Расположена на севере Эстонии, в 14 км к востоку от Таллина и в 3 км к северу от волостного центра — города Кехра. На северо-западе граничит с деревней Аавере, на северо-востоке — с деревней Партсааре, на юго-востоке — с деревней Куусемяэ, на юго-западе — с деревней Кихмла. Ближайший крупный к деревне город — Маарду — расположен в 19 км к северо-западу от Ании. Ания расположена на высоте 51 метр над уровнем моря, а местность вокруг деревни довольно ровная[4].
Ания расположена недалеко от рек Ягала и Аавоя и побережья Балтийского моря[5]. В окрестностях вокруг Ании растёт в основном смешанный лес[6]. Через деревню протекает небольшой ручей.
По данным переписи населения 2021 года, в деревне насчитывалось 92 жителя, из них 85 (92,4 %) — эстонцы[7].
Населённый пункт первые упоминается в 1241 году в датской поземельной книге под названием Hangægus. В 1355 году деревня упоминается как Hæniyekke, в 1482 году — Hanneyecke, в 1537 году — Hannyyocky, в 1692 году — Hannejoggi, в 1782 году — Annijöe, в 1848 году — Anija[11][12].
В 1849 году в деревне была открыта школа. В июле 1858 года крестьяне у владельцев мызы Анния снижения объёмов барщины. Не добившись этого, они отправились за справедливостью в Ревель (Таллин), где были избиты[12]. Эдуард Вильде в 1903 году написал по мотивам этих событий роман «Когда крестьяне из Ания посетили Таллин» (эст. Kui Anija mehed Tallinnas käisid)[12].
В 1920 году, после земельной реформы, Ания стала поселением, официальный статус деревни имеет с 1977 года[11].