Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Решение о том, следует ли и как обмениваться данными, часто остается за исследователями.

Обмен данными - это практика предоставления данных, используемых для научных исследований, другим исследователям. Многие финансирующие агентства, учреждения и места публикации имеют политику в отношении обмена данными, потому что прозрачность и открытость многие считают частью научного метода . [1]

Ряд финансирующих агентств и научных журналов требуют от авторов рецензируемых статей предоставлять любую дополнительную информацию ( необработанные данные , статистические методы или исходный код ), необходимую для понимания, разработки или воспроизведения опубликованных исследований. Многие научные исследования не подчиняются требованиям совместного использования данных, и многие из этих правил имеют либеральные исключения. В отсутствие каких-либо обязательных требований обмен данными остается на усмотрение самих ученых. Кроме того, в определенных ситуациях правительства [2]и учреждения запрещают или строго ограничивают обмен данными для защиты интересов собственности, национальной безопасности и конфиденциальности субъекта / пациента / жертвы. Обмен данными также может быть ограничен для защиты учреждений и ученых от использования данных в политических целях.

Данные и методы могут быть запрошены у автора спустя годы после публикации. Чтобы поощрять обмен данными [3] и предотвращать потерю или повреждение данных, ряд финансирующих агентств и журналов установили политику архивирования данных . Доступ к публично архивным данным - это недавнее событие в истории науки, которое стало возможным благодаря технологическим достижениям в области связи и информационных технологий.. Чтобы в полной мере воспользоваться преимуществами современной быстрой связи, может потребоваться консенсусное согласие по критериям, лежащим в основе взаимного признания соответствующих вкладов. Известные модели улучшения своевременного обмена данными для более эффективного реагирования на возникающие угрозы инфекционных заболеваний включают механизм обмена данными, введенный инициативой GISAID . [4] [5]

Несмотря на политику совместного использования и архивирования данных, утаивание данных по-прежнему имеет место. Авторы могут не архивировать данные или архивировать только часть данных. Отсутствие архивирования данных само по себе не является удержанием данных. Когда исследователь запрашивает дополнительную информацию, автор иногда отказывается ее предоставить. [6] Когда авторы утаивают подобные данные, они рискуют потерять доверие научного сообщества. [7]

Совместное использование данных может также указывать на обмен личной информацией на платформе социальных сетей.

Политика правительства США [ править ]

Федеральный закон [ править ]

9 августа 2007 года президент Буш подписал Закон Америки КОНКУРЕНТ (или Закон « Америка создает возможности для значимого продвижения передового опыта в области технологий, образования и науки»), требующий от гражданских федеральных агентств предоставления руководящих принципов, политик и процедур для облегчения и оптимизации открытый обмен данными и исследованиями между агентствами, общественностью и политиками. См. Раздел 1009. [8]

Политика обмена данными NIH [ править ]

Заявление о политике предоставления грантов Национального института здравоохранения (NIH) определяет «данные» как «записанную информацию, независимо от формы или носителя, на котором они могут быть записаны, и включает письменные материалы, фильмы, звукозаписи, графические репродукции, рисунки, рисунки и т. Д. или другие графические изображения, инструкции по процедурам, формы, диаграммы, схемы рабочих процессов , описания оборудования, файлы данных, программы обработки данных или компьютерные программы (программное обеспечение), статистические записи и другие данные исследований ».

-  Совет по связям с властями [9]

В Заключительном заявлении NIH об обмене данными исследований говорится:

«NIH подтверждает свою поддержку концепции обмена данными. Мы считаем, что обмен данными необходим для ускоренного преобразования результатов исследований в знания, продукты и процедуры для улучшения здоровья человека. NIH одобряет обмен окончательными данными исследований для достижения этих и других важных научных целей. NIH ожидает и поддерживает своевременный выпуск и совместное использование окончательных данных исследований, поддерживаемых NIH, для использования другими исследователями. «NIH признает, что исследователи, которые собирают данные, имеют законный интерес в получении выгоды от затраченных ими времени и усилий. Поэтому мы пересмотрели наше определение «своевременной публикации и обмена», чтобы не позднее момента принятия к публикации основных выводов из окончательного набора данных.NIH продолжает ожидать, что первоначальные исследователи могут извлечь выгоду от первого и непрерывного использования, но не от длительного исключительного использования ».

