Нефернефруатон может относиться к нескольким членам королевской семьи Амарна 18-й династии:
- Нефернефруатон , женщина-правитель или соправительница, которая совпала с последними годами правления Эхнатона или сразу после его правления
- Нефертити , которая взяла полное имя Нефернеферуатон-Нефертити около 5 года правления своего мужа Эхнатона.
- Нефернеферуатон Ташерит , четвертая дочь Эхнатона и Нефертити
- Сменхкаре , иногда путают с Нефернефруатен