Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Максудул Алам
Maqsudul.jpg
Родившийся( 1954-12-14 )14 декабря 1954 г.
Мадарипур ( Фаридпур ), Восточная Бенгалия , доминион Пакистан
Умер20 декабря 2014 г. (2014-12-20)(60 лет)
Гавайи , США
Место отдыхаГавайский генеральный парк , США
НациональностьБангладешско-американский
Альма-матерИнститут биохимии МГУ им.
Макса Планка
ИзвестенСеквенирование генома папайи, каучука и джута
Научная карьера
УчрежденияГавайский университет в Маноа

Максудул Алам (14 декабря 1954 - 20 декабря 2014) был бангладешского происхождения жизни науки ученый [1] [2] , который известен своими работами по секвенирования генома . Его работа по секвенированию генома началась с бактерий Idiomarina loihiensis в 2003 году. [3] Он привлек внимание жителей Бангладеш после своей работы по секвенированию генома тоша джута ( Corchorus olitorius O4) в 2010 году [4] белого джута ( Corchorus capsularis CVL1). ) в 2013 г. [5] и грибок, поражающий джут ( Macrophomina phaseolina ) в 2012 г. [6]

Алам также работал над секвенированием генома трансгенной папайи ( Carica papaya Linnaeus) в 2007 г. [7] каучукового дерева ( Hevea brasiliensis ) в 2009 г. [8] бактерий Methylacidiphilum infernorum в 2007 г. [9] Methylocella silvestris BL2 в 2009 г. [10] Saprospira grandis str. Левин в 2011 г. [11] Geobacillus thermoleovorans CCB_US3_UF5 в 2011 г. [12] Thermus sp. штамм CCB_US3_UF1 в 2011 г. [13] [14] Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Typhi P-stx-12 в 2011 г. [15] Штамм Thermomyces lanuginosus SSBP [16] и Pantoea anthophila в 2014 г. [17]

Ранняя жизнь [ править ]

Алам родился в Мадарипуре , Фаридпур , Восточный Пакистан. Его родителями были Далил Уддин Ахмед, мученик Освободительной войны 1971 года и служащий стрелков Восточного Пакистана; и Лириан Ахмед, учитель и социальный работник. [1]

Личная жизнь [ править ]

Алам женился на Ирине Анатольевне во время пребывания в России. Алам был аспирантом, а Анатольевна тогда была студенткой-медиком. У пары родилась дочь по имени Лилиана Максудуловна Алам (1986-2019). [18] В 1992 году семья переехала в США. Пара развелась в 1997 году. [19]

Максудул с дочерью Лилианой

Позже Алам женился на Рафии Хасине в 2009 году.

Образование [ править ]

Алам получил среднее и высшее среднее образование в средней школе государственной лаборатории и колледже Дакки , соответственно. Он закончил свою магистерскую в микробиологии из Московского государственного университета в 1979 году; и получил свою первую степень доктора философии в микробиологии из того же университета в 1982 году он получил свою вторую степень доктора философии в области биохимии из Института Макса Планка Биохимии в 1987 году [1] [2]

Академическая карьера [ править ]

С 1988–1990 гг. Алам был старшим научным сотрудником Института биоорганической химии РАН. Затем он был приглашенным научным сотрудником кафедры биохимии и биофизики Вашингтонского государственного университета с 1990–1992 гг. Алам был помощником директора Инженерного центра морских биопродуктов (MarBEC) при Гавайском университете.

В 1992 году Алам поступил на кафедру микробиологии Гавайского университета в Маноа в качестве доцента. В 1997 году получил звание доцента. Алам стал профессором в 2001 году и занимал эту должность до самой смерти. Он также был директором перспективных исследований в области геномики, протеомики и биоинформатики в Гавайском университете в Маноа с 2003 года до своей смерти. [1] [2]

Алам был директором Центра химической биологии в Университете Сайнс Малайзии с 2009 по 2012 год. [2] В 2011 году Алам стал членом консультативного совета Университета науки и технологий Шахджалал (SUST), Силхет.

Алам (верхний ряд, шестой справа), Мухаммед Зафар Икбал , Ясмин Хак и другие учителя SUST Шахид Минар , Силхет.