-  « Заключительное заявление NIH по обмену данными исследований» . [10]

Политика NSF из общих условий гранта [ править ]

36. Обмен выводами, данными и другими продуктами исследований.

а. NSF… ожидает, что исследователи поделятся с другими исследователями не более чем за дополнительную плату и в разумные сроки данными, образцами, физическими коллекциями и другими вспомогательными материалами, созданными или собранными в ходе работы. Он также побуждает награжденных делиться программным обеспечением и изобретениями или иным образом действовать, чтобы внедряемые в них инновации были широко полезными и применимыми.

б. Могут быть разрешены корректировки и, в случае необходимости, исключения для защиты прав отдельных лиц и субъектов, достоверности результатов или целостности коллекций или для удовлетворения законных интересов исследователей.

-  « Национальный научный фонд : Общие условия гранта (GC-1)», 1 апреля 2001 г. (стр. 17).

Office of Research Integrity [ править ]

Обвинения в неправомерном проведении медицинских исследований влекут за собой серьезные последствия. Министерство здравоохранения и социальных служб США создало офис для надзора за расследованиями заявлений о неправомерном поведении, включая утаивание данных. Сайт определяет миссию:

«Office of Research Integrity (ORI) продвигает честность в биомедицинских и поведенческих исследованиях, поддерживаемых Службой общественного здравоохранения США (PHS), примерно в 4000 учреждениях по всему миру. ORI отслеживает институциональные расследования неправомерных действий в исследованиях и способствует ответственному проведению исследований (RCR) посредством просветительская, профилактическая и регулирующая деятельность ».

-  Управление честности исследований .

Идеалы в обмене данными [ править ]

Некоторые исследовательские организации особенно серьезно относятся к обмену данными. WaveLab Стэнфордского университета придерживается философии воспроизводимости исследований и раскрытия всех алгоритмов и исходного кода, необходимых для воспроизведения результатов исследования. В статье под названием «WaveLab и воспроизводимые исследования» авторы описывают некоторые проблемы, с которыми они столкнулись, пытаясь воспроизвести собственное исследование по прошествии определенного периода времени. Во многих случаях это было настолько сложно, что они отказывались от усилий. Этот опыт убедил их в важности раскрытия исходного кода. [11] Философия описана:

Идея такова: статья о вычислительной науке в научном издании - это не сама стипендия, это просто реклама стипендии. Фактическая стипендия - это полная среда разработки программного обеспечения и полный набор инструкций, по которым были получены цифры. [12] [13]

Сеть наблюдения за данными для Земли ( DataONE ) и Data Conservancy [14] - это проекты, поддерживаемые Национальным научным фондом для поощрения и облегчения обмена данными между учеными-исследователями и улучшения поддержки метаанализа . В области наук об окружающей среде исследовательское сообщество признает, что для крупных научных достижений, связанных с интеграцией знаний в разных областях, потребуется, чтобы исследователи преодолели не только технологические барьеры для обмена данными, но и исторически укоренившиеся институциональные и социологические барьеры. [15] Д-р Ричард Дж. Ходс, директор Национального института старения.заявил, что «старая модель, в которой исследователи ревностно охраняли свои данные, больше не применима». [16]

Альянс за доступ налогоплательщиков - это группа организаций, которые поддерживают открытый доступ к исследованиям, спонсируемым государством. Группа сформулировала «Заявление о принципах», объясняющее, почему они считают открытый доступ важным. [17] Они также перечисляют ряд международных политик общественного доступа. [18] Это не более чем своевременная передача важной информации для эффективного реагирования на чрезвычайные ситуации в области здравоохранения. [19] В то время как архивы общественного достояния использовались для хранения данных, в основном после официальной публикации, они не смогли стимулировать быстрый обмен данными во время чрезвычайных ситуаций в области здравоохранения, среди которых были Эбола [20] и Зика, [21] [22]вспышки. Требуются более четко определенные принципы для признания интересов тех, кто генерирует данные, при одновременном разрешении свободного, неограниченного доступа к данным и их использования (до публикации) для исследований и практического применения, например, те, которые приняты Инициативой GISAID для противодействия возникающим угрозам. от гриппа. [23] [24]

