• связывание ДНК • ДНК - связывающая последовательность конкретной • РНК - полимераза ДНК регуляторной области II последовательности-специфическое связывание • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор активность транскрипции • элемент витамин D ответа связывание • GO : 0001105 транскрипция коактиватор активность • транскрипционного фактор связывание • ретиноевая кислота реагирующего элемента связывания • связывание иона металла • стероида активности в отношении рецептора гормона • GO: 0038050, GO: 0004886, 0038051 GO: активности ядерных рецепторов • GO: связывание белка 0001948 • Белок гетеродимеризация активность • фермент связывание • связывание хроматина ДНК • связывание витамина D рецепторов • ретиноевой кислоты связывания • двухцепочечной ДНК связывание • ион цинк связывание • лиганд-зависимый ядерный рецептор связывание • связывающий пептид • домена DBD связывания • домена LBD связывание • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая • активность сигнального рецептора
Сотовый компонент
• рецепторный комплекс • нуклеоплазма • комплекс факторов транскрипции РНК-полимераза II • ядерный хроматин • ядро клетки • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс
• сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами • регуляция ветвления, участвующая в морфогенезе предстательной железы • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • плацентация • сигнальный путь рецептора, активируемый пролифератором пероксисом • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • процесс метаболизма холестерина • внутриутробное эмбриональное развитие • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • пролиферация клеток сердечной мышцы • дифференцировка секреторных столбчатых люминарных эпителиальных клеток, участвующих в развитии ацинуса предстательной железы • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • морфогенез ткани желудочковой сердечной мышцы • развитие сердца • сигнальный путь рецептора ретиноевой кислоты • развитие материнской плаценты • модуляция вирусом морфологии или физиологии хозяина • процесс метаболизма витаминов • желчная кислота и транспорт желчных солей • дифференциация клеток желудочковой сердечной мышцы • развитие глаз по типу камеры • вирусный процесс GO: 0022415 • гомотетрамеризация белков • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • имплантация эмбриона • позитивная регуляция инициации трансляции железом • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в клеточном ответе на химический стимул • ответ на ретиноевую кислоту • регуляция липидного обмена
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
6256
20181
Ансамбль
ENSG00000186350
ENSMUSG00000015846
UniProt
P19793
P28700
RefSeq (мРНК)
NM_002957 NM_001291920 NM_001291921
NM_001290481 NM_001290482 NM_011305
RefSeq (белок)
NP_001278849 NP_001278850 NP_002948
NP_001277410 NP_001277411 NP_035435
Расположение (UCSC)
Chr 9: 134,32 - 134,44 Мб
Chr 2: 27.68 - 27.76 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Ретиноидный рецептор X-альфа ( RXR-альфа ), также известный как NR2B1 (подсемейство ядерных рецепторов 2, группа B, член 1), представляет собой ядерный рецептор, который у человека кодируется геном RXRA . [5]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 Интерактивная карта проезда
3 взаимодействия
4 См. Также
5 ссылки
6 Дальнейшее чтение
7 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Рецепторы ретиноидов X (RXR) и рецепторы ретиноевой кислоты (RAR) представляют собой ядерные рецепторы, которые опосредуют биологические эффекты ретиноидов, участвуя в активации генов , опосредованной ретиноевой кислотой . Эти рецепторы проявляют свое действие путем связывания в виде гомодимеров или гетеродимеров со специфическими последовательностями в промоторах генов-мишеней и регуляции их транскрипции. Белок, кодируемый этим геном, является членом суперсемейства факторов транскрипции стероидных и тироидных рецепторов . [6]В отсутствие лиганда гетеродимеры RXR-RAR связываются с мультибелковым комплексом, содержащим корепрессоры транскрипции, которые вызывают деацетилирование гистонов, конденсацию хроматина и подавление транскрипции. При связывании лиганда корепрессоры отделяются от рецепторов и связываются с коактиваторами, что приводит к активации транскрипции. Гетеродимер RXRA / PPARA необходим для транскрипционной активности PPARA в отношении генов окисления жирных кислот, таких как ACOX1 и гены системы цитохрома P450 . [7]
Интерактивная карта проезда [ править ]
Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]
^ Интерактивную карту путей можно отредактировать на WikiPathways: "VitaminDSynthesis_WP1531" .
