Деревня находится в бассейне реки Реут, в 48 километрах к юго-западу от Курска, в 12 километрах к юго-западу от районного центра — города Курчатов, в 4 км от центра сельсовета – Чапли.[3].
Благодатное, как и весь район, расположено в поясе умеренно континентального климата с тёплым летом и относительно тёплой зимой[4] (Dfb в классификации Кёппена).
Благодатное находится в 6 км от автодороги регионального значения 38К-017 (Курск – Льгов – Рыльск – граница с Украиной), на автодороге межмуниципального значения 38Н-376 (38Н-017 – Чапли – Благодатное)[6], в 6 км от ближайшей ж/д станции Блохино[7] (линия Льгов I — Курск).