Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
AKR1C3
Белок AKR1C3 PDB 1ry0.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1RY0 , 1RY8 , 1S1P , 1S1R , 1S2A , 1S2C , 1XF0 , 1ZQ5 , 2F38 , 2FGB , 3R43 , 3R58 , 3R6I , 3R7M , 3R8G , 3R8H , 3R94 , 3UFY , 3UG8 , 3UGR , 4BSD , 4BD5 , 3UWE , 3UGR , 4BSD , 3UWE 4FA3 , 4FAL, 4FAM , 4H7C , 4HMN , 4WDT , 4WDU , 4WDW , 4WDX , 4WRH , 4XVD , 4XVE , 4ZFC , 4YVX , 4YVV

Идентификаторы
ПсевдонимыAKR1C3 , DD3, DDX, HA1753, HAKRB, HAKRe, HSD17B5, PGFS, hluPGFS, семейство альдокеторедуктаз 1, член C3, член семейства альдокеторедуктаз 1, член C3
Внешние идентификаторыOMIM : 603966 MGI : 2145420 HomoloGene : 128661 GeneCards : akr1c3
Номер ЕС1.3.1.20
Расположение гена ( человек )
Chr.Хромосома 10 (человека) [1]
Группа10п15.1Начинать5 035 354 п.н. [1]
Конец5 107 686 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Chr.Хромосома 13 (мышь) [2]
Группа13 | 13 A1Начинать4 132 615 п.н. [2]
Конец4 150 654 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК


Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность дельта4-3-оксостероид-5бета-редуктазы
• активность простагландин-F-синтазы
• активность транс-1,2-дигидробензол-1,2- диолдегидрогеназы
• альдит: активность НАДФ + 1-оксидоредуктазы
• активность ретинальной дегидрогеназы
• активность геранилгеранилредуктазы
• инданол активность дегидрогеназы
• активность альдокеторедуктазы (НАДФ)
• активность дигидротестостерон-17-бета-дегидрогеназы
• активность фенантрен 9,10-монооксигеназы
• активность кеторедуктазы
• активность оксидоредуктазы, действующая на НАД (Ф) Н, хинон или подобное соединение в качестве акцептора
• тестостерон - дегидрогеназа (НАД +) активность
• ретинол дегидрогеназа активности
• тестостерон 17-беты-дегидрогеназа (НАДФ +) активность
• оксидоредуктаза активность
• андростерон дегидрогеназы
• 15-hydroxyprostaglandin-D - дегидрогеназа (НАДФ +) активность
• кетостероида монооксигеназной активность
• НАДФ-ретинол дегидрогеназы активности
• активность простагландина D2 11-кеторедуктазы
• активность простагландин H2-эндопероксидазы редуктазы
• активность алкогольдегидрогеназы (НАДФ +)
• активность стероиддегидрогеназы
Сотовый компонент• цитоплазма
• цитозоль
• внутриклеточный
• внеклеточная экзосома
• ядро клетки
Биологический процесс• клеточный ответ на ион кальция
• отрицательная регуляция процесса биосинтеза ретиноевой кислоты
• процесс метаболизма простагландинов
• сигнальный путь рецептора, связанный с G-белком
• клеточный ответ на стимул жасмоновой кислоты
• процесс метаболизма стероидов
• положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B
• развитие мужских гонад
• положительное регулирование гибели клеток
• даунорубицин метаболического процесса
• доксорубицин метаболического процесса
• ответ на питательный
• регулирование ретиноевой кислоты сигнального пути рецептора
• метаболический процесс прогестерона
• клеточный ответ на голодание
• регуляция процесса биосинтеза тестостерона
• клеточный ответ на ион кадмия
• клеточный ответ на кортикостероидный стимул
• путь циклооксигеназы
• дифференцировка кератиноцитов
• метаболический процесс сетчатки
• ретиноидный метаболический процесс
• клеточный ответ на реактивные формы кислорода
• катаболический фарнезол процесс
• положительная регуляция процесса апоптоза эндотелиальных клеток
• положительная регуляция процесса метаболизма активных форм кислорода
• клеточный ответ на простагландин D стимул
• положительной регуляцию клеточной пролиферации
• окислительно-восстановительный процесс
• почек поглощения
• тестостерон биосинтетический процесс
• клеточный ответ на стимул простагландин
• ретинол процесс обмен вещества
• макромолекула процесс обмена веществ
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

8644

105349

Ансамбль

ENSG00000196139

ENSMUSG00000021214

UniProt

P42330

Q8K023

RefSeq (мРНК)

NM_003739
NM_001253908
NM_001253909

NM_134066
NM_001346535

RefSeq (белок)