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что альфа-рецептор ретиноида X взаимодействует с:
BCL3 , [8]
BRD8 , [9]
ЧАСЫ , [10]
FXR [11]
IGFBP3 , [12]
ITGB3BP , [13]
LXR-β , [11]
MyoD , [14]
NCOA6 , [15] [16] [17] [18]
НФКБИБ , [19]
НПАС2 , [10]
NRIP1 , [20] [21]
NR4A1 , [22]
NCOA2 , [23]
NCOA3 , [24]
POU2F1 , [25] [26]
PPARGC1A , [27]
PPAR-γ , [28] [29] [30]
RNF8 , [31]
RAR-α , [32] [33]
SHP , [34] [35]
TADA3L , [36]
TBP , [37]
TRIM24 , [38] [39]
TR-β , [40] [41] и
VDR . [23] [42]
См. Также [ править ]
Ретиноидный рецептор X
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000186350 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015846 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Mangelsdorf DJ, Ong ES, Дейка JA, Evans RM (май 1990). «Ядерный рецептор, который определяет новый путь ответа на ретиноевую кислоту». Природа . 345 (6272): 224–9. Bibcode : 1990Natur.345..224M . DOI : 10.1038 / 345224a0 . PMID 2159111 . S2CID 4232833 .
^ Na SY, Choi HS, Ким JW, Na DS, Lee JW (1998). «Bcl3, белок IkappaB, как новый коактиватор транскрипции ретиноидного рецептора X» . J. Biol. Chem . 273 (47): 30933–8. DOI : 10.1074 / jbc.273.47.30933 . PMID 9812988 .
^ Monden Т, Kishi М, Хосоя Т, Т Сато, Wondisford ИП, Холленберг А.Н., Ямада М, Мори М (1999). «p120 действует как специфический коактиватор рецептора 9-цис-ретиноевой кислоты (RXR) на гетеродимерах гамма / RXR рецептора, активируемого пролифератором пероксисом». Мол. Эндокринол . 13 (10): 1695–703. DOI : 10,1210 / me.13.10.1695 . PMID 10517671 .
^ a b Макнамара П., Сео С.Б., Рудик Р.Д., Сегал А., Чакраварти Д., Фитцджеральд Г.А. (2001). «Регулирование ЧАСОВ и MOP4 рецепторами ядерных гормонов в сосудистой сети: гуморальный механизм для сброса периферических часов». Cell . 105 (7): 877–89. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00401-9 . PMID 11439184 . S2CID 6251321 .
^ а б Соль В., Чой Х.С., Мур Д.Д. (1995). «Выделение белков, которые специфически взаимодействуют с рецептором ретиноида X: два новых сиротских рецептора» . Мол. Эндокринол . 9 (1): 72–85. DOI : 10.1210 / mend.9.1.7760852 . PMID 7760852 .
^ Лю Б., Ли Х.Й., Вайнзимер С.А., Пауэлл Д.Р., Клиффорд Дж. Л., Кури Дж. М., Коэн П. (2000). «Прямые функциональные взаимодействия между инсулиноподобным фактором роста-связывающим белком-3 и ретиноидным X-рецептором-альфа регулируют передачу сигналов транскрипции и апоптоз» . J. Biol. Chem . 275 (43): 33607–13. DOI : 10.1074 / jbc.M002547200 . PMID 10874028 .
^ Li D, Десаи-Yajnik В, Ло Е, Шапира М, Абагян R, Сэмуелс HH (1999). «NRIF3 - новый коактиватор, опосредующий функциональную специфичность рецепторов ядерных гормонов» . Мол. Клетка. Биол . 19 (10): 7191–202. DOI : 10.1128 / mcb.19.10.7191 . PMC 84712 . PMID 10490654 .
^ Froeschlé А, Alric S, Kitzmann М, КАРНАК G, Ораде F, Рошетты-Egly С, Bonnieu А (1998). «Рецепторы ретиноевой кислоты и мышечные белки b-HLH: партнеры в миогенезе, индуцированном ретиноидами» . Онкоген . 16 (26): 3369–78. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201894 . PMID 9692544 .
^ Ли СК, Анзик С.Л., Чой Дж. Э., Бубендорф Л., Гуан XY, Юнг Ю. К., Каллиониеми О. П., Кононен Дж., Трент Дж. М., Азорса Д., Джун Б. Х., Чеонг Дж. Х., Ли Ю. С., Мельцер П. С., Ли Дж. В. (1999). «Ядерный фактор, ASC-2, как усиленный раком транскрипционный коактиватор, необходимый для лиганд-зависимой трансактивации ядерными рецепторами in vivo» . J. Biol. Chem . 274 (48): 34283–93. DOI : 10.1074 / jbc.274.48.34283 . PMID 10567404 .
