Семейство NhaB ( TC # 2.A.34 ) принадлежит к суперсемейству Ion Transporter (IT) . [1] Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству NhaB, можно найти в базе данных классификации транспортеров .
Гомологи NhaB обычно имеют длину около 500 аминоацильных остатков (аас) и имеют около 12 трансмембранных α-спиральных гаечных ключей (ТМС), хотя некоторые члены различаются по количеству ТМС. Гомологи NhaB также обнаруживают область с ограниченным сходством последовательности с мембранным белком 46 кДа неизвестной функции из Mycobacterium leprae (spP46838), который также гомологичен члену насосов устойчивости к арсенату бактерий, архей и эукариот ( TC # 3.A.4. ). Функционально охарактеризованы только грамотрицательные бактериальные белки.
Кишечная палочка NhaB на 58% идентичен ортологический Vibrio alginolyticus Na + / H + антипортер. [2] Хотя последний белок предположительно демонстрирует 10 TMS, конструирование слияний NhaB-phoA привело к доказательству модели 9 TMS с N-концом в цитоплазме и C-концом в периплазме . [3] Центрально расположенный остаток аспартила в 3-м TMS является консервативным у всех членов семейства и важен для активности. [4]
Обобщенная транспортная реакция, катализируемая NhaB E. coli :
2 Na + (вход) + 3 H + (выход) ⇌ 2 Na + (выход) + 3 H + (вход).
См. Также [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ Пракаш, Шраддха; Купер, Гаррет; Сингхи, Сумья; Сайер, Милтон Х. (2003-12-03). «Суперсемейство ионных переносчиков». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны . 1618 (1): 79–92. DOI : 10.1016 / j.bbamem.2003.10.010 . ISSN 0006-3002 . PMID 14643936 .
- ^ Пиннер, E .; Padan, E .; Шульдинер, С. (1992-06-05). «Клонирование, секвенирование и экспрессия гена nhaB, кодирующего Na + / H + -антипортер в Escherichia coli». Журнал биологической химии . 267 (16): 11064–11068. ISSN 0021-9258 . PMID 1317851 .
- ^ Enomoto, H .; Unemoto, T .; Nishibuchi, M .; Padan, E .; Накамура, Т. (1998-03-06). «Топологическое исследование антипортера Na + / H + Vibrio alginolyticus NhaB с использованием слияния генов в клетках Escherichia coli». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны . 1370 (1): 77–86. DOI : 10.1016 / s0005-2736 (97) 00245-9 . ISSN 0006-3002 . PMID 9518558 .
- ^ Накамура, Т .; Fujisaki, Y .; Enomoto, H .; Nakayama, Y .; Takabe, T .; Yamaguchi, N .; Уодзуми, Н. (2001-10-01). «Остаток аспартата-147 из третьей трансмембранной области Na (+) / H (+) антипортера NhaB Vibrio alginolyticus играет роль в его активности» . Журнал бактериологии . 183 (19): 5762–5767. DOI : 10.1128 / JB.183.19.5762-5767.2001 . ISSN 0021-9193 . PMC 95471 . PMID 11544242 .
На момент редактирования в этой статье используется контент из «2.A.34 Семейство NhaB Na +: H + Antiporter (NhaB)» , который лицензирован таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с непортированной лицензией Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 , но не под GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.
