Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
DAPK1
Белок DAPK1 PDB 1ig1.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1IG1 , 1JKK , 1JKL , 1JKS , 1JKT , 1P4F , 1WVX , 1WVY , 1YR5 , 2W4J , 2W4K , 2X0G , 2XUU , 2XZS , 2Y0A , 2Y4P , 2Y4V , 2YAK , 3DFC , 3DGK , 3EH9 , 3EHA , 3F5G , 3F5U , 3GU4 , 3GU5 , 3GU6, 3GU7 , 3GU8 , 3GUB , 3ZXT , 4B4L , 4PF4 , 4TL0 , 4TXC , 4UV0 , 4YO4 , 4YPD , 5AUW , 5AUU , 5AV1 , 5AUY , 5AUT , 5AUX , 5AUV , 5AUZ , 5AV0 , 5AV4 , 5AV2 , 5AV3

Идентификаторы
ПсевдонимыDAPK1 , DAPK, протеинкиназа 1, ассоциированная со смертью, ROCO3
Внешние идентификаторыOMIM : 600831 MGI : 1916885 HomoloGene : 3626 GeneCards : DAPK1
Расположение гена ( человек )
Chr.Хромосома 9 (человек) [1]
Группа9q21.33Начинать87 497 228 п.н. [1]
Конец87 708 634 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Chr.Хромосома 13 (мышь) [2]
Группа13 B2 | 13 32,53 смНачинать60 601 947 п.н. [2]
Конец60 763 191 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК


Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• трансферазной активности
• связывание нуклеотид
• связывание ГТФ
• синтаксин-1 связывания
• активность киназы
• GO: связывание 0001948 белок
• идентичный связывания с белками
• кальмодулин-зависимой протеинкиназы активности
• белка серин / треонин киназы
• кальмодулин связывания
• АТФ связывания
• протеинкиназа Мероприятия
Сотовый компонент• клеточная мембрана
• актиновый цитоскелет
• цитоскелет
• цитоплазма
• ядро клетки
Биологический процесс• регуляция апоптотического процесса
• негативная регуляция трансляции
• фосфорилирование
• негативная регуляция апоптотического процесса
• позитивная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующая в апоптотическом процессе
• регуляция аутофагии
• негативная регуляция внешнего пути апоптотической передачи сигналов через рецепторы домена смерти
• передача сигналов апоптоза путь
• аутофосфорилирование
• регуляция трансляции
• внешний апоптотический сигнальный путь через рецепторы домена смерти
• сигнальная трансдукция
• апоптотический процесс
• регуляция активности рецептора NMDA
• фосфорилирование белков
• положительная регуляция аутофагии
• передача внутриклеточного сигнала GO: 0007243
• клеточный ответ на интерферон-гамма
• клеточный ответ на гидропероксид
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1612

69635

Ансамбль

ENSG00000196730

ENSMUSG00000021559

UniProt

P53355

Q80YE7

RefSeq (мРНК)

NM_001288729
NM_001288730
NM_001288731
NM_004938

NM_001285917
NM_029653
NM_134062

RefSeq (белок)

NP_001275658
NP_001275659
NP_001275660
NP_004929

NP_001272846
NP_083929
NP_598823

Расположение (UCSC)Chr 9: 87,5 - 87,71 МбChr 13: 60,6 - 60,76 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Смерть-ассоциированный белок киназа 1 представляет собой фермент , который у человека кодируется DAPK1 геном . [5]

Функция [ править ]

Связанная со смертью протеинкиназа 1 является позитивным медиатором запрограммированной гибели клеток, индуцированной гамма-интерфероном. DAPK1 кодирует уникальную по структуре кальмодулинзависимую серин-треонин киназу 160 кДа, которая несет 8 анкириновых повторов и 2 предполагаемых консенсусных сайта P-петли. Это кандидат в супрессоры опухолей. [6]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена DAPK1 может регулироваться MITF . [7]

В качестве мишени для наркотиков [ править ]

Истощение DAPK1 приводит к ингибированию количества опухолевых клеток и роста объема в клеточных и животных моделях тройного рецепторно-отрицательного рака молочной железы у лиц с мутантным p53 раком. [8] Это не было продемонстрировано на реальных пациентах.