Перейти ↑ Lee SK, Jung SY, Kim YS, Na SY, Lee YC, Lee JW (2001). «Два различных домена взаимодействия ядерных рецепторов и CREB-связывающий белок-зависимая трансактивационная функция активирующего сигнального коинтегратора-2» . Мол. Эндокринол . 15 (2): 241–54. DOI : 10,1210 / me.15.2.241 . PMID 11158331 .
^ Kong HJ, Парк MJ, Hong S, Ю. HJ, Ли YC, Choi YH, Чонг J (2003). «Белок вируса Х гепатита В регулирует активность трансактивации и стабильность белка коактиватора транскрипции, усиленного раком, ASC-2» . Гепатология . 38 (5): 1258–66. DOI : 10.1053 / jhep.2003.50451 . PMID 14578865 . S2CID 29349615 .
Перейти ↑ Ko L, Cardona GR, Iwasaki T, Bramlett KS, Burris TP, Chin WW (2002). «Ser-884, смежный с мотивом LXXLL коактиватора TRBP, определяет селективность в отношении ER и TR» . Мол. Эндокринол . 16 (1): 128–40. DOI : 10.1210 / mend.16.1.0755 . PMID 11773444 .
^ Na SY, Ким HJ, Ли SK, Чой HS, Na DS, Ли МО, Чунг М., Мур Д.Д., Ли JW (1998). «IkappaBbeta взаимодействует с рецептором ретиноида X и ингибирует ретиноид-зависимую трансактивацию в клетках, обработанных липополисахаридом» . J. Biol. Chem . 273 (6): 3212–5. DOI : 10.1074 / jbc.273.6.3212 . PMID 9452433 .
^ Фаруки М, Франко П., Томпсон Дж, Kagechika Н, Chandraratna Р.А., Banaszak л, Вэй Л. Н. (2003). «Эффекты ретиноидных лигандов на RIP140: молекулярное взаимодействие с ретиноидными рецепторами и биологическая активность». Биохимия . 42 (4): 971–9. DOI : 10.1021 / bi020497k . PMID 12549917 .
^ L'Horset F, Dauvois S, Heery Д.М., Cavaillès В, Паркер М. (1996). «RIP-140 взаимодействует с множеством ядерных рецепторов посредством двух различных сайтов» . Мол. Клетка. Биол . 16 (11): 6029–36. DOI : 10,1128 / MCB.16.11.6029 . PMC 231605 . PMID 8887632 .
^ Lin B, Kolluri SK, Лин F, Лю W, Хан YH, Цао X, Dawson М. Рид JC, Чжан XK (2004). «Превращение Bcl-2 из протектора в убийцу путем взаимодействия с ядерным сиротским рецептором Nur77 / TR3». Cell . 116 (4): 527–40. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (04) 00162-X . PMID 14980220 . S2CID 17808479 .
^ а б Чжан С., Баудино Т.А., Дауд Д.Р., Токумару Х., Ван В., Макдональд П.Н. (2001). «Тройные комплексы и кооперативное взаимодействие между NCoA-62 / Ski-взаимодействующим белком и коактиваторами стероидных рецепторов в транскрипции, опосредованной рецептором витамина D» . J. Biol. Chem . 276 (44): 40614–20. DOI : 10.1074 / jbc.M106263200 . PMID 11514567 .
Перейти ↑ Chen H, Lin RJ, Schiltz RL, Chakravarti D, Nash A, Nagy L, Privalsky ML, Nakatani Y, Evans RM (1997). «Коактиватор ядерного рецептора ACTR представляет собой новую гистонацетилтрансферазу и образует мультимерный активационный комплекс с P / CAF и CBP / p300». Cell . 90 (3): 569–80. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80516-4 . PMID 9267036 . S2CID 15284825 .
^ Prefontaine GG, Walther R, Гиффин W, Лемье ME, папа L, Hache RJ (1999). «Селективное связывание рецепторов стероидных гормонов с факторами транскрипции октамера определяет синергизм транскрипции на промоторе вируса опухоли молочной железы мыши» . J. Biol. Chem . 274 (38): 26713–9. DOI : 10.1074 / jbc.274.38.26713 . PMID 10480874 .
