Члены семейства аланин или глицин: катионный симпортер (AGCS) ( TC # 2.A.25 ) транспортируют аланин и / или глицин в симпорте с Na + и / или H + .
Аланин / глицин: белок семейства симпортеров катионов (AGCS) | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | A3P053 | |||||||
Pfam | PF01235 | |||||||
ИнтерПро | IPR001463 | |||||||
PROSITE | PS00873 | |||||||
|
Структура и функции
Известные белки семейства AGCS имеют длину от 445 до 550 аминоацильных остатков и обладают от 8 до 12 предполагаемых трансмембранных α-спиральных гаечных ключей. Члены могут обладать 11 трансмембранными сегментами (TMS), что, по-видимому, верно для DagA ( TC # 2.A.25.1.1 ) и AgcS ( TC # 2.A.25.1.3 ), хотя Acp ( TC # 2.A .25.1.2 ) имеет только 8 TMS, возможно, результат усечения. По состоянию на начало 2016 года, похоже, нет никаких данных о трехмерной кристаллической структуре этих белков. Члены семейства AGCS были обнаружены у бактерий и архей, таких как экстремофильные галотолерантные цианобактерии Aphanothece halophytica и термофильные бактерии Bacillus PS3 . [1] [2] По состоянию на 2015 год только три члена семьи были функционально охарактеризованы. Эти белки демонстрируют ограниченное сходство последовательностей в семействе APC ( TC # 2.A.3 ). [3] Структуры AgcS с высоким разрешением из Methanococcus maripaludis были получены с помощью рентгеновской кристаллографии и выпущены в 2019 году и демонстрируют структурную гомологию с другими членами суперсемейства переносчиков аминокислот, полиаминов и органических соединений. [4]
Транспортная реакция
Обобщенная транспортная реакция, катализируемая семейством AGCS: [3]
аланин или глицин (выход) + Na + или H + (выход) → аланин или глицин (вход) + Na + или H + (вход).
Белки семейства AGCS
В настоящее время существует 10 белков, принадлежащих к семейству AGCS. Эти белки и их описания можно найти в базе данных классификации транспортеров .
Рекомендации
- ^ Bualuang А, Кагеяма Н, Танака У, Incharoensakdi А, Takabe Т (2015). «Функциональная характеристика члена семейства аланин или глицин: симпортер катионов в галотолерантной цианобактерии Aphanothece halophytica». Биология, биотехнология и биохимия . 79 (2): 230–5. DOI : 10.1080 / 09168451.2014.968091 . PMID 25421789 . S2CID 205616830 .
- ^ Канамори М., Камата Х., Ягисава Х., Хирата Х. (март 1999 г.). «Сверхэкспрессия гена белка-носителя аланина из термофильной бактерии PS3 в Escherichia coli». Журнал биохимии . 125 (3): 454–9. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022308 . PMID 10050032 .
- ^ а б Saier MH. «2.A.25 Семейство аланин или глицин: симпортер катионов (AGCS)» . База данных классификации транспортеров . Saier Lab Bioinformatics Group / SDSC.
- ^ Ма Дж., Лей Х. Т., Рейес Ф. Э., Санчес-Мартинес С., Сархан М. Ф., Хаттне Дж., Гонен Т. (февраль 2019 г.). «Структурная основа связывания субстрата и специфичности натрий-аланинового симпортера AgcS» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 116 (6): 2086–2090. DOI : 10.1073 / pnas.1806206116 . PMC 6369739 . PMID 30659158 .
дальнейшее чтение
- Родионов Д.А., Хеббелн П., Эудес А., тер Бик Дж., Родионова И.А., Эркенс Г.Б. и др. (Январь 2009 г.). «Новый класс модульных транспортеров витаминов в прокариотах» . Журнал бактериологии . 191 (1): 42–51. DOI : 10.1128 / JB.01208-08 . PMC 2612444 . PMID 18931129 .
- Камата Х, Акияма С., Моросава Х, Охта Т, Хамамото Т, Камбе Т и др. (Октябрь 1992 г.). «Первичная структура белка-носителя аланина термофильной бактерии PS3». Журнал биологической химии . 267 (30): 21650–5. PMID 1400476 .
На момент редактирования в этой статье используется контент из «2.A.25 The Alanine or Glycine: Cation Symporter (AGCS) Family» , который лицензирован способом, допускающим повторное использование в соответствии с непортированной лицензией Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 , но не под GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.