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196730 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021559 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Феинстеин Е, Т Друк, Kastury К, Berissi Н, Goodart С.А., Оверхаузера Дж, кимчи А, Хюбнер К (сентябрь 1995). «Присвоение DAP1 и DAPK - генов, которые положительно опосредуют запрограммированную гибель клеток, вызванную IFN-гамма, - участкам хромосом 5p12.2 и 9q34.1, соответственно». Геномика . 29 (1): 305–7. DOI : 10.1006 / geno.1995.1255 . PMID 8530096 . 
  6. ^ «Энтрез Ген: протеинкиназа 1, связанная со смертью DAPK1» .
  7. ^ Хоек К.С., Шлегель NC, Eichhoff ОМ, Уидмер Д.С., Преториус С, Эйнарсон ТАК, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir К, Schepsky А, Dummer Р, Steingrimsson Е (декабрь 2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов» . Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 665–76. DOI : 10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971 . S2CID 24698373 .  
  8. ^ Чжао J, Чжао Д, Poage Г.М., Мазумдар А, Чжан У, Хилл ДЛ, Хартман ZC, Savage М.И., Миллс ГБ, Браун PH (июль 2015). «Связанная со смертью протеинкиназа 1 способствует росту мутантных по р53 раковых опухолей» . Журнал клинических исследований . 125 (7): 2707–20. DOI : 10.1172 / JCI70805 . PMC 4563671 . PMID 26075823 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Deiss LP, Feinstein E, Berissi H, Cohen O, Kimchi A (январь 1995 г.). «Идентификация новой серин / треонинкиназы и нового белка массой 15 кДа как потенциальных медиаторов гибели клеток, индуцированной гамма-интерфероном» . Гены и развитие . 9 (1): 15–30. DOI : 10,1101 / gad.9.1.15 . PMID  7828849 .
  • Инбал Б., Шани Дж., Коэн О., Киссил Дж. Л., Кимчи А. (февраль 2000 г.). «Связанный со смертью протеинкиназ-родственный протеин 1, новая серин / треониновая киназа, участвующая в апоптозе» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (3): 1044–54. DOI : 10.1128 / MCB.20.3.1044-1054.2000 . PMC  85221 . PMID  10629061 .
  • Джин И, Блю Е.К., Диксон С., Хоу Л., Высолмерски Р.Б., Галлахер П.Дж. (октябрь 2001 г.). «Идентификация новой формы протеинкиназы, связанной со смертью, которая способствует выживанию клеток» . Журнал биологической химии . 276 (43): 39667–78. DOI : 10.1074 / jbc.M101886200 . PMC  2823794 . PMID  11485996 .
  • Шохат Г., Спивак-Кройзман Т., Коэн О., Бялик С., Шани Г., Берриси Х., Эйзенштейн М., Кимчи А. (декабрь 2001 г.). «Проапоптотическая функция ассоциированной со смертью протеинкиназы контролируется уникальным тормозным механизмом, основанным на аутофосфорилировании» . Журнал биологической химии . 276 (50): 47460–7. DOI : 10.1074 / jbc.M105133200 . PMID  11579085 .
  • Сория Дж. К., Родригес М., Лю Д. Д., Ли Дж. Дж., Хун В. К., Мао Л. (январь 2002 г.). «Аберрантное метилирование промотора нескольких генов в образцах щетки бронхов от бывших курильщиков сигарет». Исследования рака . 62 (2): 351–5. PMID  11809677 .
  • Ларраменди М.Л., Ниини Т., Элонен Э., Надь Б., Оллила Дж., Вихинен М., Кнуутила С. (июнь 2002 г.). «Сверхэкспрессия связанных с транслокацией гибридных генов FGFRI, MYC, NPMI и DEK, но отсутствие транслокаций при остром миелоидном лейкозе. Анализ микроматрицы». Haematologica . 87 (6): 569–77. PMID  12031912 .
  • Hasegawa M, Nelson HH, Peters E, Ringstrom E, Posner M, Kelsey KT (июнь 2002 г.). «Паттерны метилирования промотора генов при плоскоклеточном раке головы и шеи» . Онкоген . 21 (27): 4231–6. DOI : 10.1038 / sj.onc.1205528 . PMID  12082610 .