^ Kakizawa Т, Т Миямото, Итикав К, Канеко А, Сузуки S, Хара М, Нагасав Т, Т Такеда, Морите Джи, Кумагайте М, Hashizume К (1999). «Функциональное взаимодействие Oct-1 с рецептором ретиноида X» . J. Biol. Chem . 274 (27): 19103–8. DOI : 10.1074 / jbc.274.27.19103 . PMID 10383413 .
^ Delerive P, Wu Y, Burris TP, Chin WW, Suen CS (2002). «PGC-1 действует как транскрипционный коактиватор для рецепторов ретиноидов X» . J. Biol. Chem . 277 (6): 3913–7. DOI : 10.1074 / jbc.M109409200 . PMID 11714715 .
^ Tontonoz Р, Грейвс Р.А., Budavari А.И., Erdjument-Бромейдж Н, Луи М, Х Е, Р Tempst, Spiegelman БЙ (1994). «Адипоцит-специфический фактор транскрипции ARF6 представляет собой гетеродимерный комплекс двух ядерных рецепторов гормонов, PPAR гамма и RXR альфа» . Nucleic Acids Res . 22 (25): 5628–34. DOI : 10.1093 / NAR / 22.25.5628 . PMC 310126 . PMID 7838715 .
^ Бергер Дж, Пател Х.В., Вудс Дж., Хейс Н.С., Родитель С.А., Клемас Дж., Лейбовиц М.Д., Эльбрехт А., Рачубински Р.А., Капоне Дж. П., Моллер Д.Е. (2000). «Мутант PPARgamma служит доминантно-отрицательным ингибитором передачи сигналов PPAR и локализуется в ядре». Мол. Клетка. Эндокринол . 162 (1–2): 57–67. DOI : 10.1016 / S0303-7207 (00) 00211-2 . PMID 10854698 . S2CID 20343538 .
↑ Takano Y, Adachi S, Okuno M, Muto Y, Yoshioka T, Matsushima-Nishiwaki R, Tsurumi H, Ito K, Friedman SL, Moriwaki H, Kojima S, Okano Y (2004). «Белок пальца RING, RNF8, взаимодействует с альфа-рецептором ретиноида X и усиливает его активность, стимулирующую транскрипцию» . J. Biol. Chem . 279 (18): 18926–34. DOI : 10.1074 / jbc.M309148200 . PMID 14981089 .
^ Benkoussa M, марка C, Дельмот MH, Formstecher P, P Лефевр (2002). «Рецепторы ретиноевой кислоты ингибируют активацию AP1 путем регулирования регулируемой внеклеточным сигналом киназы и рекрутирования CBP на AP1-чувствительный промотор» . Мол. Клетка. Биол . 22 (13): 4522–34. DOI : 10.1128 / MCB.22.13.4522-4534.2002 . PMC 133906 . PMID 12052862 .
^ Ли Ю.К., Dell H, Dowhan DH, Hadzopoulou-Cladaras M, Moore DD (2000). «Орфанный ядерный рецептор SHP ингибирует ядерный фактор 4 гепатоцитов и трансактивацию рецептора ретиноида X: два механизма репрессии» . Мол. Клетка. Биол . 20 (1): 187–95. DOI : 10.1128 / MCB.20.1.187-195.2000 . PMC 85074 . PMID 10594021 .
^ Брендел С, Schoonjans К, Botrugno О.А., Treuter Е, Auwerx J (2002). «Малый гетеродимерный партнер взаимодействует с альфа-рецептором Х печени и подавляет его транскрипционную активность» . Мол. Эндокринол . 16 (9): 2065–76. DOI : 10.1210 / me.2001-0194 . PMID 12198243 .
Перейти ↑ Zeng M, Kumar A, Meng G, Gao Q, Dimri G, Wazer D, Band H, Band V (2002). «Онкобелок Е6 вируса папилломы человека 16 ингибирует трансактивацию, опосредованную ретиноидным X-рецептором, направляя коактиватор ADA3 человека» . J. Biol. Chem . 277 (47): 45611–8. DOI : 10.1074 / jbc.M208447200 . PMID 12235159 .
^ Шулмэн И.Г., Чакраварти Д, Juguilon Н, Ромо А, Эванс Р. М. (1995). «Взаимодействие между ретиноидным рецептором Х и консервативной областью ТАТА-связывающего белка опосредует гормонозависимую трансактивацию» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (18): 8288–92. Bibcode : 1995PNAS ... 92.8288S . DOI : 10.1073 / pnas.92.18.8288 . PMC 41142 . PMID 7667283 .
