3 января 2011 Nickelodeon упорядочили 26 эпизодов для девятого сезона, что подтверждается началом трансляции 21 июля 2012 года. 9 сезон состоит из эпизодов 179—204. Губка Боб Квадратные Штаны стал первым мультсериалом канала Nickelodeon, который достиг 200-го эпизода. Кроме того, в этом сезоне мультсериал перешёл в формат 1080p. Показ сезона должен был завершиться летом 2016 года, но в июле вышло лишь несколько эпизодов, оставшиеся показали в октябре-ноябре и один вышел в декабре того же года. Показ специального 200-го эпизода был перенесён на 20 февраля 2017 года, когда и состоялся финал сезона. В России 9 сезон транслировался на канале Nickelodeon со 2 ноября 2013 по 12 марта 2017 года и на канале Карусель с 20 мая по 2 июля 2019 года. Это самый продолжительный сезон за всю истории мультсериала.
Раскадровка делалась на студии «Nickelodeon Animation Studio» (Бербанк, штат Калифорния), а анимация — за границей, в студии «Rough Draft Studios» в Южной Корее[1][2]. Над анимацией сезона работали: Алан Смарт и Том Ясуми.
Раскадровку девятого сезона делали: Зеус Цервас, Кейси Александр, Люк Брукшир, Марк Чеккарелли, Блэйк Лемонс Боб Кэмп, Фред Осмонд, Линн Нейлор, Джо Виренга, Джон Трэббик, Хоуи Перри, Шелли О'Бриен, Чонг Ли, Эд Бейкер, Крис Аллисон, Райан Крамер и Брайан Моранте.
Главными сценаристами девятого сезона были Дерек Иверсен и Джек Пендарвис. Над сценариями также работали Блейк Лемонс, Джош Андроски, мистер Лоуренс, Дэниэл Домингуэз и Клэр О'Кейн, в частности: Эндрю Гудман, Зеус Цервас, Кейси Александр, Люк Брукшир и Марк Чеккарелли, а также новые сценаристы Кайл Маккалох и Каз Прапуоленис.