Дьяконово расположено на берегу реки Воробжа, левого притока реки Сейм. Через село проходят автомобильные дороги регионального значения 38К-004 (Дьяконово — Суджа — граница с Украиной) и 38К-017 (Курск — Льгов — Рыльск — граница с Украиной). Находится в 2 километрах от райцентра Прямицыно и в 23 километрах от областного центра Курска.
В селе улицы: Городская, Заводская, Заречная, Комсомольская, Красной Звезды, Ломакина, Луговая, Магистральная, Мирная, Молодёжная, Парковая, Первомайская, переулок Победы, Победы, Полевая, Садовая, Симоненко, Советская, Центральная и Школьная[3].
Дьяконово, как и весь район, расположено в поясе умеренно континентального климата с тёплым летом и относительно тёплой зимой[4] (Dfb в классификации Кёппена).
Село Дьяконово, как и вся Курская область, находится в часовой зоне МСК (московское время). Смещение применяемого времени относительно UTC составляет +3:00[5].
В соответствии с законом Курской области «О муниципальных образованиях Курской области» от 15.08.1996 г. № 6 было создано муниципальное образование «Дьяконовский сельсовет» Октябрьского района Курской области с центром в селе Дьяконово. Статус и границы сельсовета установлены Законом Курской области от 21 октября 2004 года № 48-ЗКО «О муниципальных образованиях Курской области»[6].