• активность пептидазы цистеинового типа • активность пептидазы • связывание с белком GO: 0001948 • активность активатора фосфолипазы A2 • активность ингибитора циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • активность эндопептидазы цистеинового типа, участвующая в апоптотическом процессе • активность эндопептидазы цистеинового типа, участвующая в выполнении фаза апоптоза • цистеина типа эндопептидаза активность • гидролаза активность • цистеин тип эндопептидаза активатор активность участвует в процессе апоптоза • эндопептидазы активности аспарагинового типа • Протеаза связывание • связывание рецептора смерти • связывание макромолекулярного комплекса GO: 0032403 • активность эндопептидазы цистеинового типа, участвующая в апоптотическом сигнальном пути
Сотовый компонент
• цитоплазма • цитозоль • нуклеоплазма • сигнальный комплекс, вызывающий гибель • мембранный плот • ядро клетки • тело нейрональной клетки
Биологический процесс
• клеточный ответ на органическое вещество • апоптотический процесс нейрона • обязательство клеточной судьбы • ответ на эстрадиол • передача внутриклеточного сигнала GO: 0007243 • ответ на гипоксию • ответ на аминокислоту • апоптотическая фрагментация ДНК • ответ на органическое циклическое соединение • отрицательная регуляция циклина зависимая активность протеин-серин / треонинкиназы • ответ на антибиотик • образование тромбоцитов • процессинг белка • ответ на никотин • ответ на ион металла • отрицательная регуляция клеточного цикла • заживление ран • ответ на глюкокортикоиды • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • гомеостаз В-клеток • негативная регуляция апоптотического процесса • сенсорное восприятие звука • ответ на глюкозу • ответ на органическое вещество • сигнальный путь гиппопотама • глиальная клетка апоптотический процесс • дифференцировка кератиноцитов • протеолиз • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • гомеостаз Т-клеток • ответ на фактор некроза опухоли • негативная регуляция пролиферации активированных Т-клеток • развитие сердца • ответ на липополисахарид • позитивная регуляция апоптотического процесса нейронов • ответ на ранение • дифференцировка нейронов • внешний апоптотический сигнальный путь в отсутствие лиганда • обучение или память • позитивная регуляция апоптотического процесса • эритроцит дифференцировка • апоптотический сигнальный путь • негативная регуляция пролиферации В-клеток • ответ на ион кобальта • развитие гиппокампа • ответ на УФ • ответ на рентгеновское излучение • ответ на лекарство • ответ на перекись водорода • регуляция макроаутофагии • нейротрофиновый путь передачи сигнала рецептора TRK • фаза апоптоза • внутренний путь апоптотической передачи сигналов в ответ на осмотический стресс • клеточный ответ на стауроспорин • апоптотический процесс • опосредованный цитокинами сигнальный путь • активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • позитивная регуляция каталитической активности GO: 0048554 • лютеолиз • фасцикуляция аксонов • дифференцировка поперечно-полосатых мышечных клеток • процесс апоптоза лейкоцитов • регуляция стабильности белка • положительная регуляция образования бета-амилоида • закрытие передней нервной трубки
Каспаза-3 - это белок каспазы, который взаимодействует с каспазой-8 и каспазой-9 . Он кодируется геном CASP3 . Ортологи CASP3 [4] были идентифицированы у многих млекопитающих, по которым доступны полные данные о геноме. Уникальные ортологи также присутствуют у птиц , ящериц , лизамфибий и костистых животных .
