Лиор Пахтер | |
|---|---|
 Лиор Пахтер в 2013 году | |
| Родившийся | Лиор Сэмюэл Пахтер 3 мая 1973 г. |
| Альма-матер | Калифорнийский технологический институт (BS) Массачусетский технологический институт (PhD) |
| Награды | Член ISCB (2017) |
| Научная карьера | |
| Поля | Вычислительная биология Биоинформатика Геномика Информатика Математика [1] |
| Учреждения | Калифорнийский университет в Беркли |
| Тезис | Домино черепица, распознавание генов и мыши (1999) |
| Докторант | Бонни Бергер [2] |
| Докторанты | Коул Трапнелл [2] [3] |
| Интернет сайт | liorpachter |
Лиор Сэмюэл Пахтер - вычислительный биолог . Он работает в Калифорнийском технологическом институте , где является профессором вычислительной биологии Брена. У него самые разные исследовательские интересы, включая геномику , комбинаторику , вычислительную геометрию , машинное обучение , научные вычисления и статистику . [1] [4] [5]
Ранняя жизнь и образование [ править ]
Пахтер родился в Израиле и вырос в Южной Африке . [6] Он получил степень бакалавра в области математики из Калифорнийского технологического института в 1994 году [4] Он завершил свою докторскую степень в области математики из Массачусетского технологического института в 1999 году, под руководством Бонни Бергер , [2] с Эриком Lander и Даниэля Клейтман в качестве советников. [4]
Карьера и исследования [ править ]
Пачтер работал на факультете Калифорнийского университета в Беркли с 1999 по 2018 год [7], а в 2012 году был назначен на кафедру Саклера [4].
Помимо своего технического вклада, Пахтер известен тем, что использует новые медиа для продвижения открытой науки [8] и своим мысленным экспериментом, который он разместил в своем блоге, согласно которому «ближайший сосед« идеального человека »- из Пуэрто-Рико. . [9] Это привлекло значительное внимание средств массовой информации [10], и ответ был опубликован в Scientific American . [11]
Награды и награды [ править ]
В 2017 году, Пэчтер был избран членом этого Международного общества по вычислительной биологии (ISCB). [12]
Ссылки [ править ]
- ^ a b Публикации Лиора Пахтера, проиндексированные Google Scholar
- ^ a b c Лиор Пахтер в проекте « Математическая генеалогия»
- ^ Трапнелл, Коул; Пахтер, Лиор; Зальцберг, Стивен Л. (2009). «TopHat: обнаружение сплайсинговых соединений с помощью RNA-Seq» . Биоинформатика . 25 (9): 1105–1111. DOI : 10.1093 / биоинформатики / btp120 . ISSN 1460-2059 . PMC 2672628 . PMID 19289445 .
- ^ a b c d Биографические данные: Лиор Пахтер (PDF) , 2017 г. , дата обращения 16 мая 2017 г. .
- ^ Трапнелл, Коул; Уильямс, Брайан А; Pertea, Geo; Мортазави, Али; Кван, Гордон; ван Барен, Марийке Дж; Зальцберг, Стивен Л; Уолд, Барбара Дж; Пахтер, Лиор (2010). «Сборка и количественная оценка транскриптов с помощью RNA-Seq выявляет неаннотированные транскрипты и переключение изоформ во время дифференцировки клеток» . Природа Биотехнологии . 28 (5): 511–515. DOI : 10.1038 / nbt.1621 . ISSN 1087-0156 . PMC 3146043 . PMID 20436464 .
- ^ Eskenazi, Джо (14 июня 2002), "UC распаковка петицией неприятности произраильском активистов" , Jweekly.
- ^ "Калифорнийский университет в Беркли, факультет математики, Лиор Пахтер" . Проверено 8 июня 2019 .
- ^ Lesen, Amy E. (2015), "Новая парадигма для научной коммуникации социальных СМИ, твиттера, науки и общественного участия: обзор литературы", в Lesen, Эй Е. (ред . ), Ученые, эксперты, и Гражданское участие: идя по тонкой грани, Исследования Ashgate по экологической политике и практике, Ashgate Publishing, Ltd., стр. 111–136, ISBN 9781472415240. См., В частности, стр. 119–120 .
- ^ Пэчтер Лиор (2 декабря 2014). «Идеальный человек - пуэрториканец» . Биты ДНК - Обзоры и комментарии по вычислительной биологии Лиора Пахтера . Проверено 11 декабря 2016 года .
- ↑ Вальдес, Мария Г. (4 декабря 2014 г.), «Новое исследование показывает, что идеальный генетически говорящий человек родом с этого Карибского острова!» , Latin Times
- ^ Олексык, Тарас К .; Мартинес-Крузадо, Хуан Карлос (5 февраля 2015 г.). «Почему нет идеального человека ни в Пуэрто-Рико, ни где-либо еще» . Scientific American ..
- ^ «13 февраля 2017: Международное общество вычислительной биологии называет семь членов как класс стипендиатов ISCB 2017 года» . www.iscb.org . Проверено 13 февраля 2017 года .
Внешние ссылки [ править ]
- СМИ, связанные с Лиором Пахтером на Викискладе?
