Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Эббе Nielsen вызов является международным научно - конкурс проводится ежегодно с 2015 годом по Глобальному информационному фонду по биоразнообразию (ГИФБ), с набором денежных призов , которые распознают исследователь (ы) Доводы в создании программного обеспечения или подходах , которые успешно Адрес GBIF выпущенных проблема в области информатики биоразнообразия . Он стал преемником Премии Эббе Нильсена , которая ежегодно присуждалась GBIF в период с 2002 по 2014 год. Название задачи посвящено памяти выдающегося энтомолога и сторонника информатики биоразнообразия Эббе Нильсена , который умер от сердечного приступа в США на пути к соревнованиям 2001 года. Заседание Совета управляющих GBIF.

История [ править ]

В 2001 году GBIF учредил Премию Эббе Нильсена в честь недавно скончавшегося датско-австралийского энтомолога Эббе Нильсена , который был горячим сторонником как GBIF, так и дисциплины информатики биоразнообразия. [1] Эта награда была отмечена мировым исследователем или исследовательской группой за их ретроспективный вклад в область информатики биоразнообразия.в соответствии с критериями, установленными GBIF в условиях награждения. Начиная с 2015 года GBIF возобновил процесс награждения как соревнование между людьми или группами исследователей со всего мира за создание нового программного обеспечения или подходов к использованию данных о биоразнообразии в соответствии с темой, ежегодно объявляемой для каждого раунда конкурса, а также для разделения приза деньги между несколькими группами вместо одного победителя, как в начальную эпоху приза. [2] Прием заявок на участие в конкурсе, который теперь называется «Вызовом Эббе Нильсена», подавался ежегодно с 2015 года по настоящее время, а победители объявлялись на конкурсной основе во все годы, кроме 2017 года, когда было недостаточное количество заявок. получили. [3]

Список победителей, 2015 г. [ править ]

2015 [ править ]

Задача: «В значительной степени используйте данные, опосредованные GBIF, таким образом, чтобы обеспечить новые представления или идеи. Ваша заявка может включать в себя ряд результатов - веб-сайты, автономные или мобильные приложения или результаты анализов - или может быть направлена ​​на улучшение каких-либо количество проблем или процессов, включая (но не ограничиваясь) анализ или визуализацию данных, рабочие процессы данных, загрузку или аннотации ». [4]

Список финалистов конкурса 2015 года доступен здесь. [5]

Обладатель Первой премии:

  • « Метрики набора данных GBIF » - Питер Десмет, Барт Элтерман и Николя Ноэ (Бельгия) [6]

Обладатель второй премии:

Подробности доступны на сайте GBIF здесь. [8]

2016 [ править ]

Задача: «В 2016 году задача будет сосредоточена на вопросе пробелов и полноты данных, поиске инструментов, методов и механизмов, которые помогут проанализировать пригодность данных, опосредованных GBIF, и / или определить приоритеты для мобилизации данных о биоразнообразии. Мы ожидаем, что как пользователи данных, так и держатели данных извлекут выгоду из акцента в этом году на пробелы и полноту ". [9] [10]

Обладатель Первой премии:

  • « Изучение невежества в пространстве и времени » - Алехандро Руэте (Аргентина) [11]

Совместные обладатели Второй премии:

  • « сампбиас » - Александр Жижка, Александр Антонелли и Даниэле Сильвестро (Швеция) [12]
  • « Инструменты оценки охвата GBIF » - Вальтер Джетц, Джереми Мальчик, Карстен Мейер, Мишель Дуонг, Аджай Ранипета и Луис Дж. Вильянуэва (США, Южная Африка и Германия) [13]

Подробности доступны на сайте GBIF здесь. [14]

2017 [ править ]

Задача: «В 2017 году GBIF Ebbe Nielsen Challenge собирает заявки, которые изменяют назначение этих наборов данных [в общедоступных репозиториях с открытым доступом] и адаптируют их к формату Darwin Core Archive (DwC-A), интероперабельному и многоразовому стандарту, который обеспечивает публикацию почти 800 миллионы записей о встречах видов из почти 1000 всемирных организаций, которые в настоящее время активны в сети GBIF. Ebbe Nielsen Challenge в 2017 году поставит перед разработчиками и специалистами по обработке данных задачу создать веб-приложения, сценарии или другие инструменты, которые автоматизируют обнаружение и извлечение соответствующих данных о биоразнообразии из открытых данных репозитории ". [15]

Победители не были объявлены, что указывает на то, что призовые деньги 2017 года не были присуждены ни одной из работ.

2018 [ править ]

Задача: «Конкурс Ebbe Nielsen Challenge 2018 намеренно является открытым, поэтому участники имеют широкие полномочия по созданию инструментов и методов, которые развивают открытую науку и улучшают доступ, полезность или качество данных, опосредованных GBIF. Заявки могут быть новыми. , методы визуализации, рабочие процессы или анализ, либо они основываются на существующих инструментах и ​​функциях и расширяют их ". [16] [17]

Совместные обладатели Первой премии:

  • « Рецепт контрольного списка: шаблон для воспроизводимой стандартизации данных контрольного списка видов » - Льен Рейсерхов, Дамиано Олдони и Питер Десмет (Бельгия) [18]
  • « Озимандиас: граф знаний о биоразнообразии » - Родерик Д.М. Пейдж (Соединенное Королевство) [19]

Совместные обладатели Второй премии:

  • « Вселенная » - Томер Гета, Йохай Кармель, Виджей Барве, Тилошон Нагараджа, Повилас Гибас, Ашвин Агравал (Израиль, США, Шри-Ланка, Литва и Индия) [20]
  • « Исследователь проблем GBIF » - Луис Дж. Вильянуэва (США) [21]
  • « Умная ловушка для комаров в трубопроводе DwC » - Коннор Ховингтон и Сэмюэл Рунд (США) [22]
  • « Редактор таксономического дерева » - Ашиш Сингх Томар (Испания) [23]

Подробности доступны на сайте GBIF здесь. [24]

2019 [ править ]

Задача: «Конкурс Ebbe Nielsen Challenge 2019 намеренно является открытым, поэтому участники имеют широкие полномочия по созданию инструментов и методов, которые продвигают открытую науку и улучшают доступ, полезность или качество данных, опосредованных GBIF. Заявки на участие могут быть новыми. , методы визуализации, рабочие процессы или анализ, либо они основываются на существующих инструментах и ​​функциях и расширяют их. Ожидается, что успешные заявки обеспечат практические, прагматические решения для сети GBIF, одновременно продвигая информатику биоразнообразия и управление данными о биоразнообразии в связи с миссией и стратегией GBIF. строить планы." [25]

Обладатель Первой премии:

  • « WhereNext: рекомендательная система для определения приоритетов выборки на основе обобщенного моделирования несходства » - Хорхе Веласкес-Тибата (Колумбия) [26]

Совместные обладатели Второй премии:

  • « occCite: инструменты, позволяющие цитировать исчерпывающие данные о биоразнообразии » - Ханна Л. Оуэнс, Кори Меров, Брайан С. Майтнер, Виджей В. Барве и Роберт Гуралник (Дания, США) [27]
  • " Органелла " - Андреа Бидерманн, Диана Герт, Димитар Рушев и Пауль Рёдер (Германия) [28]
  • « Быстрая наименьшая озабоченность: автоматизированная оценка растений с низким уровнем риска для включения в Красный список видов, находящихся под угрозой исчезновения (Красный список) МСОП » - Стивен Бахман, Барнаби Уокер и Джастин Моут (Соединенное Королевство) [29]

Совместные обладатели Третьей премии:

  • " Agile GBIF Publishing " - Евгений Мейке (Финляндия) [30]
  • « Обзор информации о биоразнообразии и поддержка принятия решений: пакет BIRDS для R » - Дебора Арлт, Алехандро Руэте и Антон Хаммарстрём (Швеция) [31]
  • " GB Sifter: GBIF to GenBank Data Sifter " - Луис Альенде (США) [32]
  • " naturaList " - Артур Винисиус Родригес и Габриэль Накамура (Бразилия) [33]
  • « GeoNature-atlas: опубликуйте онлайн-атлас биоразнообразия с данными GBIF о вашем районе » - Джордан Селлис, Амандин Саль (Франция) [34]

Подробности доступны на сайте GBIF здесь. [35]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Кристенсен, Нильс П. (2001). «Эббе Шмидт Нильсен, 7 июня 1950 г. - 6 марта 2001 г.». Nota Lepidopterologica . 24 (3): 3–9.
  2. ^ "GBIF Ebbe Nielsen Challenge" . GBIF Ebbe Nielsen Challenge .
  3. ^ «2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge уже открыт» . iphylo.blogspot.com .
  4. ^ «Победители названы для первого конкурса GBIF Ebbe Nielsen Challenge» . www.gbif.org .
  5. ^ «Финалисты GBIF Ebbe Nielsen Challenge» . dna-barcoding.blogspot.com .
  6. ^ «Метрики набора данных GBIF» . chrome.google.com .
  7. ^ «BioGUID.org - Связывание данных во вселенной биоразнообразия посредством использования уникальных идентификаторов и связанных объектов данных» . devpost.com .
  8. ^ «GBIF Ebbe Nielsen Challenge: оживление информации о биоразнообразии» . www.gbif.org .
  9. ^ «GBIF 2016 Ebbe Nielsen Challenge: Анализ и устранение пробелов и предубеждений в первичных данных о биоразнообразии» . www.gbif.org .
  10. ^ «GBIF 2016 Ebbe Nielsen Challenge» . www.biodiv.be .
  11. ^ «Ученый SLU выиграл приз за« Картирование невежества » » . www.slu.se .
  12. ^ «sampbias - Оценка смещений географической выборки в наборах данных о распределении видов» . devpost.com .
  13. ^ «Инструменты оценки охвата GBIF - онлайн-инструменты для выявления и отслеживания пробелов в данных, опосредованных GBIF, для характеристики распределения видов в пространстве и времени» . devpost.com .
  14. ^ «Запись данных 'невежество' выигрывает 2016 Ebbe Nielsen Challenge» . www.gbif.org .
  15. ^ «Освобождение записей о видах из открытых хранилищ данных для научного открытия и повторного использования» . www.gbif.org .
  16. ^ «2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge стремится к инновациям в области открытых данных для сохранения биоразнообразия» . www.gbif.org .
  17. ^ «2018 GBIF Ebbe Nielsen Challenge» . www.europeandataportal.eu .
  18. ^ «Рецепт контрольного списка - Как мы создали шаблон для стандартизации данных о видах» . ropensci.org .
  19. ^ "PROF RODERIC PAGE ВЫИГРЫВАЕТ ПРИЗ EBBE NIELSEN" . www.gla.ac.uk .
  20. ^ «bdverse: Структура очистки данных о биоразнообразии» . www.researchgate.net .
  21. ^ «Офис программы оцифровки Смитсоновского института выигрывает приз в GBIF 2018 Ebbe Nielsen Challenge» . dpo.si.edu .
  22. ^ «Члены команды VectorBase среди шести победителей конкурса Ebbe Nielsen Challenge 2018» . www.vectorbase.org .
  23. ^ «ПУБЛИКАЦИЯ В БЛОГЕ: Визуальное исследование таксономических, филогеномных данных и данных о биоразнообразии» . big4-project.eu .
  24. ^ «Шесть победителей возглавляют конкурс Ebbe Nielsen Challenge 2018» . www.gbif.org .
  25. ^ «2019 GBIF Ebbe Nielsen Challenge стремится к инновациям в области открытых данных для сохранения биоразнообразия» . www.gbif.org .
  26. ^ «WhereNext: рекомендательная система для определения приоритетов выборки на основе обобщенного моделирования несходства» . rpubs.com .
  27. ^ "occCite: Инструменты для включения всестороннего цитирования данных о биоразнообразии" . github.com .
  28. ^ "Органелла" . netlify.com .
  29. ^ «Быстрое наименьшее беспокойство: Автоматическая оценка растений с низким уровнем риска для Красного списка видов, находящихся под угрозой исчезновения (Красный список) МСОП» . shinyapps.io .
  30. ^ "Agile GBIF Publishing" . earthcape.com/ .
  31. ^ «Обзор информации о биоразнообразии и поддержка принятия решений: пакет BIRDS для R» . github.com .
  32. ^ "GB Sifter: GBIF для GenBank Data Sifter" . youtube.com .
  33. ^ "naturaList" . shinyapps.io .
  34. ^ «GeoNature-atlas: опубликуйте онлайн-атлас биоразнообразия с данными GBIF о вашем районе» . ecrins-parcnational.com .
  35. ^ "WhereNext выигрывает 2019 GBIF Ebbe Nielsen Challenge" . www.gbif.org .