CASP3 белок является членом гр ysteine- осины Полярного кислоты PROTE азного ( каспаз семейства). [5] Последовательная активация каспаз играет центральную роль в фазе выполнения апоптоза клеток . Каспазы существуют как неактивные проферменты, которые подвергаются протеолитическому процессингу на консервативных остатках аспарагиновой кислоты с образованием двух субъединиц, большой и малой, которые димеризуются с образованием активного фермента . Этот белок расщепляет и активирует каспазы 6 и 7 ; а сам белок обрабатывается и активируется каспазами 8, 9 и 10.. Это преобладающая каспаза, участвующая в расщеплении белка-предшественника бета-амилоида 4A , что связано с гибелью нейронов при болезни Альцгеймера . [6] Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к появлению двух вариантов транскрипта, кодирующих один и тот же белок. [7]
Сигнальный путь TNF -R1. Пунктирные серые линии представляют несколько шагов
Пути, ведущие к активации каспазы 3. [8]
Каспаза-3 обладает многими типичными характеристиками, общими для всех известных в настоящее время каспаз. Например, его активный сайт содержит остаток цистеина (Cys-163) и остаток гистидина (His-121), которые стабилизируют расщепление пептидной связи белковой последовательности на карбоксиконцевой стороне аспарагиновой кислоты, когда она является частью определенного 4-аминокислотная последовательность. [9] [10] Эта специфичность позволяет каспазам быть невероятно селективными, отдавая предпочтение аспарагиновой кислоте в 20 000 раз перед глутаминовой кислотой . [11] Ключевой особенностью каспаз в клетке является то, что они присутствуют в виде зимогенов., называемые прокаспазами, которые неактивны до тех пор, пока биохимическое изменение не вызовет их активацию. Каждая прокаспаза имеет N-концевую большую субъединицу размером около 20 кДа, за которой следует меньшая субъединица размером около 10 кДа, называемая p20 и p10 соответственно. [12]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Специфичность субстрата
2 Структура
3 Механизм
4 Активация
5 Торможение
6 взаимодействий
7 Биологическая функция
8 См. Также
9 ссылки
10 Дальнейшее чтение
11 Внешние ссылки
Специфичность субстрата [ править ]
В нормальных условиях каспазы распознают тетрапептидные последовательности на своих субстратах и гидролизуют пептидные связи после остатков аспарагиновой кислоты . Каспаза 3 и каспаза 7 обладают сходной субстратной специфичностью за счет распознавания тетрапептидного мотива Asp-xx-Asp. [13] C-концевой Asp абсолютно необходим, в то время как изменения в трех других положениях допускаются. [14] Специфичность субстрата каспазы широко используется при разработке ингибиторов на основе каспаз и лекарственных препаратов. [15]
Структура [ править ]
В частности, каспаза-3 (также известная как СРР32 / Яма / апопаин) [16] [17] [18] образуется из зимогена 32 кДа, который расщепляется на субъединицы 17 кДа и 12 кДа. Когда прокаспаза расщепляется по определенному остатку, активный гетеротетрамер может затем образовываться за счет гидрофобных взаимодействий, в результате чего четыре антипараллельных бета-слоя от p17 и два от p12 объединяются, образуя гетеродимер, который, в свою очередь, взаимодействует с другим гетеродимером. с образованием полной 12-нитевой структуры бета-листа, окруженной альфа-спиралями, которая является уникальной для каспаз. [12] [19] Когда гетеродимеры выравниваются друг с другом, активный сайт располагается на каждом конце молекулы, образованной остатками обеих участвующих субъединиц, хотя необходимые остатки Cys-163 и His-121 находятся на p17 (более крупный ) субъединица. [19]
Субъединицы p12 (розовый) и p17 (голубой) каспазы-3 со структурами бета-листов каждой, выделенными красным и синим цветом, соответственно; изображение сгенерировано в Pymol из 1rhm.pdb
Механизм [ править ]
Каталитический сайт каспазы-3 включает сульфогидрильную группу Cys-163 и имидазольное кольцо His-121. His-121 стабилизирует карбонильную группу ключевого остатка аспартата, в то время как Cys-163 атакует, в конечном итоге разрывая пептидную связь. Cys-163 и Gly-238 также действуют, чтобы стабилизировать тетраэдрическое переходное состояние комплекса субстрат-фермент посредством водородных связей . [19] In vitro было обнаружено, что каспаза-3 предпочитает пептидную последовательность DEVDG (Asp-Glu-Val-Asp-Gly) с расщеплением, происходящим на карбоксильной стороне второго остатка аспарагиновой кислоты (между D и G). [11] [19] [20] Каспаза-3 активна в широком диапазоне pH.диапазон, который немного выше (более базовый), чем у многих других каспасов палачей. Этот широкий диапазон указывает на то, что каспаза-3 будет полностью активна в нормальных и апоптотических условиях клеток. [21]
