Расположен на реке Прут в 107 км от Кишинёва, 85 км от Бельц и в 45 км от Ясс. В Унгенах находится таможня на границе с Румынией. Железнодорожная станция Унген является пограничной между железными дорогами Молдовы и Румынии.
Город расположен в западной и центральной части Республики Молдова, на левом берегу реки Прут и в непосредственной близости от границы с Румынией. Общая площадь города Унгены составляет 16,4 км², эта относительно небольшая площадь обусловлена тем, что в городе нет сельскохозяйственных угодий.
Недалеко от города Унгены, на площади 373 га находится охраняемая территория «Valea Mare» с ценной растительностью с луга Прут. Эта территория была объявлена памятником природы Бессарабии в межвоенный период Постановлением Совета Министров Румынии от 19 июля 1937 года .
Первое упоминание села Унгены встречается в указе Cтефана III Великого, датированном 20 августа 1462 года.
Унгены становятся городом и районным центром в 1940 году. После 1945 года в городе начинается значительный прирост населения, развивается лёгкая, пищевая (мясная, консервная, винодельческая) промышленность, производство художественной керамики, ковров и др.; строится биохимический завод.
29 июня 1972 года город Унгены отнесён к категории городов республиканского подчинения Молдавской ССР. В 1991 году статус был утрачен.