Ян был 3-м ординатом имений Замосць - Ординация . Генерал Подолии с 1637 г., Крайчи Короны с 1653 г., Подчаши Короны с 1655 г., воевода Киевского воеводства ( Киев , также Киев) с 1658 г., воевода Сандомирского воеводства с 1659 г. , староста Калуша и Ростоки .
Он женился на Мари Казимире Луизе де ла Гранж д'Аркьен 3 марта 1658 года в Варшаве . Несмотря на их брак без любви, у них было четверо детей, все из которых умерли в раннем детстве:
Ян умер 2 апреля 1665 года, а его вдова вышла замуж за своего любовника Яна Собеского чуть более чем через три месяца, 14 июля того же года. Поскольку у Замойского не было выживших детей, Ордынат из поместья Замосць Ординация в конечном итоге перешел к его дальнему родственнику Марцину Замойскому , который происходил из младшей ветви семьи.