Cys-285 (желтый) и His-237 (зеленый и темно-синий) в активном центре каспазы-3, субъединица p12 розового цвета и субъединица p17 голубого цвета; изображение сгенерировано в Pymol из 1rhr.pdb
Активация [ править ]
Каспаза-3 активируется в апоптотической клетке как внешним (лиганд смерти), так и внутренним (митохондриальный) путями. [12] [22] Зимогеновая функция каспазы-3 необходима, потому что, если ее не регулировать, активность каспазы будет убивать клетки без разбора. [23] Как каспаза-исполнитель, зимоген каспаза-3 практически не проявляет активности до тех пор, пока не будет расщеплен каспазой-инициатором после того, как произошли события передачи сигналов апоптоза. [24] Одним из таких сигнальных событий является введение гранзима B , который может активировать инициаторные каспазы, в клетки, нацеленные на апоптоз Т-клетками-киллерами . [25] [26] Эта внешняя активация затем запускает характерный каспазный каскад, характерный для апоптотического пути, в котором каспаза-3 играет доминирующую роль. [10] При внутренней активации цитохром с из митохондрий работает в сочетании с каспазой-9 , фактором активации апоптоза 1 ( Apaf-1 ) и АТФ для обработки прокаспазы-3. [20] [26] [27] Этих молекул достаточно для активации каспазы-3 in vitro, но необходимы другие регуляторные белки in vivo . [27]
Мангостин ( Garcinia mangostana) было показано, что экстракт ингибирует активацию каспазы 3 в нейрональных клетках человека, обработанных B-амилоидом. [28]
Запрещение [ править ]
Одним из средств ингибирования каспаз является семейство белков IAP (ингибитор апоптоза), которое включает c-IAP1, c-IAP2, XIAP и ML-IAP. [19] XIAP связывает и ингибирует инициатор каспазу-9, которая непосредственно участвует в активации каспазы-3-исполнителя. [27] Однако во время каспазного каскада каспаза-3 действует, чтобы ингибировать активность XIAP, расщепляя каспазу-9 в определенном месте, предотвращая связывание XIAP и подавление активности каспазы-9. [29]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что каспаза 3 взаимодействует с:
CASP8 [30] [31]
NMT2 [32]
CFLAR [33] [34]
DCC [35]
GroEL [36] [37]
HCLS1 [38] [39]
Выживший [40] [41]
TRAF3 [42] [43]
XIAP [44] [45] [46] [47] [48] [49]
NFE2L2 [50]
Биологическая функция [ править ]
Было обнаружено, что каспаза-3 необходима для нормального развития мозга, а также для ее типичной роли в апоптозе, где она отвечает за конденсацию хроматина и фрагментацию ДНК . [20] Повышенный уровень фрагмента каспазы-3, p17, в кровотоке является признаком недавно перенесенного инфаркта миокарда . [51] В настоящее время показано, что каспаза-3 может играть роль в дифференцировке эмбриональных и гемопоэтических стволовых клеток . [52]
См. Также [ править ]
Карта протеолиза
Caspase
ПАК-1
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031628 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Филогенетический маркер OrthoMaM: кодирующая последовательность CASP3» . Архивировано из оригинала на 2016-03-03 . Проверено 20 декабря 2009 .
^ Харрингтон HA, Ho KL, Гоша S, Tung KC (2008). «Построение и анализ модульной модели активации каспаз при апоптозе» . Теоретическая биология и медицинское моделирование . 5 (1): 26. DOI : 10,1186 / 1742-4682-5-26 . PMC 2672941 . PMID 19077196 .
^ а б Перри Д.К., Смит М.Дж., Стеннике Х.Р., Сальвесен Г.С., Дурье П., Пуарье Г.Г., Ханнун Ю.А. (июль 1997 г.). «Цинк является мощным ингибитором апоптотической протеазы, каспазы-3. Новая мишень для цинка в ингибировании апоптоза» . Журнал биологической химии . 272 (30): 18530–3. DOI : 10.1074 / jbc.272.30.18530 . PMID 9228015 .
^ a b Stennicke HR, Renatus M, Meldal M, Salvesen GS (сентябрь 2000 г.). «Субстраты флуоресцентных пептидов с внутренним гашением раскрывают субсайтовые предпочтения человеческих каспаз 1, 3, 6, 7 и 8» . Биохимический журнал . 350 (2): 563–8. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3500563 . PMC 1221285 . PMID 10947972 .
^ a b c Salvesen GS (январь 2002 г.). «Caspases: открытие ящиков и толкование стрелок». Смерть и дифференциация клеток . 9 (1): 3–5. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4400963 . PMID 11803369 . S2CID 31274387 .
^ Agniswamy J, Fang B, Вебер IT (сентябрь 2007). «Пластичность карманов специфичности S2-S4 экзогенной каспазы-7, выявленная структурным и кинетическим анализом». Журнал FEBS . 274 (18): 4752–65. DOI : 10.1111 / j.1742-4658.2007.05994.x . PMID 17697120 .