^ Thénot S, Henriquet С, Рошфор Н, Cavaillès В (1997). «Дифференциальное взаимодействие ядерных рецепторов с предполагаемым коактиватором транскрипции человека hTIF1» . J. Biol. Chem . 272 (18): 12062–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.18.12062 . PMID 9115274 .
^ Ли WY, Noy N (2002). «Взаимодействия RXR с коактиваторами по-разному опосредуются спиралью 11 лиганд-связывающего домена рецептора». Биохимия . 41 (8): 2500–8. DOI : 10.1021 / bi011764 + . PMID 11851396 .
^ Monden Т, Wondisford ИП, Холленберг А.Н. (1997). «Выделение и характеристика нового лиганд-зависимого белка, коактивирующего рецептор тироидного гормона» . J. Biol. Chem . 272 (47): 29834–41. DOI : 10.1074 / jbc.272.47.29834 . PMID 9368056 .
^ Jeyakumar M, Tanen MR, Багчи MK (1997). «Анализ функциональной роли коактиватора-1 стероидного рецептора в лиганд-индуцированной трансактивации рецептором тироидного гормона» . Мол. Эндокринол . 11 (6): 755–67. DOI : 10.1210 / mend.11.6.0003 . PMID 9171239 .
^ Baudino Т.А., Kraichely DM, Jefcoat SC, Winchester SK, Партридж NC, MacDonald PN (1998). «Выделение и характеристика нового белка-коактиватора NCoA-62, участвующего в опосредованной витамином D транскрипции» . J. Biol. Chem . 273 (26): 16434–41. DOI : 10.1074 / jbc.273.26.16434 . PMID 9632709 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Сзанто А., Наркар В., Шен К., Урай И. П., Дэвис П. Дж., Надь Л. (декабрь 2004 г.). «Ретиноидные X-рецепторы: X-проявляют свои (пато) физиологические функции» . Смерть клетки отличается . 11 Приложение 2: S126–43. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401533 . PMID 15608692 .
Heyman RA, Mangelsdorf DJ, Dyck JA, Stein RB, Eichele G, Evans RM, Thaller C (январь 1992 г.). «9-цис-ретиноевая кислота является лигандом с высоким сродством к рецептору ретиноида X». Cell . 68 (2): 397–406. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (92) 90479-V . PMID 1310260 . S2CID 39338234 .
Кливер С.А., Умесоно К., Мангельсдорф Д.Д., Эванс Р.М. (январь 1992 г.). «Ретиноидный рецептор X взаимодействует с ядерными рецепторами ретиноевой кислоты, гормона щитовидной железы и передачи сигналов витамина D3» . Природа . 355 (6359): 446–9. Bibcode : 1992Natur.355..446K . DOI : 10.1038 / 355446a0 . PMC 6159885 . PMID 1310351 .
Mangelsdorf DJ, Umesono K, Kliewer SA, Borgmeyer U, Ong ES, Evans RM (август 1991 г.). «Прямой повтор в гене клеточного ретинол-связывающего белка типа II обеспечивает дифференциальную регуляцию с помощью RXR и RAR». Cell . 66 (3): 555–61. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (81) 90018-0 . PMID 1651173 . S2CID 13444623 .
Mangelsdorf DJ, Ong ES, Dyck JA, Evans RM (май 1990 г.). «Ядерный рецептор, который определяет новый путь ответа на ретиноевую кислоту». Природа . 345 (6272): 224–9. Bibcode : 1990Natur.345..224M . DOI : 10.1038 / 345224a0 . PMID 2159111 . S2CID 4232833 .
Чен Дж. Д., Эванс Р. М. (1995). «Корепрессор транскрипции, который взаимодействует с рецепторами ядерных гормонов». Природа . 377 (6548): 454–7. Bibcode : 1995Natur.377..454C . DOI : 10.1038 / 377454a0 . PMID 7566127 . S2CID 4361329 .
Шульман И.Г., Чакраварти Д., Джугилон Х., Ромо А., Эванс Р.М. (август 1995 г.). «Взаимодействия между ретиноидным рецептором X и консервативной областью TATA-связывающего белка опосредуют гормонозависимую трансактивацию» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (18): 8288–92. Bibcode : 1995PNAS ... 92.8288S . DOI : 10,1073 / пнас.92.18.8288 . PMC 41142 . PMID 7667283 .