Научная карьера [ править ]

В 2003 году Алам основал Расширенные исследования в области геномики, протеомики и биоинформатики (ASGPB) в Гавайском университете в Маноа . Объединив структуру секвенирования ДНК ASGPB с биоинформатическими активами в Центре высокопроизводительных вычислений Мауи (MHPCC), он запустил программу вычислительной протеомики, которая варьировалась от лабораторных исследований до информатики in silico . [2] Alam и его команда завершила секвенирования генома Idiomarina loihiensis , [3] древний организм найден в гидротермальных жерл в Loihi во время университета Гавайев экспедиции в 2003 году [20]

В 2007 году Алам работал в проекте «Геном папайи на Гавайях», целью которого было секвенировать полный геном трансгенной папайи SunUp . Папайя SunUp была генетически модифицирована, чтобы придать устойчивость к вирусу кольцевой пятнистости папайи , но гавайские фермеры не могли продавать трансгенную папайю в Японии; Алам и его команда секвенировали трансгенную папайю, чтобы помочь фермерам пройти через процесс регулирования. [7] [21]

Алам основал Центр химической биологии в Университете Саинс Малайзии в 2009 году. Там он основал исследовательские центры, исследовательские программы и работал над секвенированием генома каучукового дерева ( Hevea brasiliensis ). [8]

Бангладешский проект генома джута [ править ]

Премьер-министр Шейх Хасина и Алам (2 справа) на пресс-конференции (2010 г.) объявляют о завершении секвенирования генома джута.

В 2009 году Алам присоединился к проекту «Фундаментальные и прикладные исследования джута» Научно-исследовательского института джута, Бангладеш, в качестве главного исследователя. Он надеялся, что секвенирование генома такой товарной культуры, как джут , поможет Бангладеш с экономической точки зрения, потому что джут можно сделать устойчивым к болезням, если известна последовательность генома. Команда Алама работала над секвенированием генома тосса джута ( Corchorus olitorius O4) [4], и в 2010 году премьер-министр Шейх Хасина публично объявила, что геном джута был расшифрован и будет подано несколько патентных заявок. [22] [23] Команда Алама продолжила работу над секвенированием грибка, атакующего джут ( Macrophomina phaseolina )[6] в 2012 г. и белый джут ( Corchorus capsularis CVL1) [5] в 2013 г. [1]

Смерть [ править ]

20 декабря 2014 года Алам скончался в медицинском центре Королевы в Гонолулу, Гавайи. Он страдал циррозом печени. 23 декабря 2014 года он был похоронен на кладбище в Мемориальном парке Гавайев по его желанию. [24] [25]

Награды [ править ]

Алам был удостоен награды за выдающиеся достижения в области исследований Гавайского университета в 2001 году, премии NIH Shannon в 1997 году, научного сотрудника Гумбольдта в 1987 году Немецкого научного фонда. [1] В 2016 году Алам был посмертно награжден премией Дня независимости правительством Бангладеш . [26]

«Фонд наград за высшие исследования Максудул Алама» был создан Фондом Гавайского университета для поддержки образования аспирантов и в честь Алама. [2]

Публикации [ править ]

Главы книги [ править ]