^ Fang B, Boross П.И., Tőzsér J, Вебер IT (июль 2006). «Структурный и кинетический анализ каспазы-3 показывает роль сайта связывания s5 в распознавании субстрата». Журнал молекулярной биологии . 360 (3): 654–66. DOI : 10.1016 / j.jmb.2006.05.041 . PMID 16781734 .
^ Weber IT, Fang B, Agniswamy J (октябрь 2008). «Caspases: структурно-управляемый дизайн лекарств для контроля гибели клеток». Миниобзоры по медицинской химии . 8 (11): 1154–62. DOI : 10.2174 / 138955708785909899 . PMID 18855730 .
↑ Fernandes-Alnemri T, Litwack G, Alnemri ES (декабрь 1994 г.). «CPP32, новый апоптотический белок человека, гомологичный белку гибели клеток Caenorhabditis elegans Ced-3 и ферменту, преобразующему бета интерлейкин-1 млекопитающих». Журнал биологической химии . 269 (49): 30761–4. PMID 7983002 .
^ Тевари M, Quan LT, О'Рурк K, Денуайе S, Цзэн Z, Beidler DR, Пуарье Г.Г., Salvesen Г.С., Диксит В.М. (июнь 1995). «Yama / CPP32 beta, гомолог CED-3 млекопитающих, представляет собой CrmA-ингибируемую протеазу, которая расщепляет полимеразу поли (АДФ-рибозы) субстрата гибели». Cell . 81 (5): 801–9. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90541-3 . PMID 7774019 . S2CID 18866447 .
↑ Николсон Д.В., Али А., Торнберри Н.А., Вайланкур Дж. П., Динг С.К., Галант М., Гаро И., Гриффин П.Р., Лейбл М., Лазебник Ю.А. (июль 1995 г.). «Идентификация и ингибирование протеазы ICE / CED-3, необходимой для апоптоза млекопитающих». Природа . 376 (6535): 37–43. Bibcode : 1995Natur.376 ... 37N . DOI : 10.1038 / 376037a0 . PMID 7596430 . S2CID 4240789 .
^ a b c d e Лаврик И. Н., Голкс А., Краммер PH (октябрь 2005 г.). «Каспазы: фармакологические манипуляции с гибелью клеток» . Журнал клинических исследований . 115 (10): 2665–72. DOI : 10.1172 / JCI26252 . PMC 1236692 . PMID 16200200 .
^ a b c Porter AG, Jänicke RU (февраль 1999 г.). «Новые роли каспазы-3 в апоптозе» . Смерть и дифференциация клеток . 6 (2): 99–104. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4400476 . PMID 10200555 .
^ Stennicke HR, Salvesen GS (октябрь 1997). «Биохимические характеристики каспаз-3, -6, -7 и -8» . Журнал биологической химии . 272 (41): 25719–23. DOI : 10.1074 / jbc.272.41.25719 . PMID 9325297 .
^ Гавы S, Хашее М, Андэ SR, Yeganeh В, Ее Вт, Eshraghi М, автобус CJ, Kadkhoda К, Wiechec Е, Halayko AJ, Лос - М (август 2009 г.). «Апоптоз и рак: мутации в генах каспаз» . Журнал медицинской генетики . 46 (8): 497–510. DOI : 10.1136 / jmg.2009.066944 . PMID 19505876 .
^ Ботрайт KM, Salvesen GS (декабрь 2003). «Механизмы активации каспаз». Текущее мнение в клеточной биологии . 15 (6): 725–31. DOI : 10.1016 / j.ceb.2003.10.009 . PMID 14644197 .
Перейти ↑ Walters J, Pop C, Scott FL, Drag M, Swartz P, Mattos C, Salvesen GS, Clark AC (декабрь 2009 г.). «Постоянно активный и не ингибируемый зимоген каспазы-3 эффективно индуцирует апоптоз» . Биохимический журнал . 424 (3): 335–45. DOI : 10.1042 / BJ20090825 . PMC 2805924 . PMID 19788411 .
^ Галлахер BW, Хилла R, Raile K, Kiess W (сентябрь 2001). «Апоптоз: живи или умри - в любом случае упорный труд!». Гормоны и метаболические исследования . 33 (9): 511–9. DOI : 10,1055 / с-2001-17213 . PMID 11561209 .
^ a b Катунума Н., Мацуи А., Ле QT, Уцуми К., Сальвесен Г., Охаши А. (2001). «Новый каскад активации прокаспазы-3, опосредованный лизоапоптазами, и его биологическое значение в апоптозе». Достижения в регуляции ферментов . 41 (1): 237–50. DOI : 10.1016 / S0065-2571 (00) 00018-2 . PMID 11384748 .
