Пользователь: Эволюция и эволюционируемость

T HOMAS S HAFEE

Эволюция и эволюционируемость

А НО М Е

Я родом из Великобритании, где получил степень естественных наук и докторскую степень по биохимии , специализируясь на направленной эволюции и эволюционируемости . Сейчас я работаю в Австралии специалистом по данным и исследователем в области биоинформатики , пространства последовательностей , конвергентной эволюции и белковой инженерии, а также работал внештатным научным иллюстратором для нескольких научно-популярных книг. Я активно использую Википедию с 2013 года ^[1] и сейчас провожу семинары по редактированию Википедии для ученых, академиков, студентов и врачей . ^[2]^[3]^[4]^[5]^[6]^[7]^[8] Я также сосредотачиваюсь на содействии сотрудничеству между академическим сообществом и сообществом Википедии в целом. ^[9]^[10]^[11]^[12]^[13] Мой основной язык программирования - R , и я поддерживаю пакет WikidataR для чтения и записи викиданных.

M Y W ORK

В Википедии я в основном редактирую статьи по биохимии и эволюционной биологии. Поскольку диаграммы являются ключом к понятным научным статьям, я сосредотачиваюсь на добавлении и улучшении изображений (все мои изображения имеют лицензию CC-BY ). Я также создаю интерактивные диаграммы с вики-ссылками и, по возможности, стараюсь убедиться, что форматирование, которое я использую, совместимо с мобильными устройствами. Я также на редколлегии из WikiJournal медицины и WikiJournal науки , Wikipedia-интегрированные, рецензируемые, открытый доступ научных журналов ^[14]^[15]^[16] , и я организовать Wikipedia-интегрированный формат Тема Страницы для PLOS Genetics . ^[17] Я также редактирую научную и библиометрическую информацию о викиданных.

RTICLES I» VE W ORKED O N

F EATURED / G ООД RTICLES

Серпин ( GA → обзор → + )
Каталитическая триада ( ужасная заглушка → обзор → )
Ген ( Класс B → обзор → )
Фермент ( Исключено → обзор → )
Технологии транскриптомики ( Опубликовано → обзор → )

C REATED

2019
Богатый цистеином белок
Металл-связывающий белок
WikiProject Molecular Biology

2018
WikiJournal статья Выдвижение системы

2017
Транскриптомические технологии
Генная структура

2016
{{ Академическая рецензия }} Шаблон "
Женщины Антарктики" Wikibomb
Coverage (генетика)

Учебники по VisualEditor 2015
→ Редактирование
→ Ссылки
→ Изображения
→ Таблицы
{{ Preloaddraft }} система
LIMS

2014
Нейтральная сеть
Пространство последовательностей (эволюция)
Сайт сегрегации
Консервативная мутация

2013
PA clan
Protein суперсемейство

E XPANDED

2020
Открытый доступ из дефенсина класса C с самого начала
Дефенсин растений из заглушки Политика авторских прав академических издателей с самого начала

От
журнала к публикации в вики-версии 2015 г.

2015 Низкобарьерная водородная
связь из заглушки
Макромолекула из Start
WikiProject Редизайн молекулярной и клеточной биологии
Субстрат из заглушки
Продукт из заглушки

2014
Эпистаз от класса C
Надежность с самого начала
θ-Defensin от заглушки
Направленная эволюция с самого начала

2013
Протеазы из Start
Threonine протеазы из Stub
TEV протеазы из Stub
Ферменты с ограниченной диффузией из Stub

К ОНТАКТ М Е

Не стесняйтесь оставить сообщение на моей странице обсуждения или отправить мне электронное письмо

На других сайтах ORCID GoogleScholar LinkedIn Репозиторий AltMetric Scholia University

