Минимум информации об эксперименте с микрочипом
 | Эта статья требует дополнительных ссылок для проверки . ( январь 2015 г. ) |
Минимум информации об эксперименте с микрочипом ( MIAME ) - это стандарт, созданный Обществом FGED для сообщения об экспериментах с микрочипами . [1]
MIAME предназначен для указания всей информации, необходимой для однозначной интерпретации результатов эксперимента и потенциального воспроизведения эксперимента. Хотя стандарт определяет содержание, необходимое для совместимых отчетов, он не определяет формат, в котором эти данные должны быть представлены. MIAME описывает минимум информации, необходимой для обеспечения простой интерпретации данных микрочипа и возможности независимой проверки результатов, полученных в результате его анализа. [2] Существует ряд форматов файлов, используемых для представления этих данных, а также как общедоступные, так и основанные на подписке репозитории для таких экспериментов. [3] Кроме того, существует программное обеспечение для помощи в подготовке отчетов, соответствующих стандарту MIAME.
MIAME вращается вокруг шести ключевых компонентов: необработанных данных , нормализованных данных , аннотаций к образцам, плана эксперимента , аннотаций массивов и протоколов данных.
использованная литература
- ^ "Домашняя страница MIAME" . Сайт Общества ФГЭД . Проверено 13 сентября 2012 .
- ^ Brazma А, Hingamp Р, Квакенбуш Дж, Шерлок G, Спеллман Р, Stoeckert С, Aach Дж, Ansorge Вт, Болл СА, Causton НС, Gaasterland Т, Glenisson Р, Холстедж ФК, Ким И.Ф., Марковиц В, Matese JC,Паркинсона H, Робинсон А., Сарканс Ю., Шульце-Кремер С., Стюарт Дж., Тейлор Р., Вило Дж., Вингрон М. Минимальная информация об эксперименте с микрочипами (MIAME) - стандарты для данных микрочипов. Нат Жене. 2001 декабрь; 29 (4): 365-71. DOI: 10,1038 / NG1201-365. PMID: 11726920.
- ^ Brazma A, Hingamp P, Quackenbush J и др. Минимум информации об эксперименте с микрочипами (MIAME) - прямые стандарты для данных с микрочипов. Нат Жене. 2001; 29 (4): 365-371. DOI: 10,1038 / NG1201-365.