^ a b c Ли П., Ниджхаван Д., Ван X (январь 2004 г.). «Митохондриальная активация апоптоза». Cell . 116 (2 доп): С57–9, 2 п после С59. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (04) 00031-5 . PMID 15055583 . S2CID 5180966 .
^ Moongkarndi P, Srisawat C, Saetun P, Jantaravinid J, Peerapittayamongkol C, Soi-ampornkul R, Junnu S, Sinchaikul S, Chen ST, Charoensilp P, Thongboonkerd V, Neungton N (май 2010 г.). «Защитный эффект экстракта мангустана против цитотоксичности, вызванной бета-амилоидом, окислительного стресса и измененного протеома в клетках SK-N-SH». Журнал протеомных исследований . 9 (5): 2076–86. DOI : 10.1021 / pr100049v . PMID 20232907 .
^ Го У, Srinivasula С.М., Druilhe А, Fernandes-Alnemri Т, Alnemri Е.С. (апрель 2002 г.). «Каспаза-2 вызывает апоптоз, высвобождая проапоптотические белки из митохондрий» . Журнал биологической химии . 277 (16): 13430–7. DOI : 10.1074 / jbc.M108029200 . PMID 11832478 .
↑ Srinivasula SM, Ahmad M, Fernandes-Alnemri T, Litwack G, Alnemri ES (декабрь 1996 г.). «Молекулярное упорядочение Fas-апоптотического пути: протеаза Fas / APO-1 Mch5 представляет собой CrmA-ингибируемую протеазу, которая активирует множество Ced-3 / ICE-подобных цистеиновых протеаз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (25): 14486–91. Bibcode : 1996PNAS ... 9314486S . DOI : 10.1073 / pnas.93.25.14486 . PMC 26159 . PMID 8962078 .
^ Selvakumar, P .; Шарма, РК. (Май 2007 г.). «Роль системы кальпаина и каспазы в регуляции N-миристоилтрансферазы при раке толстой кишки человека (обзор)» . Int J Mol Med . 19 (5): 823–7. DOI : 10.3892 / ijmm.19.5.823 . PMID 17390089 .
^ Шу HB, Halpin DR, Goeddel DV (июнь 1997). «Каспер является индуктором апоптоза, связанным с FADD и каспазой». Иммунитет . 6 (6): 751–63. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 80450-1 . PMID 9208847 .
Перейти ↑ Han DK, Chaudhary PM, Wright ME, Friedman C, Trask BJ, Riedel RT, Baskin DG, Schwartz SM, Hood L (октябрь 1997 г.). «MRIT, новый белок, содержащий эффекторный домен смерти, взаимодействует с каспазами и BclXL и инициирует гибель клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (21): 11333–8. Bibcode : 1997PNAS ... 9411333H . DOI : 10.1073 / pnas.94.21.11333 . PMC 23459 . PMID 9326610 .
^ Forcet C, Ye X, Granger L, Corset V, Shin H, Bredesen DE, Mehlen P (март 2001 г.). «Рецептор зависимости DCC (удаленный при колоректальном раке) определяет альтернативный механизм активации каспазы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (6): 3416–21. Bibcode : 2001PNAS ... 98.3416F . DOI : 10.1073 / pnas.051378298 . PMC 30668 . PMID 11248093 .
^ Samali А, Кай Дж, Животовский В, Джонс ДП, Orrenius S (апрель 1999 г.). «Присутствие преапоптотического комплекса прокаспазы-3, Hsp60 и Hsp10 в митохондриальной фракции клеток jurkat» . Журнал EMBO . 18 (8): 2040–8. DOI : 10.1093 / emboj / 18.8.2040 . PMC 1171288 . PMID 10205158 .
^ Xanthoudakis S, Рой S, D Rasper, Хеннесси Т, Аубин Y, R Кассади, Tawa Р, Р Рюэль, Розен А, Николсона DW (апрель 1999 г.). «Hsp60 ускоряет созревание прокаспазы-3 под действием протеаз-активаторов во время апоптоза» . Журнал EMBO . 18 (8): 2049–56. DOI : 10.1093 / emboj / 18.8.2049 . PMC 1171289 . PMID 10205159 .