NP_001240837
NP_001240838
NP_003730

NP_001333464
NP_598827

Расположение (UCSC)Chr 10: 5.04 - 5.11 МбChr 13: 4.13 - 4.15 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Альдо-кето - редуктазы семьи 1 член С3 ( akr1c3 ), также известный как 17β-гидроксистероиддегидрогеназы типа 5 ( 17b-HSD5 , HSD17B5 ) является одним из ключевых стероидогенных фермент , который у человека кодируется akr1c3 гена . [5] [6] [7]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует члена суперсемейства альдо / кеторедуктазы , которое состоит из более чем 40 известных ферментов и белков. Эти ферменты катализируют превращение альдегидов и кетонов в их соответствующие спирты за счет использования НАДН и / или НАДФН в качестве кофакторов. Ферменты демонстрируют перекрывающуюся, но отчетливую субстратную специфичность. Этот фермент катализирует восстановление простагландина D 2 , простагландина H 2 и фенантренхинона , а также окисление простагландина F 2α до простагландина D 2 . [7] Он также способен метаболизировать эстроген и прогестерон . [8]

AKR1C3 может играть важную роль в развитии аллергических заболеваний, таких как астма , а также может играть роль в контроле роста и / или дифференцировки клеток. Этот ген имеет высокую идентичность последовательности с тремя другими членами гена и сгруппирован с этими тремя генами на хромосоме 10p15-p14. [7]

Патология [ править ]

