Протестантская церковь Джибути была основана в 1960 году армейскими капелланами французских войск . После обретения независимости церковные здания перешли в собственность Федерации протестантских церквей. Единый приход быстро развивался, были созданы регулярные богослужения и библейские школы, они поддерживали работу беженцев. Протестантская церковь Джибути принимает в своей религиозной жизни христиан из разных стран ( Конго , Франция, Бурунди , США), а также различных конфессий (реформатская, лютеранская, баптистская, адвентистская, меннонитская). [1] [2]