Заха́рий Петро́вич Ляпуно́в (? — после 1610) — русский политический деятель, голова и воевода во времена правления Фёдора Ивановича, Бориса Годунова, Василия IV Ивановича Шуйского и Смутное время.
Из дворянского рода Ляпуновы. Четвёртый, из пяти сыновей Петра Саввича Ляпунова. Имел братьев видных деятелей Смутного времени: Александра, Григория, Прокопия и Степана Петровичей.
В 1595 году не захотел быть в станичных головах под начальством Ф.И. Кикина и сбежал со службы из Ельца в своё рязанское поместье (скорее всего по местническим соображениям). Рязанский воевода распорядился привезти его оттуда скованного в Переяславль-Рязанский, бить батогами перед всеми людьми, посадить в тюрьму и потом, под присмотром пристава, отправить на службу. При этом он возместил расходы на гонцов с грамотами от Москвы до Ельца и обратно.
В Боярском списке 1602/03 годов указан среди выборных дворян по Рязани с высоким поместным окладом в 500 четвертей земли (около 800 га).
В 1603 году царь Борис Годунов провёл следствие среди детей боярских рязанцев: кто посылал в 1602/03 годах на Дон всякие «заповедные товары», то есть вино, порох, серу, селитру, свинец и разные предметы вооружения? Выяснилось, что Захарий Ляпунов посылал из Царёва-Борисова вино казакам на Дон и продавал панцирь и железную шапку (шлем). За это его публично высекли кнутом.
В 1605 году в составе рязанской служилой корпорации участвовал в боевых действиях против Лжедмитрия I, но в начале мая, как и другие рязанские дворяне, целовал крест самозванцу, отказавшись присягнуть Фёдору Борисовичу Годунову. Из-за недостаточности знатности он не вошёл в ближайшее окружение самозванца после его воцарения.