AKR1C3 сверхэкспрессируется при раке простаты (РПЖ) и связан с развитием устойчивого к кастрации рака простаты (CRPC). Кроме того, избыточная экспрессия AKR1C3 может служить многообещающим биомаркером прогрессирования рака простаты . [9]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196139 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021214 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Khanna M, Qin KN, Wang RW, Cheng KC (август 1995). «Субстратная специфичность, структура гена и тканеспецифическое распределение нескольких человеческих 3 альфа-гидроксистероид дегидрогеназ» . Журнал биологической химии . 270 (34): 20162–8. DOI : 10.1074 / jbc.270.34.20162 . PMID 7650035 . 
  6. ^ Матсуура К, Шираиши Н, Хара А, Сато К, Deyashiki Y, Ниномия М, Сакаи S (ноябрь 1998 г.). «Идентификация основных видов мРНК изоформы 3альфа-гидроксистероид дегидрогеназы человека (AKR1C3), которая проявляет высокую активность простагландин D2 11-кеторедуктазы». Журнал биохимии . 124 (5): 940–6. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022211 . PMID 9792917 . 
  7. ^ a b c «Ген Entrez: семейство 1 альдокеторедуктазы AKR1C3, член C3 (3-альфа-гидроксистероиддегидрогеназа, тип II)» .
  8. ^ Тайзен, Дж. Грэм; Сундарам, Виджи; Фильчак, Мэри С .; Chorich, Lynn P .; Салливан, Меган Э .; Рыцарь, Джеймс; Ким, Хён-Гу; Обыватель, Лоуренс К. (27 декабря 2019 г.). «Использование секвенирования всего экзома в когорте трансгендеров для выявления редких генетических вариантов» . Научные отчеты . 9 (1). Таблица 4. doi : 10.1038 / s41598-019-53500-y . PMID 31882810 . 
  9. ^ Тянь Y, Zhao L, Zhang H, Лю X, Zhao L, Zhao X, Li Y, Li J (2014). «Сверхэкспрессия AKR1C3 может служить многообещающим биомаркером прогрессирования рака простаты» . Диагностическая патология . 9 (1): 42. DOI : 10,1186 / 1746-1596-9-42 . PMC 3939640 . PMID 24571686 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Человек akr1c3 место генома и akr1c3 ген подробно страницу в браузере УСК генома .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Линь С.Х., Ши Р., Цю В., Аззи А., Чжу Д.В., Даббаг Х.А., Чжоу М. (март 2006 г.). «Структурная основа мультиспецифичности, продемонстрированной 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназой 1 и 5 типов». Молекулярная и клеточная эндокринология . 248 (1-2): 38–46. DOI : 10.1016 / j.mce.2005.11.035 . PMID  16480815 . S2CID  19087697 .
  • Ханна М., Цинь К.Н., Ченг К.С. (июнь 1995 г.). «Распределение 3 альфа-гидроксистероид дегидрогеназы в головном мозге крысы и молекулярное клонирование множества кДНК, кодирующих структурно родственные белки в организме человека». Журнал стероидной биохимии и молекулярной биологии . 53 (1–6): 41–6. DOI : 10.1016 / 0960-0760 (95) 00019-V . PMID  7626489 . S2CID  11316547 .
  • Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А., Сазука Т., Секи Н., Сато С., Табата С., Исикава К., Каварабаяси И., Котани Н. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . Исследования ДНК . 2 (1): 37–43. DOI : 10.1093 / dnares / 2.1.37 . PMID  7788527 .
  • Ханна М., Цинь К.Н., Клисак И., Белкин С., Спаркс Р.С., Ченг К.С. (январь 1995 г.). «Локализация нескольких генов дигидродиолдегидрогеназы человека (DDH1 и DDH2) и хлордеконредуктазы (CHDR) в хромосоме 10 с помощью полимеразной цепной реакции и флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика . 25 (2): 588–90. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80066-U . PMID  7789999 .
  • Цинь К.Н., Нью-Мичиган, Ченг К.С. (декабрь 1993 г.). «Молекулярное клонирование множества кДНК, кодирующих человеческие ферменты, структурно родственные 3 альфа-гидроксистероиддегидрогеназе». Журнал стероидной биохимии и молекулярной биологии . 46 (6): 673–9. DOI : 10.1016 / 0960-0760 (93) 90308-J . PMID  8274401 . S2CID  36210133 .
  • Беннетт М.Дж., Шлегель Б.П., Джез Дж.М., Пеннинг TM, Льюис М. (август 1996 г.). «Структура 3 альфа-гидроксистероид / дигидродиолдегидрогеназа в комплексе с НАДФ +». Биохимия . 35 (33): 10702–11. DOI : 10.1021 / bi9604688 . PMID  8718859 .
  • Lin HK, Jez JM, Schlegel BP, Peehl DM, Pachter JA, Penning TM (декабрь 1997 г.). «Экспрессия и характеристика рекомбинантной 3 альфа-гидроксистероид дегидрогеназы типа 2 (HSD) из предстательной железы человека: демонстрация бифункциональной активности 3 альфа / 17 бета-HSD и клеточного распределения». Молекулярная эндокринология . 11 (13): 1971–84. DOI : 10,1210 / me.11.13.1971 . PMID  9415401 .
  • Миллс К.И., Гилкс А.Ф., Суини М., Чоудри М.А., Вудгейт Л.Дж., Банс К.М., Браун Г., Бернетт А.К. (ноябрь 1998 г.). «Идентификация альдокеторедуктазы, чувствительной к ретиноевой кислоте, экспрессируемой в лейкемических клетках HL60» . Письма FEBS . 440 (1-2): 158–62. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (98) 01435-5 . PMID  9862446 . S2CID  21355070 .
  • Dufort I, Rheault P, Huang XF, Soucy P, Luu-The V (февраль 1999 г.). «Характеристики высоколабильной 17бета-гидроксистероид дегидрогеназы человека 5 типа» . Эндокринология . 140 (2): 568–74. DOI : 10.1210 / en.140.2.568 . PMID  9927279 .
  • Рео П., Дюфорт I, Суси П., Луу-В (1999). «Присвоение HSD17B5, кодирующего 17 бета-гидроксистероид дегидрогеназу 5 типа, полосам хромосомы 10p15 -> p14 мыши и области A2 хромосомы 13 мыши путем гибридизации in situ: идентификация новой синтенической взаимосвязи». Цитогенетика и клеточная генетика . 84 (3–4): 241–2. DOI : 10.1159 / 000015267 . PMID  10393440 . S2CID  5792836 .
  • Гриффин Л.Д., Меллон С.Х. (ноябрь 1999 г.). «Селективные ингибиторы обратного захвата серотонина напрямую изменяют активность нейростероидогенных ферментов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (23): 13512–7. DOI : 10.1073 / pnas.96.23.13512 . PMC  23979 . PMID  10557352 .
  • Судзуки-Ямамото Т., Нисидзава М., Фукуи М., Окуда-Ашитака Е., Накадзима Т., Ито С., Ватанабэ К. (декабрь 1999 г.). «Клонирование кДНК, экспрессия и характеристика простагландин-F-синтазы человека» . Письма FEBS . 462 (3): 335–40. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 01551-3 . PMID  10622721 . S2CID  19812463 .
  • Нисидзава М., Накадзима Т., Ясуда К., Канзаки Х., Сасагури Ю., Ватанабе К., Ито С. (февраль 2000 г.). «Тесное родство гена 20альфа-гидроксистероид дегидрогеназы человека с тремя генами альдокеторедуктазы» . Гены в клетки . 5 (2): 111–25. DOI : 10.1046 / j.1365-2443.2000.00310.x . PMID  10672042 . S2CID  25136637 .
  • Penning TM, Burczynski ME, Jez JM, Hung CF, Lin HK, Ma H, Moore M, Palackal N, Ratnam K (октябрь 2000 г.). «Человеческие изоформы 3альфа-гидроксистероиддегидрогеназы (AKR1C1-AKR1C4) суперсемейства альдокеторедуктаз: функциональная пластичность и распределение тканей выявляют роли в инактивации и образовании мужских и женских половых гормонов» . Биохимический журнал . 351 (Pt 1): 67–77. DOI : 10.1042 / bj3510067 . PMC  1221336 . PMID  10998348 .
  • Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC  310948 . PMID  11076863 .
  • Penning TM, Burczynski ME, Jez JM, Lin HK, Ma H, Moore M, Ratnam K, Palackal N (январь 2001 г.). «Структурно-функциональные аспекты и дизайн ингибитора 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназы 5 типа (AKR1C3)». Молекулярная и клеточная эндокринология . 171 (1–2): 137–49. DOI : 10.1016 / S0303-7207 (00) 00426-3 . PMID  11165022 . S2CID  11599113 .
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . EMBO Reports . 1 (3): 287–92. DOI : 10.1093 / embo-reports / kvd058 . PMC  1083732 . PMID  11256614 .


  • v
  • т
  • е