Международная политика [ править ]

  • Австралия
  • Австрия
  • Европа - Комиссия европейских сообществ
  • Германия
  • Великобритания
  • 'Omic Data Sharing - список политик основных спонсоров науки FAIRsharing.org Каталог политик данных

Проблемы обмена данными в академических кругах [ править ]

Генетика [ править ]

Утаивание данных стало настолько обычным явлением в генетике, что исследователи из Массачусетской больницы общего профиля опубликовали в журнале статью на эту тему. Исследование показало, что «из-за того, что им было отказано в доступе к данным, 28% генетиков сообщили, что не смогли подтвердить опубликованные исследования». [25]

Психология [ править ]

В исследовании 2006 года было замечено, что из 141 автора публикации эмпирических статей Американской психологической ассоциации (APA) 103 (73%) не предоставили свои данные в течение 6-месячного периода. [26] В ходе последующего исследования, опубликованного в 2015 году, было обнаружено, что 246 из 394 авторов статей в журналах APA не предоставили свои данные по запросу (62%). [27]

Археология [ править ]

В исследовании 2018 года сообщалось об исследовании случайной выборки из 48 статей, опубликованных в период с февраля по май 2017 года в Journal of Archaeological Science, в ходе которого были обнаружены общедоступные исходные данные по 18 статьям (53%), причем данные о составе и датировке являются наиболее часто используемыми типами . В том же исследовании авторам статей об экспериментах с каменными артефактами, опубликованных в 2009 и 2015 годах, были отправлены электронные письма с запросом данных, касающихся этих публикаций. Они связались с авторами 23 статей и получили 15 ответов, что дало 70% ответов. Они получили пять ответов, которые включали файлы данных, что дает общий коэффициент обмена 20%. [28]

Ученые на стажировке [ править ]

Исследование обучаемых ученых показало, что многие из них уже сталкивались с сокрытием данных. [29] Это исследование вызвало опасения, что будущее поколение ученых не будет придерживаться установленной практики.

Разные подходы в разных областях [ править ]

Требования к обмену данными чаще предъявляются учреждениями, финансирующими агентствами и изданиями в области медицинских и биологических наук, чем в области физических наук. Требования сильно различаются в зависимости от того, должны ли данные вообще передаваться, кому должны быть предоставлены данные и кто должен нести расходы по обмену данными.

Финансирующие организации, такие как NIH и NSF, как правило, требуют большего обмена данными, но даже эти требования, как правило, признают озабоченность по поводу конфиденциальности пациентов, затрат, понесенных при обмене данными, и законности запроса. [30] Частные интересы и государственные учреждения, представляющие интересы национальной безопасности (оборона и правоохранительные органы), часто препятствуют обмену данными и методами посредством соглашений о неразглашении.

Обмен данными создает особые проблемы в инициативах по совместному мониторингу , например, когда лесные сообщества собирают данные о местных социальных и экологических условиях. В этом случае правозащитный подход к разработке протоколов обмена данными может основываться на принципах свободного, предварительного и осознанного согласия и отдавать приоритет защите прав тех, кто создал данные, и / или тех, кто потенциально пострадал. путем обмена данными. [31]

См. Также [ править ]

  • Архив данных
  • Распространение данных
  • Конфиденциальность данных
  • Публикация данных
  • Цитирование данных
  • ЧЕСТНЫЕ данные
  • Обмен файлами
  • Обмен информацией
  • Открытые данные
  • Реестр хранилищ данных исследований

Ссылки [ править ]

