Ни́ло-Со́рская пу́стынь — мужской монастырь Вологодской епархии Русской православной церкви, расположенный в местечке Пустынь Кирилловского района Вологодской области.
В конце XV века Нил, инок Кирилло-Белозерского монастыря, которого не вполне удовлетворяла существовавшая организация монастырской жизни, когда монахи живут «не по Закону Божию и преданию Святых Отцов, а по своей воле и человеческому рассуждению», со своим сподвижником Иннокентием Охлябининым покинул Кириллов монастырь и отправился паломником на Восток — в Константинополь и на Афон. Возвратившись через несколько лет, Нил Сорский поселился в келье вблизи Кирилло-Белозерского монастыря, но, прожив здесь какое-то время, в поисках ещё большего уединения и для воплощения своих монашеских идеалов ушёл на реку Сору, в места лесные, болотистые, дикие и пустынные. Он писал об этом так: «Ныне вдалее от монастыря переселихся понеже благодатию Божиею обретох место, угодное моему разуму, занеже мирской чади маловходно»[1]. В обители был принят скитский устав, поэтому эта пустынь сначала называлась скитом[2].
В 1764 году пустынь была приписана к Кирилло-Белозерскому монастырю. Её самостоятельность была восстановлена только в середине XIX века[2].
В 1918 году специальная комиссия произвела учёт имущества и ценностей Нило-Сорской пустыни, которые теперь стали «народным достоянием». В апреле 1919 года братия пустыни и жители окрестных деревень заключили договор с Вогнемским советом, а в сентябре того же года Кирилловский исполком, рассмотрев устав Нило-Сорской общины, зарегистрировал её. Это позволило сохранить ядро монашеской организации и структуру её управления, но такое положение продолжалось недолго. В 1924 году договор с Нило-Сорской общиной был расторгнут и на территории монастыря разместили колонию Кирилловского уездного исправительного дома. Возникшая угроза хищения церковных ценностей заставила местные власти хлопотать об их «изъятии для сохранения». В 1927 году Череповецкий губисполком принял решение о закрытии Нило-Сорской пустыни и передаче её сооружений для «культурных нужд» населению. Монахи еще какое-то время жили в Иоанно-Предтеченском скиту, но постепенно одни умерли, а другие разошлись.
Колонию-тюрьму, просуществовавшую до 1930 года, сменил инвалидный дом. В 1961 году на территории монастыря разместился психоневрологический диспансер. Сохранилась часть монастырских построек: перестроенный Тихвинский собор, надвратная Покровская церковь, игуменский корпус и келейные корпуса, встроенные в стены монастыря.