Родилась в Москве. Происходила из польского дворянского рода. Дед Модржинской был осуждён за участие в восстании 1863 г. и лишён дворянского звания.
В 1925 году окончила среднюю школу и курсы английского языка. В 1930 году — международное отделение факультета советского права 1-го МГУ.
Лейтенант, позднее — подполковник, возглавляла отдел референтуры у Берии[2]. В декабре 1940 — июне 1941 резидент в Варшаве — «Марья»[3], начальник аналитического подразделения 3-го отдела Управления политической разведки НКВД.
После реформы 1941 года из НКВД СССР был выделен новый наркомат НКГБ СССР и внешней разведкой стало заниматься 1-е Управление НКГБ СССР во главе с П. М. Фитиным. Он и поручил Е. Д. Модржинской «английский участок» работы. Будучи аналитиком разведки Е. Д. Модржинская полагала что «кембриджская пятерка» является группой агентов-«двойников», о чём писала донесения.[4]
После войны стала философом[прояснить]. Была заведующей сектором критики антикоммунизма Института философии АН СССР, доктор философских наук, профессор, эксперт ВАК. На должности зав. сектором Е.Д. Модржинскую, как бывшую сотрудницу «органов», в первую очередь интересовала идеологическая стойкость философских кадров[2], и, как отмечал Л.Н. Митрохин,