  1. ^ «Глобальная эпидемия здравоохранения - это бомба замедленного действия - но вирусные базы данных могут и помогают спасать жизни» . HuffPost UK . Проверено 6 сентября 2017 .
  2. ^ "Снимок прозрачности" . Экономист . 10 августа 2006 г. ISSN 0013-0613 . Проверено 6 сентября 2017 . 
  3. ^ «Как поощрить правильное поведение» . Природа . 416 (6876): 1. 2002. Bibcode : 2002Natur.416R ... 1. . DOI : 10.1038 / 416001b . PMID 11882850 . 
  4. ^ МакКоли, Джон У. (2017-02-23). «Вирусы: модель для ускорения противодействия эпидемии» . Природа . 542 (7642): 414. Bibcode : 2017Natur.542..414M . DOI : 10.1038 / 542414b . PMID 28230113 . 
  5. ^ «Нет бесплатного обеда, министры здравоохранения G20 находят на первой встрече» . Интеллектуальная собственность Watch . 2017-05-20 . Проверено 6 сентября 2017 .
  6. ^ Savage CJ, Vickers AJ (2009). «Эмпирическое исследование обмена данными авторами, публикующими в журналах PLoS» . PLOS ONE . 4 (9): e7078. Bibcode : 2009PLoSO ... 4.7078S . DOI : 10.1371 / journal.pone.0007078 . PMC 2739314 . PMID 19763261 .  
  7. ^ « Публикация и открытость », глава из «О том, как быть ученым: ответственное поведение в исследованиях», Национальная академия наук.
  8. ^ " Америка КОНКУРЕНУЕТ Закон
  9. ^ « Доступ и хранение данных исследования. Архивировано 26мая2007 г. на Wayback Machine : Права и обязанности», стр. 5. Совет по связям с правительством, март 2006 г.
  10. ^ « Политика обмена данными NIH ».
  11. ^ WaveLab и воспроизводимые исследования Джонатана Б. Бакхейта и Дэвида Л. Донохо
  12. ^ Веб-сайт WaveLab850
  13. ↑ Риммер, Мэтью (01.09.2005). «Японский рис: интеллектуальная собственность, научные публикации и обмен данными». Прометей . 23 (3): 325–347. DOI : 10.1080 / 08109020500235180 . ISSN 0810-9028 . 
  14. ^ "Data Conservancy | Data Conservancy посвящен разработке институциональных решений проблем сбора, сохранения и повторного использования данных" .
  15. ^ Райхман О.Дж.; Джонс МБ; Шильдхауэр MP (2011). «Проблемы и возможности открытых данных в экологии» . Наука . 331 (6018): 703–705. Bibcode : 2011Sci ... 331..703R . DOI : 10.1126 / science.1197962 . PMID 21311007 . 
  16. ^ Статья NY Times о ценности общих данных для исследования болезни Альцгеймера
  17. ^ Веб-сайт Альянса за доступ налогоплательщиков
  18. ^ Всемирный импульс общественного доступа к исследованиям, финансируемым государством.
  19. ^ Шу, Юэлонг; Макколи, Джон (2017). «GISAID: Глобальная инициатива по обмену всеми данными о гриппе - от видения к реальности» . Евронаблюдение . 22 (13). DOI : 10.2807 / 1560-7917.es.2017.22.13.30494 . PMC 5388101 . PMID 28382917 .  
  20. ^ Йозвиак, Натан Л .; Шаффнер, Стивен Ф .; Сабети, Пардис К. (26 февраля 2015 г.). «Обмен данными: открывайте доступ к исследованиям вспышек болезней» . Природа . 518 (7540): 477–479. Bibcode : 2015Natur.518..477Y . DOI : 10.1038 / 518477a . PMID 25719649 . 
  21. ^ "Когда исследования сходят с рельсов" . Индус . Проверено 6 сентября 2017 .
  22. ^ «Преимущества совместного использования» . Природа . 530 (7589): 129. 11 февраля 2016 г. Bibcode : 2016Natur.530Q.129. . DOI : 10.1038 / 530129a . PMID 26863943 . 
  23. ^ Эльба, Стефан; Бакленд-Меррет, Джемма (01.01.2017). «Данные, болезни и дипломатия: инновационный вклад GISAID в глобальное здоровье» . Глобальные вызовы . 1 (1): 33–46. DOI : 10.1002 / gch2.1018 . ISSN 2056-6646 . PMC 6607375 . PMID 31565258 .   
  24. ^ "Гонки CDC по созданию вакцины от новейшего штамма птичьего гриппа в Китае" . Bloomberg.com . 2013-04-10 . Проверено 6 сентября 2017 .
  25. ^ Кэмпбелл EG, Clarridge BR, Gokhale M и др. (2002). «Удержание данных в академической генетике: данные национального опроса» . ДЖАМА . 287 (4): 473–80. DOI : 10,1001 / jama.287.4.473 . PMID 11798369 . 
  26. ^ Wicherts, JM; Borsboom, D .; Kats, J .; Моленаар, Д. (2006). «Плохая доступность данных психологических исследований для повторного анализа». Американский психолог . 61 (7): 726–728. DOI : 10.1037 / 0003-066X.61.7.726 . PMID 17032082 . 
  27. ^ Vanpaemel, W .; Vermorgen, M .; Deriemaecker, L .; Штормы, Г. (2015). «Мы теряем хороший кризис? Доступность данных психологических исследований после бури» (PDF) . Collabra . 1 (1): 1–5. DOI : 10.1525 / collabra.13 .
  28. ^ Марвик, Бен; Берч, Сюзанна Э. Пилаар (5 апреля 2018 г.). «Стандарт научного цитирования археологических данных как стимул к обмену данными» . Успехи археологической практики . 6 (2): 125–143. DOI : 10.1017 / aap.2018.3 .
  29. ^ Vogeli C, Yucel R, Bendavid E, et al. (Февраль 2006 г.). «Удержание данных и новое поколение ученых: результаты национального опроса» . Acad Med . 81 (2): 128–36. DOI : 10.1097 / 00001888-200602000-00007 . PMID 16436573 . 
  30. ^ «Политика обмена данными NIH и руководство по внедрению» . grants.nih.gov . Проверено 9 апреля 2021 .
  31. ^ D Сабогал. 2015. Обмен данными при общинном мониторинге лесов: уроки Гайаны. Глобальная программа Canopy. http://forestcompass.org/how/resources/data-sharing-community-based-forest-monitoring-lessons-guyana

