Фердина́нд Мю́ллер (нем. Ferdinand von Mueller, Ferdinand Jacob Heinrich Mueller, 1825—1896) — немецкий естествоиспытатель, биолог, ботаник, географ XIX века, изучавший природу Австралии.
Путешествовал в 1848 году по южной Австралии, был правительственным ботаником Виктории до 1855 года, сопровождал Августа Грегори в его топографических экспедициях.
Потом Фердинанд Мюллер занял должность директора Королевского ботанического сада в Мельбурне[англ.] и в немногие годы сделал это учреждение одним из знаменитейших в своём роде.
Ф. Мюллер сам определил около двух тысяч растений и приобрёл большую известность в связи с работами по акклиматизации культурных растений.
Он был инициатором массовых насаждений эвкалиптов в средиземноморской области и во всем субтропическом поясе, считая, что это способствует улучшению климата.