Сегунда 1999/2000 (исп. Segunda División de España 1999/2000) — 69-й сезон Второго дивизиона Испании по футболу с момента его создания. Сезон стартовал 21 августа 1999 года и закончился 4 июня 2000 года. В чемпионате приняли участие 22 команды.
В лиге 22 команды, 14 из которых и в сезоне 1998-99 играли во второй лиге Испании, 4 из которых вылетели из Ла Лиги 1998-99 сезона, и четыре из которых вошли в дивизион Б.
Команды, которые вылетели в прошлом сезоне: — Мальорка B , Барселона II, Эркулес и Оренсе. В место них вышли — Эльче, Хетафе, Леванте и Кордоба.
И — игры, В — выигрыши, Н — ничьи, П — проигрыши, Мячи — забитые и пропущенные голы, ± — разница голов, О — очки