  • Джин И, Блю Е.К., Диксон С., Шао З., Галлахер П.Дж. (декабрь 2002 г.). «Белок, взаимодействующий с протеинкиназой, ассоциированной со смертью (DAPK), DIP-1, представляет собой убиквитинлигазу E3, которая способствует апоптозу, вызванному фактором некроза опухоли, и регулирует клеточные уровни DAPK» . Журнал биологической химии . 277 (49): 46980–6. DOI : 10.1074 / jbc.M208585200 . PMC  2824503 . PMID  12351649 .
  • Ван WJ, Kuo JC, Yao CC, Chen RH (октябрь 2002 г.). «DAP-киназа индуцирует апоптоз путем подавления активности интегрина и нарушения сигналов выживания матрикса» . Журнал клеточной биологии . 159 (1): 169–79. DOI : 10,1083 / jcb.200204050 . PMC  2173490 . PMID  12370243 .
  • Накацука С., Такакува Т., Томита Ю., Хосида Ю., Нишиу М., Ямагути М., Нишии К., Ян В.И., Аозаса К. (январь 2003 г.). «Гиперметилирование CpG-островка киназы ассоциированного со смертью протеина (DAP) часто встречается не только в B-клетках, но также при злокачественных новообразованиях Т- и естественных киллеров (NK) / Т-клеток» . Наука о раке . 94 (1): 87–91. DOI : 10.1111 / j.1349-7006.2003.tb01357.x . PMID  12708480 . S2CID  11818957 .
  • Тиан Дж. Х., Дас С., Шэн Чж. (Июль 2003 г.). «Са2 + -зависимое фосфорилирование синтаксина-1A киназой ассоциированного со смертью белка (DAP) регулирует его взаимодействие с Munc18» . Журнал биологической химии . 278 (28): 26265–74. DOI : 10.1074 / jbc.M300492200 . PMID  12730201 .
  • Гонсалес-Гомес П., Белло М. Дж., Алонсо М. Е., Ломас Дж., Арджона Д., Аминьосо С., Де Кампос Дж. М., Исла А., Гутьеррес М., Рей Дж. А. (2004). «Частое гиперметилирование промотора протеинкиназы, связанное со смертью, при метастазах солидных опухолей в мозг». Отчеты онкологии . 10 (4): 1031–3. doi : 10.3892 / или 10.4.1031 . PMID  12792765 .
  • Мацумото Х., Нагао М., Огава С., Канехиро Х., Хисанага М., Ко С., Икеда Н., Фуджи Х., Кояма Ф., Мукогава Т., Накадзима Y (2003). «Прогностическое значение экспрессии ассоциированной со смертью протеинкиназы в гепатоцеллюлярных карциномах». Противораковые исследования . 23 (2B): 1333–41. PMID  12820391 .
  • Хеншалл, округ Колумбия, Араки Т., Шиндлер К.К., Шинода С., Лан Дж.К., Саймон Р.П. (сентябрь 2003 г.). «Экспрессия ассоциированной со смертью протеинкиназы и вовлечение в сигнальный путь фактора некроза опухоли после коротких припадков» . Журнал нейрохимии . 86 (5): 1260–70. DOI : 10.1046 / j.1471-4159.2003.01934.x . PMID  12911633 . S2CID  21971958 .
  • Voso MT, Scardocci A, Guidi F, Zini G, Di Mario A, Pagano L, Hohaus S, Leone G (январь 2004 г.). «Аберрантное метилирование DAP-киназы при лечении острого миелоидного лейкоза и миелодиспластических синдромов» . Кровь . 103 (2): 698–700. DOI : 10,1182 / кровь 2003-07-2249 . PMID  14504087 .
  • Джин И, Галлахер П.Дж. (декабрь 2003 г.). «Антисмысловое истощение ассоциированной со смертью протеинкиназы способствует апоптозу» . Журнал биологической химии . 278 (51): 51587–93. DOI : 10.1074 / jbc.M309165200 . PMC  2823796 . PMID  14530257 .
  • Ким В.С., Сон Х.Дж., Пак Джо, Сон С.Ю., Пак Си (декабрь 2003 г.). «Метилирование промотора и подавление DAPK связано с атрофией желудка». Международный журнал молекулярной медицины . 12 (6): 827–30. DOI : 10.3892 / ijmm.12.6.827 . PMID  14612952 .
  • Бай Т., Танака Т., Юкава К., Маэда М., Умесаки Н. (март 2004 г.). «Сниженная экспрессия ассоциированной со смертью протеинкиназы в клетках карциномы матки и яичников человека». Отчеты онкологии . 11 (3): 661–5. doi : 10.3892 / или 11.3.661 . PMID  14767518 .


  • v
  • т
  • е