Перлманн Т., Янссон Л. (апрель 1995 г.). «Новый путь передачи сигналов витамина А, опосредованный гетеродимеризацией RXR с NGFI-B и NURR1» . Genes Dev . 9 (7): 769–82. DOI : 10,1101 / gad.9.7.769 . PMID 7705655 .
Соль В., Чой Х.С., Мур Д.Д. (1995). «Выделение белков, которые специфически взаимодействуют с рецептором ретиноида X: два новых сиротских рецептора» . Мол. Эндокринол . 9 (1): 72–85. DOI : 10.1210 / mend.9.1.7760852 . PMID 7760852 .
Бурге В., Рафф М., Шамбон П., Гронемейер Н., Морас Д. (июнь 1995 г.). «Кристаллическая структура лиганд-связывающего домена человеческого ядерного рецептора RXR-альфа». Природа . 375 (6530): 377–82. Bibcode : 1995Natur.375..377B . DOI : 10.1038 / 375377a0 . PMID 7760929 . S2CID 4371873 .
Ли Дж. У., Чой Х. С., Гьюрис Дж., Брент Р., Мур Д. Д. (февраль 1995 г.). «Два класса белков, зависящих от наличия или отсутствия тироидного гормона для взаимодействия с рецептором тироидного гормона». Мол. Эндокринол . 9 (2): 243–54. DOI : 10,1210 / me.9.2.243 . PMID 7776974 .
Tontonoz P, Graves RA, Budavari AI, Erdjument-Bromage H, Lui M, Hu E, Tempst P, Spiegelman BM (декабрь 1994 г.). «Адипоцит-специфический фактор транскрипции ARF6 представляет собой гетеродимерный комплекс двух ядерных рецепторов гормонов, PPAR гамма и RXR альфа» . Nucleic Acids Res . 22 (25): 5628–34. DOI : 10.1093 / NAR / 22.25.5628 . PMC 310126 . PMID 7838715 .
Ли Дж. У., Райан Ф., Сваффилд Дж. С., Джонстон С. А., Мур Д. Д. (март 1995 г.). «Взаимодействие рецептора тироидного гормона с консервативным медиатором транскрипции». Природа . 374 (6517): 91–4. Bibcode : 1995Natur.374 ... 91L . DOI : 10.1038 / 374091a0 . PMID 7870181 . S2CID 4324595 .
Ли М.С., Сем Д.С., Кливер С.А., Провансальский Дж., Эванс Р.М., Райт ЧП (сентябрь 1994 г.). «Назначение ЯМР и вторичная структура ДНК-связывающего домена альфа-рецептора ретиноида X. Доказательства новой C-концевой спирали». Евро. J. Biochem . 224 (2): 639–50. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1994.00639.x . PMID 7925381 .
Внешние ссылки [ править ]
FactorBook RXRA
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .
vтеPDB галерея
1by4 : СТРУКТУРА И МЕХАНИЗМ ГОМОДИМЕРНОЙ АССАМБЛЕИ RXR НА ДНК
1dkf : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ГЕТЕРОДИМЕРИЧЕСКОГО КОМПЛЕКСА RAR- И RXR-ЛИГАНД-СВЯЗЫВАЮЩИХ ДОМЕНОВ
1dsz : СТРУКТУРА ГЕТЕРОДИМЕРА ДНК-СВЯЗЫВАЮЩЕГО ДОМЕНА RXR / RAR В КОМПЛЕКСЕ С ЭЛЕМЕНТОМ ОТВЕТСТВЕННОСТИ НА РЕТИНОВУЮ КИСЛОТУ DR1
1fby : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА АЛЬФА-ЛИГАНДА RXR ЧЕЛОВЕКА, СВЯЗАННАЯ С РЕТИНОВОЙ КИСЛОТОЙ 9-CIS
1fm6 : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА РАЗРЕШЕНИЯ АНГСТРОМА 2.1 ГЕТЕРОДИМЕРА ЛИГАНДА RXRALPHA ЧЕЛОВЕКА И ППАРГАММА-ЛИГАНДА ДОМЕНОВ, ОТНОСИТЕЛЬНО СВЯЗАННЫХ С РЕТИНОВОЙ КИСЛОТОЙ 9-ЦИС, РОЗИГЛИТАЗОНОМ И СОАКТИВАТОРОМ P.