^ Ruzzene M, Penzo D, Пина LA (май 2002). «Ингибитор протеинкиназы CK2, 4,5,6,7-тетрабромбензотриазол (TBB) индуцирует апоптоз и каспазозависимую деградацию гематопоэтического клеточно-специфического белка 1 (HS1) в клетках Jurkat» . Биохимический журнал . 364 (Pt 1): 41–7. DOI : 10.1042 / bj3640041 . PMC 1222543 . PMID 11988074 .
↑ Chen YR, Kori R, John B, Tan TH (ноябрь 2001 г.). «Опосредованное каспазой расщепление актин-связывающих и содержащих SH3-домен белков кортактина, HS1 и HIP-55 во время апоптоза». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 288 (4): 981–9. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.5862 . PMID 11689006 .
^ Тамм Я, Ван Y, Sausville E, Scudiero DA, Винья N, Oltersdorf T, Reed JC (декабрь 1998). «Белок семейства IAP сурвивин ингибирует активность каспаз и апоптоз, индуцированные Fas (CD95), Bax, каспазами и противораковыми препаратами». Исследования рака . 58 (23): 5315–20. PMID 9850056 .
↑ Shin S, Sung BJ, Cho YS, Kim HJ, Ha NC, Hwang JI, Chung CW, Jung YK, Oh BH (январь 2001). «Антиапоптотический белок сурвивин человека является прямым ингибитором каспазы-3 и -7». Биохимия . 40 (4): 1117–23. DOI : 10.1021 / bi001603q . PMID 11170436 .
^ Ли ZH, Ли SE, Квак K, Yeo W, Lee TH, Bae SS, Suh П.Г., Ким HH (март 2001). «Опосредованное каспазой расщепление TRAF3 в FasL-стимулированных клетках Jurkat-T». Журнал биологии лейкоцитов . 69 (3): 490–6. PMID 11261798 .
^ Leo E, Деверо QL, Buchholtz C, Welsh K, S Matsuzawa, Stennicke HR, Salvesen GS, Рид JC (март 2001). «TRAF1 представляет собой субстрат каспаз, активируемых во время апоптоза, индуцированного рецептором-альфа фактора некроза опухоли» . Журнал биологической химии . 276 (11): 8087–93. DOI : 10.1074 / jbc.M009450200 . PMID 11098060 .
^ Сузуки Y, Nakabayashi Y, R Такахаши (июль 2001 г.). «Убиквитин-протеинлигазная активность X-связанного ингибитора апоптозного белка способствует протеасомной деградации каспазы-3 и усиливает его антиапоптотический эффект при гибели клеток, индуцированной Fas» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (15): 8662–7. Bibcode : 2001PNAS ... 98.8662S . DOI : 10.1073 / pnas.161506698 . PMC 37492 . PMID 11447297 .
^ Silke J, Hawkins CJ, Экерт П., Chew J, День CL, Pakusch M, Verhagen AM, Вокс DL (апрель 2002). «Антиапоптотическая активность XIAP сохраняется при мутации сайтов, взаимодействующих как с каспазой 3, так и с каспазой 9» . Журнал клеточной биологии . 157 (1): 115–24. DOI : 10.1083 / jcb.200108085 . PMC 2173256 . PMID 11927604 .
↑ Riedl SJ, Renatus M, Schwarzenbacher R, Zhou Q, Sun C, Fesik SW, Liddington RC, Salvesen GS (март 2001 г.). «Структурная основа ингибирования каспазы-3 с помощью XIAP». Cell . 104 (5): 791–800. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00274-4 . PMID 11257232 . S2CID 17915093 .
^ Рой N, Деверо QL, Takahashi R, Salvesen GS, Reed JC (декабрь 1997). «Белки c-IAP-1 и c-IAP-2 являются прямыми ингибиторами конкретных каспаз» . Журнал EMBO . 16 (23): 6914–25. DOI : 10.1093 / emboj / 16.23.6914 . PMC 1170295 . PMID 9384571 .
^ Сузуки Y, Nakabayashi Y, Наката К, Рид JC, Такахаши R (июль 2001 г.). «Х-связанный ингибитор белка апоптоза (XIAP) ингибирует каспазу-3 и -7 разными способами» . Журнал биологической химии . 276 (29): 27058–63. DOI : 10.1074 / jbc.M102415200 . PMID 11359776 .
^ Охцубо Т, Камада S, Мики Т, Мураки Н, Цудзимото Y (сентябрь 1999 г.). «Идентификация NRF2, члена семейства транскрипционных факторов NF-E2, в качестве субстрата для каспазо-3 (-подобных) протеаз» . Смерть и дифференциация клеток . 6 (9): 865–72. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4400566 . PMID 10510468 .