ГАЛЕРЕЯ

Дефенсин
Дефенсин
Редактирование для академиков
Связанные данные
Управление данными
Препринт
Открытый доступ
Открытый доступ
Открытый доступ
Открытый доступ
ДНК
Трехцепочечная ДНК
WP: W2J
WP: W2J
Противомикробный пептид
Фаговый дисплей
Азуроцидин 1
Stichodactyla токсин
Космическая станция
Гомология последовательностей
Гомология последовательностей
Гомология последовательностей
Гомология последовательностей
Wiki.J.Sci.
Wiki.J.Sci.
Технологии транскриптомики
Технологии транскриптомики
Технологии транскриптомики
Технологии транскриптомики
Технологии транскриптомики
VS рибозим
VS рибозим
РНК Str. | Структура нуклеиновой кислоты | РНК Str.
Prot. | Белковая структура | Prot. Ул.
Вторичная структура белка
Металлотионеин
СКАР Викибомба
СКАР Викибомба
СКАР Викибомба
Указатель
Wiki.J.Sci.
Wiki.J.Hum.
Wiki.J.Med.
Редактирование для академиков
Циклотид
Легумаин
Легумаин
Ген
Цитохром b5
SCD-1
Фермент
{{AI4}}
Аспарагиновая протеаза
Глутаминовая протеаза
Серпин
Серпин
Серпин
Серпин
LBHB
Каталитическая триада
Ген
Ген
Ген
Ген
Ген
Ген
Гликолиз
Фермент
Фермент
Фермент
Фермент
Фермент
Фермент
Фермент
Фермент
Фермент
Пегилирование
Направленная эволюция
Направленная эволюция
Направленная эволюция
Направленная эволюция
Выравнивание последовательности
Белки-переносчики липидов растений
Белки-переносчики липидов растений
Y РНК
Тионин
Тета-дефенсин
Тета-дефенсин
Тета-дефенсин
Надежность
Нейтральная сеть
Пространство последовательности
Эпистаз
Эпистаз
Эпистаз
Протеаза TEV
Протеаза
Кинетическое совершенство
Каталитическая триада
Каталитическая триада
Каталитическая триада
Каталитическая триада
Каталитическая триада
Клан ПА
Надсемейство
Каталитическая триада
Каталитическая триада
Пимол
Клан ПА
BLIP
BLIP
Протеаза TEV
FRET
Протеаза TEV
Протеаза TEV
Белковое суперсемейство

Оригинальный Barnstar

Спасибо за отличную статью о клане PA и за многие другие статьи о семьях Protein и RNA! Alexbateman ( разговор ) 11:15, 15 января 2014 (UTC)

Barnstar графического дизайнера

Награжден Evolution и возможностью эволюции за вклад и возможность эволюции многих выдающихся изображений для Википедии, включая этот высоко информативный и уникальный обзор генной структуры. Адриан Дж. Хантер ^{( обсуждение • вклад )} 04:24, 10 июня 2015 (UTC)

Наука Барнстар

Я знаю, какой головной болью может быть повышение статьи до FA . Это большое достижение, поздравляю! Сеппи 333 ( InSert 2 ¢ ) 01:15, 13 марта 2016 (UTC)

Особый,
оригинальный,
неутомимый
автор и усердие Barnstars

Спасибо за всю вашу неустанную работу над викибомбой для женщин Антарктики . Думаю, без вашей помощи мы бы обошлись примерно с 10 страницами. Большое спасибо за то, что помогли нам в этом процессе. Вы легенда. Янстругнелл ( разговор ) 07:06, 28 августа 2016 (UTC)

Т , ты наш герой! Спасибо за успех викибомб для женщин Антарктики! Нгвильсон ( разговорное ) 08:03, 28 августа 2016 (UTC)

T - несмотря на всю работу, которую вы проделали для создания Wiki Bomb - несмотря на то, что это выходит за рамки вашей области научных интересов - вы терпите все глупые вопросы ... вы добились хороших результатов! WavygeEk ( разговор ) 15:40, 28 августа 2016 (UTC)

