Эсто́нская апо́стольская правосла́вная це́рковь (эст. Eesti Apostlik-Õigeusu Kirik, сокращённо ЭАПЦ) — автономная православная церковь в юрисдикции Константинопольского патриархата.
С 1996 года сосуществует параллельно с самоуправляемой Эстонской православной церковью Московского патриархата. Последний оспаривает каноническую законность действий Константинопольского патриархата на территории Эстонии.
Предстоятель ЭАПЦ — митрополит Таллинский и всей Эстонии Стефан (Хараламбидис) (с 13 марта 1999 года).
Возникла на основании Томоса Константинопольского патриарха Мелетия IV от 7 июля 1923 года, принявшего Эстонскую православную церковь в свою юрисдикцию на правах автономии как Эстонскую православную митрополию — в ответ на обращение Собора Эстонской церкви от 23 сентября 1922 года о предоставлении автокефалии. Епископу Александру (Паулусу), возглавлявшему приходы в Эстонии, был пожалован титул митрополита Таллинского и всей Эстонии. В сентябре 1924 года была разделена на две епархии — Таллинскую и Нарвскую. В 1933 году епископ Нарвский Иоанн (Булин) был отстранён от управления епархией и отбыл в Белград. В том же году во епископа Печерского, викария Эстонской епархии, был хиротонисан Николай (Лейсман); в 1937 году был хиротонисан новый епископ Нарвский — Павел (Дмитровский). В 1935 году Церковь приняла нынешнее наименование Эстонской апостольской православной церкви (ЭАПЦ). К 1940 году, времени присоединения Эстонии к СССР к ЭАПЦ относилось 210 000 верующих, 80 процентов которых были эстонцами, 3 епископа, 156 приходов, 131 священник, 2 монастыря и одна духовная семинария. Православные составляли 17,5 % христиан страны.
После присоединения Эстонии к СССР были закрыты теологический факультет Тартуского университета (на основе Декрета об отделении церкви от государства и школы от церкви) и духовная семинария в Печорах. 23 сентября 1940 года Синод Эстонской церкви обратился к Московскому патриархату с просьбой принять под свой омофор, но с сохранением автономии. Инициатива возвращения в Русскую православную церковь исходила от главы ЭАПЦ, митрополита Александра (Паулуса). В ответном письме ему было сказано, что это возможно только через покаяние в переходе в Константинопольский патриархат в 1923 году, а оснований для сохранения автономии после утраты Эстонией независимости нет[1]. Синод ЭАПЦ подтвердил желание восстановить подчинение РПЦ, что и состоялось 30 марта 1941 года: митрополит Александр был принят в каноническое общение с Московской патриархией, а православные приходы Эстонии (Таллинская и Нарвская епархии) вошли в экзархат Латвии и Эстонии, который возглавил митрополит Виленский и Литовский Сергий (Воскресенский).