Литература [ править ]

Комитет по вопросам трансграничного потока научных данных, Национальный исследовательский совет (1997). Биты силы: проблемы глобального доступа к научным данным . Вашингтон, округ Колумбия: Национальная академия прессы. DOI : 10.17226 / 5504 . ISBN 978-0-309-05635-9. - обсуждает международный обмен данными в области естественных наук.

Внешние ссылки [ править ]

  • Эрик Кэмпбелл и Дэвид Блюменталь опубликовали книгу Эрика Кэмпбелла и Дэвида Блюменталя « Эгоистичный ген, заархивированный 5 августа 2008 г. в Wayback Machine : обмен и удержание данных в академической генетике».
  • Обмен данными и архивирование данных - американская психологическая ассоциация
  • Общественное достояние данных цифровых исследований
  • WaveLab и воспроизводимые исследования Джонатана Б. Бакхейта и Дэвида Л. Донохо из Стэнфордского университета
  • Роль архивов данных и программного кода в будущем экономических исследований, опубликованный Федеральным резервным банком Сент-Луиса
  • Инициатива Экологического общества Америки по обмену и архивированию данных. Архивировано 10 марта 2008 г. на Wayback Machine.
  • FAIRsharing.org Веб-сайт по обмену данными и политике в отношении данных в биологии
  • Архив данных Великобритании: управление данными и обмен ими
  • Ресурсы и примеры плана управления данными - Межуниверситетский консорциум политических и социальных исследований.
  • DataONE
  • Nature Scientific Data : общедоступная онлайн-публикация с описанием научно ценных наборов данных.