Реки Таджикистана — в силу горной местности, в основном, скоротечные порожистые и не судоходные. Исключением являются реки Сырдарья и Вахш, где сооружены Фархадское, Кайраккумское и водохранилище Головной ГЭС и искусственные «моря», обеспечивающие нормальный режим работы турбин, а также способствующие орошению, водоснабжению и развитию судоходства[1].
Природа наделила республику обильными ледниковыми источниками питания и обусловила развитие речной сети. В целом протяжённость рек, имеющих длину более 10 километров, превышает 28 500 км[2].
Всего на территории Таджикистана находятся около 600[2] рек и временных водотоков (по другим источникам около 1000[3]), которые входят в крупнейшие в Средней Азии Амударьинский и Сырдарьинский бассейны. Самые крупные из них — Амударья, Сырдарья, Вахш, Пяндж и Зеравшан берут начало в горах Таджикистана.
В верховьях течение бурное, спускаясь на равнины, становится средним. Потенциальная мощность всех рек составляет более 32 млн кВт/ч[2].
Речная сеть республики делится на три системы Алайско-Туркестанской горной цепью и Гиссарским хребтом: на севере — Сырдарьинская, в центре — Зеравшанская и Амударьинская — на юге. На Восточном Памире имеются бессточные котловины с озерами Шоркуль и Каракуль, а также рекой Маркансу, уходящей в Китай и являющейся притоком реки Кызылсу[2].
Часть площади страны (9,2 %) располагается севернее Туркестанского хребта в бассейне Сырдарьи, а территория, находящаяся к югу от хребта — в бассейне Амударьи. Вдоль южной границы Таджикистана протекает река Пяндж, являющаяся верховьем Амударьи. Начало берет из памирского озера Зоркуль и до впадения с афганской стороны левого притока Вахандарьи именуется Памир. С востока на запад с правой стороны в реку Пяндж впадают реки Гунт с притоком Шахдара, Бартанг с притоком Гудара, Язгулем, Ванч, Кызылсу с притоком Яхсу, Вахш с притоком Обихингоу[2].