  • Синтения и коллинеарность в геномах растений (2008). [27]
  • Протоглобин и сенсоры, связанные с глобином (2008). [28]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c d e f "О профессоре Максудуле Аламе" . Фундаментальные и прикладные исследования по проекту джута (BARJ), Bangladsh .
  2. ^ a b c d e f "ФОНД ЗА ИССЛЕДОВАНИЯ ВЫПУСКНИКОВ МАКСУДУЛ АЛАМА" . УНИВЕРСИТЕТ ФОНДА ГАВАИ .
  3. ^ а б Хоу, Шаобинь; Пила, Джимми Х .; Ли, Кит Шан; Freitas, Tracey A .; Белисль, Клод; Каварабаяси, Ютака; Доначи, Стюарт П .; Пикина, Алла; Гальперин, Михаил Юрьевич (2004-12-28). «Последовательность генома глубоководной γ-протеобактерии Idiomarina loihiensis показывает, что ферментация аминокислот является источником углерода и энергии» . Труды Национальной академии наук . 101 (52): 18036–18041. Bibcode : 2004PNAS..10118036H . DOI : 10.1073 / pnas.0407638102 . PMC 539801 . PMID 15596722 .  
  4. ^ a b «Расшифровка генома джута» . The Daily Star . 17 июня 2010 г.
  5. ^ a b «Максудул Алам объявляет последовательность генома деши джута» . Новости Сомой ТВ .
  6. ^ а б Ислам, Мд Шахидул; Haque, Md Samiul; Ислам, Мохаммад Мойнул; Эмдад, Эмдадул Маннан; Халим, Абдул; Хоссен, Quazi Md Mosaddeque; Hossain, Md Zakir; Ахмед, Борхан; Рахим, Сифатур (19 сентября 2012 г.). «Инструменты для уничтожения: геном одного из наиболее разрушительных патогенных грибов растений Macrophomina phaseolina» . BMC Genomics . 13 (1): 493. DOI : 10.1186 / 1471-2164-13-493 . ISSN 1471-2164 . PMC 3477038 . PMID 22992219 .   
  7. ^ а б Мин, Рэй; Хоу, Шаобинь; Фэн, Юнь; Юй Цинъи; Дионн-Ляпорт, Александр; Пила, Джимми Х .; Сенин, Павел; Ван, Вэй; Ли, Бенджамин В. (апрель 2008 г.). «Проект генома трансгенного тропического фруктового дерева папайи (Carica papaya Linnaeus)» . Природа . 452 (7190): 991–996. Bibcode : 2008Natur.452..991M . DOI : 10,1038 / природа06856 . ISSN 0028-0836 . PMC 2836516 . PMID 18432245 .   
  8. ^ а б Рахман, Ахмад Ямин Абдул; Usharraj, Abhilash O .; Misra, Biswapriya B .; Thottathil, Gincy P .; Джаясекаран, Кандакумар; Фэн, Юнь; Хоу, Шаобинь; Онг, Су Йен; Нг, Фуй Линг (2 февраля 2013 г.). «Проект последовательности генома каучукового дерева Hevea brasiliensis» . BMC Genomics . 14 (1): 75. DOI : 10.1186 / 1471-2164-14-75 . ISSN 1471-2164 . PMC 3575267 . PMID 23375136 .   
  9. ^ Хоу, Шаобинь; Макарова, Кира С .; Пила, Джимми HW; Сенин, Павел; Ly, Benjamin V .; Чжоу, Жэминь; Рен, Ян; Ван, Цзяньмэй; Гальперин, Михаил Юрьевич (01.07.2008). «Полная последовательность генома чрезвычайно ацидофильного изолята метанотрофа V4, Methylacidiphilum infernorum, представителя бактериального типа Verrucomicrobia» . Биология Директ . 3 (1): 26. DOI : 10.1186 / 1745-6150-3-26 . ISSN 1745-6150 . PMC 2474590 . PMID 18593465 .   
  10. ^ Чен, Инь; Кромби, Эндрю; Рахман, М. Танвир; Дедыш, Светлана Н .; Лизак, Вернер; Стотт, Мэтью Б.; Алам, Максудул; Theisen, Andreas R .; Мюррелл, Дж. Колин (15.07.2010). «Полная последовательность генома аэробного факультативного метанотрофа Methylocella silvestris BL2» . Журнал бактериологии . 192 (14): 3840–3841. DOI : 10.1128 / JB.00506-10 . ISSN 0021-9193 . PMC 2897342 . PMID 20472789 .   
  11. ^ Пила, Джимми HW; Юрьев, Антон; Канбе, Масаоми; Хоу, Шаобинь; Янг, Аарон Дж .; Айзава, Син-Ити; Алам, Максудул (19 марта 2012 г.). «Полное секвенирование генома и анализ хищной морской бактерии Saprospira grandis str. Lewin» . Стандарты геномных наук . 6 (1): 84–93. DOI : 10.4056 / sigs.2445005 . ISSN 1944-3277 . PMC 3368406 . PMID 22675601 .   