Большое вам спасибо за то, что помогли вдохновить тысячи подающих надежды молодых женщин-ученых со всего мира - и за то, что научили нас больше о Википедии, чем мы когда-либо думали, что узнаем! Баэземан ( разговорное ) 08:29, 6 сентября 2016 (UTC)

T - Ваш вклад в демонстрацию роли женщин-ученых в исследованиях Антарктики был выдающимся. Большое вам спасибо за ваши усилия !! Шавджустин ( разговорное ) 06:47, 7 сентября 2016 (UTC)

Технический Barnstar

Благодарим за улучшения в шаблоне " опубликованный индексированный ". Док Джеймс ( обсуждение · вклад · электронная почта ) 11:08, 6 сентября 2016 г. (UTC)

Медицина Барнстар

Спасибо за огромную работу, которую вы делаете и будете продолжать делать для медицинского контента в Википедии, а также в Вики Журнале медицины . D ip ta ns hu talk 08:17, 1 ноября 2016 г. (UTC)

Оригинальный Barnstar

Большое спасибо за то, что заставили всех нас редактировать Shut Up и wiki fridays ! Лозтрон ( разговорное ) 03:15, 1 июня 2018 (UTC)

Психология Barnstar

За ваше приглашение в Американскую психологическую ассоциацию и за приветствие одного из этих дурацких психологов на предприятии WikiJournals! - Mark D Worthen PsyD (разговор) (Я мужчина. Традиционные мужские местоимения в порядке.) 23:44, 12 августа 2019 г. (UTC)

Наука стала видимой

Спасибо за качественные статьи, такие как серпины , за ваш научный опыт в области эволюции и эволюционируемости («экспериментальная эволюция белка »), за то, что сделали их доступными с помощью увлекательных иллюстраций, за большую доступность с помощью значимых перенаправлений, за ясную и информативную страницу пользователя, - T , вы классный википедианец ! - Герда Арендт ( разговорное ) 05:52, 2 апреля 2016 г. (UTC)

Статьи указателей

1) Беседа о WikiProject молекулярного и клеточной биологии на 20 мая 2015
2) Статья о SCAR антарктической женщин Wikibomb на 18 Aug 2016
3) Статья о биомедицинском содержании и сотрудничестве на 6 сентября 2017 года
4) Статьи о WikiJournals 30 июня 2019

3RRR radio Интервью

1) Беседа о Направленной эволюции и Википедия редактирования в целом по 3RRR радио «s Эйнштейн A Go-Go шоу на 18 октября 2015
2) Беседа о SCAR Антарктических Женщин Wikibomb по 3RRR радио » s Parallel Lines показать на 31 августе 2016

Сообщение в блоге Фонда Викимедиа

Статья о стимулировании ученых и медицинских работников , чтобы внести свой вклад в Википедию в WMF блоге на 18 Авг 2016

Премия Cure

Спасибо за всю огромную работу по продвижению Википедии и медицины. Лучший Док Джеймс ( обсуждение · вклад · электронная почта ) 07:32, 1 ноября 2016 г. (UTC)

ЛИЦЕНЗИЯ

Весь текст и изображения, которые я добавляю в любую вики, выпущены под лицензией Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) - единственным требованием для распространения / повторного использования / адаптации является указание авторства. Если одно из моих изображений неправильно помечено или если вы не уверены, не стесняйтесь написать мне, чтобы подтвердить.

