Spinal Cord Toolbox (SCT) [1] - это набор инструментов для анализа, оптимизированных для изображений спинного мозга, полученных с помощью магнитно-резонансной томографии . Основные функции включают сегментацию, регистрацию и расчет анатомических показателей.
Шаблон PAM50 анатомический шаблон спинного мозга , который охватывает полный спинного мозга и ствола мозга и доступен для T1-, t2- и Т2 * -weighted МРТ контрасты. Шаблон PAM50 включает вероятностную сегментацию белого вещества, серого вещества, CSF, а также вероятностные атласы подобластей серого вещества и путей распространения белого вещества. [3] [4] Шаблон также включает сегментацию позвоночника для автоматической оценки показателей в определенных местах. [5]
Атлас белого вещества в том числе 29 частичных масок , объем которых значение трактов. [6]
^ Де Линер Б., Леви С., Дюпон С.М., Фонов В.С., Стиков Н., Луи Коллинз Д. и др. SCT: Spinal Cord Toolbox, программное обеспечение с открытым исходным кодом для обработки данных МРТ спинного мозга. Нейроизображение. 2017; 145: 24–43. DOI: 10.1016 / j.neuroimage.2016.10.009
^ Де Линер Б., Коэн-Адад Дж., Кадури С. Автоматическая сегментация спинного мозга и спинномозгового канала в сочетании с маркировкой позвонков. Медицинская визуализация, IEEE Transactions on (в печати). DOI: 10.1109 / TMI.2015.2437192
^ Fonov V, Le Troter A, Taso M, De Leener B, Leveque G, Benhamou M, Sdika M, Benali H, Pradat PF, Collins DL, Callot V, Cohen-Adad J. Рамки для интегрированного среднего МРТ спинного мозга белое и серое вещество: шаблон МНИ-Поли-АМУ. Neuroimage 2014. DOI: 10.1016 / j.neuroimage.2014.08.057
^ Де Линер Б., Фонов В., Коллинз Д.Л., Калло В., Стиков Н., Коэн-Адад Дж. PAM50: Мультимодальный шаблон ствола мозга и спинного мозга, совместимый с пространством ICBM152. Материалы 25-го ежегодного собрания ISMRM, Гонолулу, США. 2017 г.
^ Cadotte DW, Cadotte А, Коген-Адад Дж, флот Д, Ливень М, Mikulis D, Fehlings МГ. Устранение анатомической изменчивости шейного отдела спинного мозга человека: решение для облегчения расширенной нейронной визуализации. Материалы 22-го ежегодного собрания ISMRM, Милан, Италия, 2014: 1719.
^ Леви С., Бенхаму М., Нааман С., Рейнвилл П., Калло В., Коэн-Адад Дж. Атлас белого вещества спинного мозга человека с оценкой эффекта частичного объема. Нейроизображение. 2015; 119: 262–271. DOI: 10.1016 / j.neuroimage.2015.06.040