  12. ^ Сакафф, Мухд Хайрул Лукман Мухд; Рахман, Ахмад Ямин Абдул; Сайто, Дженнифер А .; Хоу, Шаобинь; Алам, Максудул (01.03.2012). «Полная последовательность генома термофильных бактерий Geobacillus thermoleovorans CCB_US3_UF5» . Журнал бактериологии . 194 (5): 1239. DOI : 10,1128 / JB.06580-11 . ISSN 0021-9193 . PMC 3294819 . PMID 22328744 .   
  13. ^ Тех, Бэн Сун; Рахман, Ахмад Ямин Абдул; Сайто, Дженнифер А .; Хоу, Шаобинь; Алам, Максудул (01.03.2012). «Полная последовательность генома термофильной бактерии Thermus sp. Штамм CCB_US3_UF1» . Журнал бактериологии . 194 (5): 1240. DOI : 10,1128 / JB.06589-11 . ISSN 0021-9193 . PMC 3294796 . PMID 22328745 .   
  14. ^ Тех, Бэн Сун; Лау, Ниок-Шон; Нг, Фуй Линг; Абдул Рахман, Ахмад Ямин; Ван, Сюэхуа; Сайто, Дженнифер А .; Хоу, Шаобинь; Тех, Айк-Хонг; Наджимудин, Назалан (08.10.2015). «Полная последовательность генома термофильных Thermus sp. CCB_US3_UF1 из горячего источника в Малайзии» . Стандарты геномных наук . 10 (1): 76. DOI : 10,1186 / s40793-015-0053-6 . ISSN 1944-3277 . PMC 4599208 . PMID 26457128 .   
  15. ^ Онг, Су Йен; Пратап, Чандра Бхан; Ван, Сюэхуа; Хоу, Шаобинь; Рахман, Ахмад Ямин Абдул; Сайто, Дженнифер А .; Натх, Гопал; Алам, Максудул (15 апреля 2012 г.). «Полная последовательность генома Salmonella enterica subsp. Enterica Serovar Typhi P-stx-12» . Журнал бактериологии . 194 (8): 2115–2116. DOI : 10.1128 / JB.00121-12 . ISSN 0021-9193 . PMC 3318496 . PMID 22461552 .   
  16. ^ Mchunu, Nokuthula мира; Пермоул, Куген; Рахман, Ахмад Ямин Абдул; Сайто, Дженнифер А .; Сингх, Сурен; Алам, Максудул (27.06.2013). "Суперпродуцент ксиланазы: последовательность генома термофильного грибка, любящего компост, штамм SSBP Thermomyces lanuginosus" . Анонсы генома . 1 (3): e00388–13. DOI : 10,1128 / genomeA.00388-13 . ISSN 2169-8287 . PMC 3707600 . PMID 23788551 .   
  17. ^ Ван, Сюэхуа; Хоу, Шаобинь; Фан, Нолвенн; Мосс, Дженнифер С. Мэлоун; Доначи, Стюарт П .; Алам, Максудул (25.06.2015). «Проект последовательности генома штамма Pantoea anthophila 11-2 из гиперсоленого озера Лайсан, Гавайи» . Анонсы генома . 3 (3): e00321–15. DOI : 10,1128 / genomeA.00321-15 . ISSN 2169-8287 . PMC 4432323 . PMID 25977417 .   
  18. ^ Weilenman, Донна Бет (19 июня 2019). «Женщина, шедшая по железной дороге, сбита, убита поездом» . Martinez News-Gazette .
  19. ^ "Биография-Лилиана" . Сайты Google .
  20. ^ "Маленькая команда гена UH достигает большого подвига" . Звездный бюллетень . 2003 г.
  21. Перейти ↑ Borrell, Brendan (2008-04-23). «Проект генома папайи приносит свои плоды» . Природа . DOI : 10.1038 / новости.2008.772 . ISSN 0028-0836 . 
  22. ^ «Раскрыта последовательность генома джута» . Бангладешская лига авами .
  23. ^ "Последовательность генома джута, расшифрованная учеными Бангладеш" . Hindustan Times .
  24. ^ "Ученый Максудул Алам скончался" . Протом-Ало . 21 декабря 2014 г.
  25. ^ "Декодер джутового генома Максудул Алам скончался" . Daily Star . 20 декабря 2014 . Проверено 21 декабря 2014 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  26. ^ "Премия Дня Независимости" (PDF) . Правительство Бангладеш . Проверено 23 сентября 2016 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  27. ^ Тан, Хайбао; Бауэрс, Джон Э .; Ван, Сиинь; Мин, Рэй; Алам, Максудул; Патерсон, Эндрю Х. (25 апреля 2008 г.). «Синтения и коллинеарность в геномах растений». Наука . 320 (5875): 486–488. Bibcode : 2008Sci ... 320..486T . DOI : 10.1126 / science.1153917 . ISSN 0036-8075 . PMID 18436778 . S2CID 206510918 .   
  28. ^ Фрейтас, Трейси Аллен К .; Сайто, Дженнифер А .; Ван, Сюэхуа; Хоу, Шаобинь; Алам, Maqsudul (2008), "Protoglobin и Глобин-соединенные датчики", Наималейшие биомолекул: двухатомные молекулы и их взаимодействие с гемом белками , Elsevier, С. 175-202,. Да : 10.1016 / b978-044452839-1.50008-5 , ISBN 9780444528391