СДЕЛАТЬ

Эволюционный ландшафт / фитнес-ландшафт - изображение
Эволюционируемость - изображение?
Нейтральная мутация - причины и типы
Экспериментальная эволюция Экспериментальная эволюция
бактериофагов - в настоящее время сумасшедший беспорядок
Разнородность ферментов
Мутации - расширяют «полезные мутации» и убирают «DFE»
Дефенсин - требует капитального ремонта
Циклический пептид - расширяет и отделяет раздел циклических белков
Активный сайт- новые изображения
Сайт
привязки - новые изображения Oxyanion hole - изображение, химия, примеры
Направленный выбор - улучшение изображения
Геномная инженерия - объединить с редактированием генома ?
Структура белка - эволюция / сохранение
Помощь: введение к страницам - Новое приветствие, MOS, навигация?
Стабильность белка- создать или вставить в существующую статью?
Шпинин - создать

РЕКОМЕНДАЦИИ

↑ Шафи , Т. (2015). «Моя вторая жизнь википедиста» . latrobe.edu.au . RED Alert, Университет Ла Троб . Проверено 22 августа 2016 .
↑ Шафи , Т. (2018). «Википедия как информационная платформа» . Институт молекулярных наук Ла Троба .
↑ Шафи , Т. (2016). «Редактирование Википедии для ученых» . Lorne Proteins .
↑ Шафи , Т. (2016). «Редактирование Википедии для ученых» . Общество молекулярной биологии и эволюции .
↑ Шафи , Т. (2016). "Женщины в антарктических исследованиях викибомб" . Научный комитет по антарктическим исследованиям . ( итоговая страница )
↑ Шафи , Т. (18.08.2016). «Привлечение различных сообществ к профилированию женщин Антарктиды» . Указатель .
↑ Сэвидж, S; Стругнелл, Дж; Шафи , Т. (31 августа 2016 г.). «Параллельные линии» (Аудиоинтервью) . Радио 3РРР .
↑ Shafee , Т . «Медицинская грамотность» (на англ. Яз.). Глобальная программа санитарного просвещения Torque. Архивировано из оригинала на 2017-04-18.
↑ Стругнелл, Дж; Шафи , Т ; Wilson, N; Дауни, Р. Стивенс, К; Шоу, Дж; Баесман, Дж. "Профили: Престижность для женщин-исследователей Антарктики" . Nature 536 (7615): 148–148. DOI : 10.1038 / 536148b .
↑ Масукуме, G; Кипершток, L; Дас, Д; Шафи , Т ; Лоран, М; Хейлман, Дж (ноябрь 2016 г.). «Медицинские журналы и WP: проблема глобального здравоохранения» . The Lancet Global Health 4 (11): e791. DOI : 10.1016 / S2214-109X (16) 30254-6 .
↑ Shafee , Т . «Википедия уже стала всемирным« доктором Google »- пора врачам и исследователям сделать ее лучше» . Разговор . Проверено 18 октября 2016 .
↑ Шафи , Т ; Mietchen, D; Вс, А (август 2017). «Ученые могут помочь в формировании Википедии» . Science 357 (6351): 557–558. DOI : 10.1126 / science.aao0462 .
↑ Шафи , Т ; Masukume, G; Кипершток, L; Дас, Д; Häggström, M; Хейлман, Дж (август 2017 г.). «Эволюция медицинского содержания Википедии: прошлое, настоящее и будущее» . JECH . PMID 28847845 . DOI : 10.1136 / Jech-2016-208601 .
↑ Шафи , Т ; Дас, Д; Masukume, G; Häggström, M. «WikiJournal of Medicine, первый академический журнал, интегрированный с Википедией» . WikiJournal of Medicine 4 . DOI : 10.15347 / wjm / 2017.001 .
↑ Шафи , Т. (2018-06-01). «Цели и масштабы WikiJournal of Science» . WikiJournal of Science 1 (1): 1. doi : 10.15347 / wjs / 2018.001 .
↑ Шафи, Томас (2017). «Публикация, интегрированная с Википедией: сравнение успешных моделей» . Информационная служба здравоохранения 26 (2). DOI : 10,13140 / RG.2.2.27470.77129 .
↑ Энн Лук (12.04.2017). «Продолжая преодолевать разрыв между журналом и Википедией: введение тематических страниц для PLOS Genetics» . PLOS Biologue (на английском языке) . Проверено 31 мая 2017 .