^ Агостен M, Azrin M, Singh K, Джаффе AS, Лян BT (январь 2011). «Фрагмент каспазы-3 p17 в сыворотке повышен у пациентов с инфарктом миокарда с подъемом сегмента ST: новое наблюдение» . Журнал Американского колледжа кардиологии . 57 (2): 220–1. DOI : 10.1016 / j.jacc.2010.08.628 . PMID 21211695 .
^ Абдул-Гани M, Megeney LA (июнь 2008). «Реабилитация контрактного убийцы: каспаза-3 управляет дифференцировкой стволовых клеток». Стволовая клетка . 2 (6): 515–6. DOI : 10.1016 / j.stem.2008.05.013 . PMID 18522841 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Коэн GM (август 1997 г.). «Каспасы: палачи апоптоза» . Биохимический журнал . 326 (Pt 1): 1–16. DOI : 10.1042 / bj3260001 . PMC 1218630 . PMID 9337844 .
Роиг Дж., Трау Дж. А. (2001). Цитостатическая протеинкиназа p21 G, активируемая гамма-PAK . Витамины и гормоны. 62 . С. 167–98. DOI : 10.1016 / S0083-6729 (01) 62004-1 . ISBN 9780127098623. PMID 11345898 .
Чжао Л.Дж., Чжу Х. (декабрь 2004 г.). «Структура и функция вспомогательного регуляторного белка ВИЧ-1 Vpr: новые ключи к разработке лекарств». Текущие цели в отношении лекарств. Иммунные, эндокринные и метаболические нарушения . 4 (4): 265–75. DOI : 10.2174 / 1568008043339668 . PMID 15578977 .
Ле Рузик Э, Бенишу С (2006). «Белок Vpr из ВИЧ-1: различные роли в жизненном цикле вируса» . Ретровирология . 2 (1): 11. DOI : 10,1186 / 1742-4690-2-11 . PMC 554975 . PMID 15725353 .
Сайкс М.С., Моубрей А.Л., Джо Х. (февраль 2007 г.). «Обратимое глутатиолирование каспазы-3 глутаредоксином как новый механизм передачи сигналов окислительно-восстановительного потенциала при гибели клеток, вызванной фактором некроза опухоли альфа» . Циркуляционные исследования . 100 (2): 152–4. DOI : 10.1161 / 01.RES.0000258171.08020.72 . PMID 17272816 .
Внешние ссылки [ править ]
Викискладе есть медиафайлы по теме Caspase 3 .
Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: C14.003
Апоптоз и каспаза 3 - карта протеолиза - анимация
vтеPDB галерея
1cp3 : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА АПОПАИНА С ИНГИБИТОРОМ ТЕТРАПЕПТИДА ACE-DVAD-FMC
1gfw : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КАСПАЗЫ-3 (АПОПАИН ИЛИ CPP32) 2.8 В КОМПЛЕКСЕ С ИНГИБИТОРОМ СУЛЬФОНАМИДА ИСАТИНА.
1i3o : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА XIAP-BIR2 И CASPASE 3
1nme : Структура касп -3 с привязанным салицилатом
1nmq : Extendend Tethering: сборка ингибиторов на месте
1 нм : каспаза -3 привязана к необратимому ингибитору
1pau : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА АПОПАИНА С ИНГИБИТОРОМ ТЕТРАПЕПТИДА АЛЬДЕГИДА AC-DEVD-CHO
1qx3 : Конформационные ограничения в активном центре нелигандированной человеческой каспазы-3
1re1 : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КАСПАЗЫ-3 С ИНГИБИТОРОМ АЛЬДЕГИДА НИКОТИНОВОЙ КИСЛОТЫ
1rhj : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА КАСПАЗЫ-3 С ИНГИБИТОРОМ ПРИЗИНОНА
1rhk : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА КАСПАЗЫ-3 С ИНГИБИТОРОМ ФЕНИЛПРОПИЛКЕТОНА
1rhm : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА КАСПАЗЫ-3 С ИНГИБИТОРОМ АЛЬДЕГИДА НИКОТИНОВОЙ КИСЛОТЫ
1rhq : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА КАСПАЗЫ-3 С БРОМОМЕТОКСИФЕНИЛОВЫМ ИНГИБИТОРОМ
1rhr : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА КАСПАЗЫ-3 С ИНГИБИТОРОМ МЕТИЛЭФИРА ЦИННАМИНОВОЙ КИСЛОТЫ
1rhu : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА КОМПЛЕКСА КАСПАЗЫ-3 С ТРИЦИКЛИЧЕСКИМ ПЕПТИДОМИМЕТИЧЕСКИМ ИНГИБИТОРОМ 5,6,7
2c1e : КРИСТАЛЛИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ КАСПАЗЫ-3 В КОМПЛЕКСЕ С ИНГИБИТОРАМИ АЗА-ПЕПТИДНЫХ АКЦЕПТОРОВ МАЙКЛА.
