Общая протяжённость границ — 1 273 км, из них с Белоруссией на юге и юго-востоке — 502 км, Латвией на севере — 453 км, Польшей на юге — 91 км, Россией (Калининградской областью) на западе — 227 км.
Самая высокая точка — холм Аукштояс (Aukštojo kalnas) в юго-восточной части страны, в 23,5 км от Вильнюса (293,84 м над уровнем моря).
Крупнейшие реки — Неман (Нямунас, лит. Nemunas) и Нерис (лит. Neris). Более 3 тысяч озёр (1,5 % территории): крупнейшее озеро — Друкшяй (лит. Drūkšiai, белор. Дрысвяты) на границе Латвии, Литвы и Белоруссии (площадь 44,5 км²), самое глубокое — Таурагнас (лит. Tauragnas, 61 м), самое длинное — Асвея (лит. Asveja, длина 30 км) у местечка Дубингяй.
Климат Литвы умеренно мягкий и изменяется в меру продвижения в глубину страны — от морского на побережье, до континентального в самых восточных районах. Средняя температура на побережье −1,6 °C в январе и +17,8 °C в июле. В Вильнюсе средняя температура составляет −2,1 °C в январе и +18,1 °C в июле. Годовое количество осадков составляет в среднем на побережье 717 мм и 490 мм в восточных частях страны. Вегетационный период длится 202 дня в западных частях и 169 дней в восточных частях страны.