Авторитетный контроль	DBLP : 188/8489 GND : 1119881161 ISNI : 0000 0004 2034 1400 LCCN : no2013111599 ORCID : 0000-0002-2298-7593 PLWABN : 9811323118005606 ResearcherID : L-6897-2016 S2AuthorId : 5350117 VIAF : 305368560 WorldCat Identities : lccn-no2013111599

[1] Шафи , Т. (2015). «Моя вторая жизнь википедиста» . latrobe.edu.au . RED Alert, Университет Ла Троб . Проверено 22 августа 2016 .

[2] Шафи , Т. (2018). «Википедия как информационная платформа» . Институт молекулярных наук Ла Троба .

[3] Шафи , Т. (2016). «Редактирование Википедии для ученых» . Lorne Proteins .

[4] Шафи , Т. (2016). «Редактирование Википедии для ученых» . Общество молекулярной биологии и эволюции .

[5] Шафи , Т. (2016). "Женщины в антарктических исследованиях викибомб" . Научный комитет по антарктическим исследованиям . ( итоговая страница )

[6] Шафи , Т. (18.08.2016). «Привлечение различных сообществ к профилированию женщин Антарктиды» . Указатель .

[7] Сэвидж, S; Стругнелл, Дж; Шафи , Т. (31 августа 2016 г.). «Параллельные линии» (Аудиоинтервью) . Радио 3РРР .

[8] Shafee , Т . «Медицинская грамотность» (на англ. Яз.). Глобальная программа санитарного просвещения Torque. Архивировано из оригинала на 2017-04-18.

[9] Стругнелл, Дж; Шафи , Т ; Wilson, N; Дауни, Р. Стивенс, К; Шоу, Дж; Баесман, Дж. "Профили: Престижность для женщин-исследователей Антарктики" . Nature 536 (7615): 148–148. DOI : 10.1038 / 536148b .

[10] Масукуме, G; Кипершток, L; Дас, Д; Шафи , Т ; Лоран, М; Хейлман, Дж (ноябрь 2016 г.). «Медицинские журналы и WP: проблема глобального здравоохранения» . The Lancet Global Health 4 (11): e791. DOI : 10.1016 / S2214-109X (16) 30254-6 .

[11] Shafee , Т . «Википедия уже стала всемирным« доктором Google »- пора врачам и исследователям сделать ее лучше» . Разговор . Проверено 18 октября 2016 .

[12] Шафи , Т ; Mietchen, D; Вс, А (август 2017). «Ученые могут помочь в формировании Википедии» . Science 357 (6351): 557–558. DOI : 10.1126 / science.aao0462 .

[13] Шафи , Т ; Masukume, G; Кипершток, L; Дас, Д; Häggström, M; Хейлман, Дж (август 2017 г.). «Эволюция медицинского содержания Википедии: прошлое, настоящее и будущее» . JECH . PMID 28847845 . DOI : 10.1136 / Jech-2016-208601 .

[14] Шафи , Т ; Дас, Д; Masukume, G; Häggström, M. «WikiJournal of Medicine, первый академический журнал, интегрированный с Википедией» . WikiJournal of Medicine 4 . DOI : 10.15347 / wjm / 2017.001 .

[15] Шафи , Т. (2018-06-01). «Цели и масштабы WikiJournal of Science» . WikiJournal of Science 1 (1): 1. doi : 10.15347 / wjs / 2018.001 .

[16] Шафи, Томас (2017). «Публикация, интегрированная с Википедией: сравнение успешных моделей» . Информационная служба здравоохранения 26 (2). DOI : 10,13140 / RG.2.2.27470.77129 .

[17] Энн Лук (12.04.2017). «Продолжая преодолевать разрыв между журналом и Википедией: введение тематических страниц для PLOS Genetics» . PLOS Biologue (на английском языке) . Проверено 31 мая 2017 .

[1]