (1993). «Новая точечная мутация в связывающем дезоксирибонуклеиновую кислоту домене рецептора витамина D в родстве с наследственным 1,25-дигидроксивитамином D-устойчивым рахитом». J. Clin. Эндокринол. Метаб . 76 (2): 509–12. DOI : 10,1210 / jc.76.2.509 . PMID 8381803 .
Кристьянссон К., Рут А. Р., Хьюисон М., О'Риордан Дж. Л., Хьюз М. Р. (1993). «Две мутации в гормонсвязывающем домене рецептора витамина D вызывают резистентность тканей к 1,25 дигидроксивитамину D3» . J. Clin. Инвестируйте . 92 (1): 12–6. DOI : 10.1172 / JCI116539 . PMC 293517 . PMID 8392085 .
Юрутка П.В., Се Дж.К., Накадзима С., Хаусслер К.А., Уитфилд Г.К., Хаусслер М.Р. (1996). «Фосфорилирование рецептора витамина D человека казеинкиназой II по Ser-208 усиливает активацию транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (8): 3519–24. Bibcode : 1996PNAS ... 93.3519J . DOI : 10.1073 / pnas.93.8.3519 . PMC 39642 . PMID 8622969 .
Лин Н.Ю., Маллой П.Дж., Сакати Н., аль-Ашвал А., Фельдман Д. (1996). «Новая мутация в связывающем дезоксирибонуклеиновую кислоту домене рецептора витамина D вызывает наследственный 1,25-дигидроксивитамин D-резистентный рахит». J. Clin. Эндокринол. Метаб . 81 (7): 2564–9. DOI : 10,1210 / jc.81.7.2564 . PMID 8675579 .
Внешние ссылки [ править ]
Рецепторы Calcitriol + в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Ресурс ядерного рецептора
Рецептор витамина D: молекула месяца
IUPHAR: рецептор витамина D
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P11473 (рецептор витамина D3) в PDBe-KB .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , которая находится в общественном достоянии .
vтеГалерея PDB
2hb8 : Кристаллическая структура VDR LBD в комплексе с 2альфа-метилкальцитриолом
1ynw : Кристаллическая структура ДНК-связывающих доменов рецептора витамина D и 9-цис-ретиноевой кислоты, связанных с элементом ответа DR3
1kb2 : Кристаллическая структура ДНК-связывающего домена VDR, связанного с реакционным элементом мышиного остеопонтина (SPP)
1db1 : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ЯДЕРНОГО РЕЦЕПТОРА ВИТАМИНА D, КОМПЛЕКСНОГО С ВИТАМИНОМ D
1s0z : Кристаллическая структура VDR LBD в комплексе с секальцитолом.
2ham : Кристаллическая структура VDR LBD в комплексе с 2альфа-пропил-кальцитриолом.
2har : Кристаллическая структура VDR LBD в комплексе с 2 альфа- (3-гидрокси-1-пропокси) кальцитриолом
1kb6 : Кристаллическая структура ДНК-связывающего домена VDR, связанного с реакционным элементом остеокальцина (ОК) крысы
1ie9 : Кристаллическая структура ядерного рецептора для домена связывания лиганда витамина D, связанного с MC1288
1s19 : Кристаллическая структура лиганд-связывающего домена VDR в комплексе с кальципотриолом.
2has : Кристаллическая структура VDR LBD в комплексе с 2альфа- (1-пропокси) кальцитриолом
1ie8 : Кристаллическая структура ядерного рецептора для домена связывания лиганда витамина D, связанного с KH1060
1txi : Кристаллическая структура домена связывания лиганда vdr в комплексе с TX522
2hb7 : Кристаллическая структура VDR LBD в комплексе с 2альфа (3-гидрокси-1-пропил) кальцитриолом
1kb4 : Кристаллическая структура ДНК-связывающего домена VDR, связанного с каноническим прямым повторением, с элементом ответа спейсера из трех пар оснований (DR3)
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43
44
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
PHOX
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) TEA домен
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТ
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
Т1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора