3BLH , 3BLQ , 3BLR , 3LQ5 , 3MI9 , 3MIA , 3MY1 , 3TN8 , 3TNH , 3TNI , 4BCF , 4BCG , 4BCH , 4BCI , 4BCJ , 4EC8 , 4EC9 , 4IMY , 4OGR , 4OR5
Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства циклин-зависимых киназ (CDK). Члены семейства CDK очень похожи на генные продукты S. cerevisiae cdc28 и S. pombe cdc2 и известны как важные регуляторы клеточного цикла. Было обнаружено, что эта киназа является компонентом мультибелкового комплекса TAK/P-TEFb, который является фактором элонгации для транскрипции, направленной РНК-полимеразой II, и действует путем фосфорилирования С -концевого домена крупнейшей субъединицы РНК-полимеразы II . Этот белок образует комплекс с его регуляторной субъединицей циклином Т или циклином К и регулируется ими. Было обнаружено, что белок Tat ВИЧ-1 взаимодействует с этим белком и циклином Т, что предполагает возможное участие этого белка в развитии СПИДа. [5]
Также известно, что CDK9 связывается с другими белками, такими как TRAF2 , и участвует в дифференцировке скелетных мышц. [6]
На основании результатов молекулярного докинга лиганды-3, 5, 14 и 16 были проверены среди 17 различных пирролон-конденсированных бензосубереновых соединений как мощные и специфические ингибиторы без какой-либо перекрестной реактивности против различных изоформ CDK. Анализ MD-моделирования и исследований MM-PBSA выявил профили энергии связи всех выбранных комплексов. Выбранные лиганды показали лучшие результаты, чем экспериментальный препарат-кандидат (росковитин). Лиганды-5 и 16 проявляют специфичность к CDK9. Ожидается, что эти лиганды будут обладать меньшим риском побочных эффектов из-за их природного происхождения. [7]