2c2k : КРИСТАЛЛИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ КАСПАЗЫ-3 В КОМПЛЕКСЕ С ИНГИБИТОРАМИ АЗА-ПЕПТИДНЫХ АКЦЕПТОРОВ МАЙКЛА.
2c2m : КРИСТАЛЛИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ КАСПАЗЫ-3 В КОМПЛЕКСЕ С ИНГИБИТОРАМИ АЗА-ПЕПТИДНЫХ АКЦЕПТОРОВ МАЙКЛА.
2c2o : КРИСТАЛЛИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ КАСПАЗЫ-3 В КОМПЛЕКСЕ С ИНГИБИТОРАМИ АЗА-ПЕПТИДНЫХ АКЦЕПТОРОВ МАЙКЛА.
2cdr : КРИСТАЛЛИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ КАСПАЗЫ-3 В КОМПЛЕКСЕ С ИНГИБИТОРАМИ ЭПОКСИДА АЗА-ПЕПТИДА.
2cjx : РАСШИРЕННОЕ РАСПОЗНАВАНИЕ ПОДЛОЖКИ В CASPASE-3, ВЫЯВЛЕННОЕ АНАЛИЗОМ РЕНТГЕНОВСКОЙ СТРУКТУРЫ ВЫСОКОГО РАЗРЕШЕНИЯ
2cjy : РАСШИРЕННОЕ РАСПОЗНАВАНИЕ СУБСТРАТА В CASPASE-3, ВЫЯВЛЕННОЕ ПРИ АНАЛИЗЕ РЕНТГЕНОВСКОЙ СТРУКТУРЫ ВЫСОКОГО РАЗРЕШЕНИЯ
2cnk : КРИСТАЛЛИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ КАСПАЗЫ-3 В КОМПЛЕКСЕ С ИНГИБИТОРАМИ ЭПОКСИДА АЗА-ПЕПТИДА.
2cnl : КРИСТАЛЛИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ КАСПАЗЫ-3 В КОМПЛЕКСЕ С ИНГИБИТОРАМИ ЭПОКСИДА АЗА-ПЕПТИДА.
2cnn : КРИСТАЛЛИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ КАСПАЗЫ-3 В КОМПЛЕКСЕ С ИНГИБИТОРАМИ ЭПОКСИДА АЗА-ПЕПТИДА.
2cno : КРИСТАЛЛИЧЕСКИЕ СТРУКТУРЫ КАСПАЗЫ-3 В КОМПЛЕКСЕ С ИНГИБИТОРАМИ ЭПОКСИДА АЗА-ПЕПТИДА.
2dko : расширенное распознавание субстрата в каспазе-3, выявленное с помощью рентгеноструктурного анализа с высоким разрешением
2h5i : Кристаллическая структура каспазы-3 с ингибитором Ac-DEVD-Cho
2h5j : Кристаллическая структура каспазы-3 с ингибитором Ac-DMQD-Cho
2h65 : Структура кристаллов каспазы-3 с ингибитором Ac-VDVAD-Cho.
2j30 : РОЛЬ ВОДОРОДНЫХ СВЯЗЕЙ В ПЕТЛЕВОЙ ПУЧКЕ В СОЗРЕВАНИИ И АКТИВНОСТИ (PRO) CASPASE-3
2j31 : РОЛЬ ВОДОРОДНЫХ СВЯЗЕЙ В ЗРЕЛЕВАНИИ И АКТИВНОСТИ (PRO) CASPASE-3
2j32 : РОЛЬ ВОДОРОДНЫХ СВЯЗЕЙ В ПЕТЛЕВОЙ ПУЧКЕ В СОЗРЕВАНИИ И АКТИВНОСТИ (PRO) CASPASE-3
2j33 : РОЛЬ ВОДОРОДНЫХ СВЯЗЕЙ В ЗРЕЛЕВАНИИ И АКТИВНОСТИ (PRO) CASPASE-3