Флаг Агинского Бурятского округа Российской Федерации представляет собой вертикальный триколор синего, желтого и белого цветов. На флаге изображен частичный желтый символ Соёмбо в верхней части синей полосы. Соёмбо является культурным символом монгольского народа , а также присутствует на флагах Монголии и Бурятии .
Флаг нарисовал бурятский художник Бато Дампилон . Принят 6 июля 2001 года. Пропорции 2:3.