1fm9 : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА РАЗРЕШЕНИЯ АНГСТРОМА 2.1 ГЕТЕРОДИМЕРА ДОМЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ЛИГАНДАМИ RXRALPHA И ППАРГАММА ЧЕЛОВЕКА, ОТНОСИТЕЛЬНО СВЯЗАННЫХ С РЕТИНОВОЙ КИСЛОТОЙ 9-CIS, GI262570 И СОАКТИВАТОРОМ ПЕПТИДА.
1g1u : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА РАЗРЕШЕНИЯ АНГСТРОМА 2.5 ЛИГАНДА RXRALPHA В ТЕТРАМЕРЕ В ОТСУТСТВИИ ЛИГАНДА
1g5y : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА РАЗРЕШЕНИЯ АНГСТРОМА 2,0 ЛИГАНДА RXRALPHA, СВЯЗЫВАЮЩЕГО ДОМЕННЫЙ ТЕТРАМЕР, В ПРИСУТСТВИИ НЕАКТИВИРУЮЩЕГОСЯ ИЗОМЕРА РЕТИНОВОЙ КИСЛОТЫ.
1k74 : Кристаллическая структура с разрешением 2,3 Ангстрема гетеродимера лиганд-связывающих доменов PPARgamma и RXRalpha человека, связанного соответственно с GW409544 и 9-цис-ретиноевой кислотой и коактиваторными пептидами.
1lbd : ЛИГАНД- СВЯЗЫВАЮЩАЯ ОБЛАСТЬ ЯДЕРНОГО РЕЦЕПТОРА ЧЕЛОВЕКА RXR-ALPHA
1mv9 : Кристаллическая структура домена связывания альфа-лиганда RXR человека, связанного с эйкозаноидом DHA (докоза-гексаеновая кислота) и коактиваторным пептидом.
1mvc : Кристаллическая структура домена связывания альфа-лиганда RXR человека, связанного с синтетическим агонистическим соединением BMS 649 и коактиваторным пептидом.
1 мзн : КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ПРИ РАЗРЕШЕНИИ ANGSTROEMS 1,9 ГОМОДИМЕРА АЛЬФАЛИГАНДА RXR ЧЕЛОВЕКА, СВЯЗАННОГО ДОМЕНА, СВЯЗАННОГО С СИНТЕТИЧЕСКИМ АГОНИСТОМ, СОЕДИНЕНИЕМ BMS 649 И КОАКТИВАТОРОМ ПЕПТИДА
1r0n : Кристаллическая структура ДНК-связывающего комплекса гетеродимерного рецептора экдсиона
1rdt : Кристаллическая структура нового рексиноида, связанного с лигандом RXRalpha, связывающим доамин в гетеродимере RXRalpha / PPARgamma.
1rxr : СТРУКТУРА ВЫСОКОГО РАЗРЕШЕНИЯ РЕЦЕПТОРА РЕТИНОИДА Х ДНК-СВЯЗЫВАЮЩЕГО ДОМЕНА, ЯМР, 20 СТРУКТУРА
1xdk : Кристаллическая структура гетеродимера связывающего домена лиганда RARbeta / RXRalpha в комплексе с 9-цис-ретиноевой кислотой и фрагментом коактиватора TRAP220
1xls : Кристаллическая структура гетеродимера LBD CAR / RXR мыши, связанного с TCPOBOP и 9cRA, и пептида TIF2, содержащего третьи мотивы LXXLL.
1xv9 : кристаллическая структура гетеродимера CAR / RXR, связанного с пептидом SRC1, жирной кислотой и 5b-прегнан-3,20-дионом.
1xvp : кристаллическая структура гетеродимера CAR / RXR, связанного с пептидом SRC1, жирной кислотой и CITCO
1ynw : Кристаллическая структура ДНК-связывающих доменов рецептора витамина D и 9-цис-рецептора ретиноевой кислоты, связанных с элементом ответа DR3
2acl : связывающий домен альфа-лиганда Х-рецептора печени с SB313987
2nll : РЕТИНОИД Х-РЕЦЕПТОР-ТИРЕОИДНЫЙ ГОРМОН-РЕЦЕПТОР, ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ДОМЕН ГЕТЕРОДИМЕР, СВЯЗАННЫЙ С ДНК ЭЛЕМЕНТА ТИРЕОИДНОГО ОТВЕТА
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора