В бионеорганической химии , А.Н. entatic состояние является «состоянием атома или группы , которые, из - за его связыванием в белке, имеет свое геометрическое или электронное состояние , приспособленные для функции.» [1] Термин был введен Валле и Уильямсом [2] на основе «стоечного механизма» Мальмстрема. [3] Считается, что эти состояния улучшают химию ионов металлов в биологическом катализе. [4]
Примером энтатического состояния является медный центр пластоцианина , окислительно-восстановительного фермента. В этом белке медь перемещается между окисленным и восстановленным состояниями, Cu 2+ и Cu + , соответственно. Каждая степень окисления предпочитает особую координационную геометрию : в то время как медь (II) обычно является плоской квадратной и предпочитает твердые основания, такие как кислородные и азотные лиганды, медь (I) обычно тетраэдрическая и связывается преимущественно с мягкими основаниями, такими как лиганды серы. Поскольку скорость переноса электронов зависит от энергии реорганизации, идеальная скорость могла бы быть получена для центров Cu, имеющих промежуточную геометрию между требованиями каждой степени окисления. Фактически, сайт Cu не является ни плоским, ни тетраэдрическим, он считается искаженным тетраэдрическим, с двумя лигандами азота из остатков гистидина и двумя лигандами серы из остатков метионина и цистеина, и поэтому может считаться энтатическим состоянием. Согласно гипотезе энтатического состояния, искажение является результатом деформации, вызванной связыванием лигандов с относительной ориентацией, которая заранее задана белком.
Некоторые теоретические расчеты показывают, что модельная система может иметь геометрию, аналогичную наблюдаемой в белке, без какой-либо деформации; эти результаты, однако, остаются спорными. [3]
Рекомендации
- ^ ИЮПАК , Сборник химической терминологии , 2-е изд. («Золотая книга») (1997). Онлайн исправленная версия: (1997) " Entatic state ". DOI : 10,1351 / goldbook.ET06763
- ^ Vallee BL, Williams RJP (1968) Proc Natl Acad Sci USA 59 , 498.
- ^ a b Николас Кальцояннис; Джон Э. Макгрэйди; Йохен Аутшбах (2004). Принципы и приложения функциональной теории плотности в неорганической химии . Springer. С. 47–49 . ISBN 3-540-21861-0.
- ^ Перри А. Фрей; Адриан Д. Хегеман. Механизмы ферментативных реакций . Издательство Оксфордского университета. п. 210. ISBN 0-19-512258-5.